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表2各两两差异表达分析的比较样本信息一个

来自:野生型无融合子模型的比较转录组分析Hieracium praealtum和它的损失的孤雌生殖垂下的)突变体

DE分析(比较) 加入 组织类型 A组 B组 基因靶向 包含DE结果的附加文件
发展 示例代码 发展 示例代码
1 R35 胚珠 成熟胚囊 Wt_E 自发的胚胎发生 Wt_L 与R35早期种子自主发育相关 额外的文件2
2 R35 胚珠和卵巢 成熟胚囊 Wt_E和Ovary_5 早到晚的胚胎 Ovary_8, Ovary_9和Ovary_10 R35与胚和胚乳成熟有关 额外的文件3.
3. lop138 胚珠 成熟胚囊 lop_E 早到晚的胚胎 lop_L 与授粉诱导的胚胎发育有关的 额外的文件4
4 R35和lop138 胚珠 成熟胚囊 Wt_E 成熟胚囊 Lop_E 孤雌生殖能力与孤雌生殖能力的差异(lop138 额外的文件5
R35和lop138 胚珠 成熟胚囊 Wt_E 早到晚的胚胎 Lop_L
R35和lop138 胚珠 自发的胚胎发生 Wt_L 成熟胚囊 Lop_E
R35和lop138 胚珠 自发的胚胎发生 Wt_L 早到晚的胚胎 Lop_L
lop138和A36 胚珠 成熟胚囊 Lop_E 早到晚的胚胎 Pol_L
lop138和A36 胚珠 早到晚的胚胎 Lop_L 早到晚的胚胎 Pol_L
  1. 一个将A组与B组进行对比,使用DEseq (Anders and Huber 2010) R Bioconductor包检测每个转录本的差异表达