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表1基于转录组数据鉴定的5791个ssr特征Elaeis guineensis

来自:利用转录组数据开发与油棕耐冷相关的基因SSR标记(Elaeis guineensis）

图案 重复的数字 总计 平均重复数 平均重复长度(bp)
5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 > 18
a / t - - - - - - - 398 272 232 193 147 83 65 310 1700 15.19 15.19
c / g - - - - - - - 10 8 5 0 2 4 0 12 41 15.85 15.85
tc / ga - - - 137 131 128 61 3. 0 0 0 0 0 0 0 460 9.26 18.52
ct / ag) - - - 205 152 127 59 1 0 0 0 0 0 0 1 545 12.79 25.58
在 - - - 14 10 5 5 0 0 0 0 0 0 0 0 34 9.03 18.06
标签ydF4y2Ba - - - 7 3. 8 1 0 0 0 0 0 0 0 0 19 9.16 18.32
ac / gt - - - 3. 5 4 2 2 0 0 0 0 0 0 0 16 9.69 19.38
ca / tg - - - 15 16 6 7 3. 0 0 0 0 0 0 0 47 9.21 18.42
cg - - - 0 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2 9 18
gc - - - 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 9 18
呕吐/ ctc 191 95 42 2 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 331 5.58 16.74
tgc甘氨胆酸/ 73 38 34 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 145 5.73 17.19
cag /玻纤 63 44 39 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 148 5.86 17.58
cgg / 20 127 66 34 7 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 234 9.22 27.66
亚美大陆煤层气有限公司/总部 74 36 22 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 133 5.62 16.86
ggt / acc 36 21 7 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 65 5.58 16.74
ggc / gcc 120 59 35 3. 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 217 5.66 16.98
手枪/ atc 25 17 3. 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 45 5.51 16.53
tct / aga 73 43 34 2 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 154 5.91 17.73
tga /柠檬酸 58 18 9 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 87 5.48 16.44
gtc gac / 19 6 4 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 31 5.81 17.43
移行细胞癌/ gga 151 69 39 3. 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 264 5.62 16.86
棉酚/ ttc 86 27 19 4 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 136 5.57 16.71
有条件现金援助/ gg 122 69 38 5 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 234 5.69 17.07
丙氨酸/ aat 10 10 2 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23 5.74 17.22
aac / gtt 7 4 0 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13 5.77 17.31
公司治理文化/ gcg 61 39 22 3. 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 126 5.77 17.31
ttg /创新艺人经纪公司 12 11 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25 5．6 16．8
agc / gct 40 23 31 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 96 5.95 17.85
atg /猫 24 10 10 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 45 5.73 17.19
tta / taa 13 5 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20. 5.45 16.35
cac / gtg 52 9 15 3. 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 79 5.61 16.83
tgg / cca 61 25 13 3. 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 102 5.59 16.77
ata /答 8 1 3. 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12 5.58 16.74
aca / tgt 7 3. 2 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13 5.77 17.31
注册会计师/ tcg 13 7 3. 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25 5.76 17.28
资本利得/ acg 7 4 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12 5.67 17.01
标签 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 5 15
侠盗猎车手/ tac 2 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4 6 18
agt 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 5 15
四, 60 12 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 73 5.23 20.92
五 20. 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21 5.05 25.25
六- - - - - - 8 1 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 11 6 36
总计 1625 774 464 433 323 280 137 418 282 237 193 149 87 65 324 5791 9.21 16.86
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BMC植物生物学

ISSN: 1471 - 2229

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