DE分析(比较) |
加入 |
组织类型 |
A组 |
B组 |
基因靶向 |
包含DE结果的附加文件 |
发展 |
示例代码 |
发展 |
示例代码 |
1 |
R35 |
胚珠 |
成熟胚囊 |
Wt_E |
自发的胚胎发生 |
Wt_L |
与R35早期种子自主发育相关 |
额外的文件2 |
2 |
R35 |
胚珠和卵巢 |
成熟胚囊 |
Wt_E和Ovary_5 |
早到晚的胚胎 |
Ovary_8, Ovary_9和Ovary_10 |
R35与胚和胚乳成熟有关 |
额外的文件3. |
3. |
lop138 |
胚珠 |
成熟胚囊 |
lop_E |
早到晚的胚胎 |
lop_L |
与授粉诱导的胚胎发育有关的 |
额外的文件4 |
4 |
R35和lop138 |
胚珠 |
成熟胚囊 |
Wt_E |
成熟胚囊 |
Lop_E |
孤雌生殖能力与孤雌生殖能力的差异(lop138) |
额外的文件5 |
R35和lop138 |
胚珠 |
成熟胚囊 |
Wt_E |
早到晚的胚胎 |
Lop_L |
R35和lop138 |
胚珠 |
自发的胚胎发生 |
Wt_L |
成熟胚囊 |
Lop_E |
R35和lop138 |
胚珠 |
自发的胚胎发生 |
Wt_L |
早到晚的胚胎 |
Lop_L |
lop138和A36 |
胚珠 |
成熟胚囊 |
Lop_E |
早到晚的胚胎 |
Pol_L |
lop138和A36 |
胚珠 |
早到晚的胚胎 |
Lop_L |
早到晚的胚胎 |
Pol_L |
- 一个将A组与B组进行对比,使用DEseq (Anders and Huber 2010) R Bioconductor包检测每个转录本的差异表达