跳转到主要内容
图5 BMC植物生物学

图5

来自:海松发育胚转录组的综合组装与分析

图5

k -表示差异表达的转录本的聚类p .松树胚胎发育。根据转录本的表达谱,将转录本聚在一起,每一聚类都代表一个有代表性的平均表达谱(虚线)。根据胚胎发育阶段的表达高峰,将产生的12个k-means聚类进一步分为4组(A ~ D)。插图显示了在来自不同集群(和组)的转录本中发现的过度代表的过程和功能。一个簇K1、K2、K3、K9,随发育呈逐渐降低的表达。细胞碳水化合物代谢、单糖运输、碳水化合物代谢、甾醇代谢、细胞壁组织或生物发生、外包覆结构组织、细胞壁大分子代谢、DNA依赖的DNA复制、生物调控、有机循环化合物代谢、细胞芳香族化合物代谢,细胞成分组织或生物发生,细胞周期,发育过程,茎系统发育,多细胞生物过程,有丝分裂细胞周期过程,甲基化,细胞增殖,微管基础过程。b群聚K6、K8、K10、K12,在第11天和/或第15天达到表达高峰。甾体脱氢酶活性,作用于供体CH-CH基团,3-氧-5-甾体4-脱氢酶活性,脱落酸分解代谢,种子从休眠中释放。c聚类K4、K5,表达在第5天达到峰值。没有GO-terms。d群集K7, K11,随着发育表达增加。养分储层活性,碳氧裂解酶活性,对磷酸盐的作用,碳氧裂解酶活性,α -双代苯合成酶活性,萜烯合成酶活性

返回文章页面