图。1 从:转录组和功能分析揭示了辣椒斑块病毒感染期间自噬的抗病毒作用 PMMOV感染在胡椒植物中引起的症状和使用MRNA分离的PMMoV接种和嘲弄辣椒植物的转录组分析。一种PMMov感染辣椒植物上的典型症状。在病毒或PB(模拟)接种后9天拍摄植物。收集标有红色箭头的叶子并用于RNA-SEQ。B.通过使用PMMOV CP基因特异性引物通过RT-PCR测定PMMOV或模拟接种植物中的PMMOV感染。泳道,trans2K DNA梯子(中国北京的Transgen Biotech)。可以从附加文件查看原始数据11.:图S4a。C在PMMOV-VS模拟辣椒植物中显示差异表达基因(DEGS)的火山曲线。红色和绿色分别代表明显上调的基因(FDR <0.05和log2(折叠变化)|≥1)。D.本研究中确定的上调(黑色)和下调(灰色)基因的总数。E.基于日志的DEGS分层聚类10.FPKM值。颜色刻度(蓝色至红色)代表基因表达强度(日志10.FPKM,低到高) 返回文章页面