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表1莱茵科22种植物叶绿体全基因组汇总

来自:22种石蒜科植物叶绿体基因组的比较分析:桃金娘属植物系统发育关系和基因组进化的推论

L.excelsa L.limii L.villosa L.siamica L.tomentosa L.venusta L.calyculata L.fauriei L.floribunda L.guilinensis
加入数量 MK881635 MK881627 MK881633 MK881628 MK881632 MK881630 MK881636 NC_029808 NC_031825 NC_029885
家庭 千屈菜科 千屈菜科 千屈菜科 千屈菜科 千屈菜科 千屈菜科 千屈菜科 千屈菜科 千屈菜科 千屈菜科
总长度(bp) 152214年 152153年 160769年 152519年 152294年 152521年 152294年 152440年 152240年 152193年
GC (%) 37.6 37.58 36.97 37.58 37.65 37.57 37.65 37.61 37.72 37.62
LSC
长度(bp) 84053年 83954年 88702年 84166年 84013年 84194年 84012年 83926年 83967年 83817年
GC (%) 35.94 35.92 34.69 35.89 35.98 35.87 35.97 35.94 36.1 35.95
长度(%) 55.2 55.2 55.2 55.2 55.2 55.2 55.2 55.1 55.2 55.1
SSC
长度(bp) 16917年 16905年 18255年 16865年 16917年 16833年 16798年 16934年 16787年 16909年
GC (%) 31.03 30.96 30.78 30.95 31.03 30.97 31.17 30.92 31.23 30.97
长度(%) 11．1 11．1 11．4 11．1 11．1 11．0 11．0 11．1 11．0 11．1
红外
长度(bp) 25622年 25647年 26906年 25744年 25622年 25747年 25742年 25790年 25788年 25794年
GC (%) 42.49 42.47 42.83 42.51 42.49 42.51 42.51 42.51 42.48 42.47
长度(%) 16．8 16.9 16．7 16.9 16．8 16.9 16.9 16.9 16.9 16.9
l .籼 L.speciosa L.subcostata L.intermedia D.grandiflora T.natans L.salicaria L.intermis P.granatum W.fruticosa R.rotundifolia H.myrtifolia
NC_030484 NC_031414 NC_034952 NC_034662 MK881638 MK881634 MK881629 MK881631 NC_035240 MK881637 MK881626 MG921615
千屈菜科 千屈菜科 千屈菜科 千屈菜科 千屈菜科 千屈菜科 千屈菜科 千屈菜科 千屈菜科 千屈菜科 千屈菜科 千屈菜科
152205年 152476年 152049年 152330年 156084年 155555年 158483年 157756年 158639年 159380年 157753年 159219年
37.59 37.58 37.59 37.59 37.49 36.41 36.81 36.89 36.92 36.63 36.89 37.00
LSC
84046年 84051年 83890年 83987年 86471年 88506年 88999年 88424年 89022年 89569年 88422年 88571年
35.93 35.89 35.92 35.92 35.59 34.19 34.75 34.76 34.89 34.53 34.76 35.00
55.2 55.1 55.2 55.1 55.4 56.9 56.2 56.1 56.1 56.2 56.1 55.6
SSC
16915年 16886年 16909年 16871年 16501年 18274年 18530年 17386年 18685年 18697年 17386年 18822年
30.98 30.97 30.97 30.93 31.28 30.18 30.68 31.01 30.63 30.23 31.01 30.60
11.1 11．0 11．1 11．1 10．6 11.7 11.7 11．0 11.8 11.7 11．0 11.8
红外
25622年 25817年 25625年 25736年 26556年 24388年 25477年 25973年 25466年 25557年 25973年 25643年
42.5 42.51 42.5 42.51 42.5 42.77 42.63 42.5 42.78 42.65 42.5 42.60
16.8 16.9 16.9 16.9 17.0 15.7 16．1 16．5 16．1 16．0 16．5 16．1
  1. GCguanine-cytosine,LSC大单副本区域,SSC短单副本区域,国税局反向重复
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BMC植物生物学

ISSN: 1471 - 2229

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