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图6 | BMC Plant Biology

图6

来自:大豆木瓜样半胱氨酸蛋白酶的全基因组调查及其在根瘤共生中的表达分析

图6

系统发育及表达分析GmPLCPs一个系统发育分析GmPLCPs.系统发育树的构建GmPLCPs采用RAxML、MEGA version 6.0和MrBayes 3.2程序,基于推导的全长氨基酸序列。树分为9个主要的系统发育类(1 ~ 9类),树的阴影不同。b表达分析GmPLCPsPhytozome数据库中五个与rns相关的组织。的表达式值GmPLCPs在Phytozome数据库和R中的pheatmap包中生成Heatmap。这些组织包括结节(1),根毛(2),根(3),结节。共生。条件(4)和根。共生。(5)条件。cRNA-seq分析鉴定的97GmPLCPs在五个不同的大豆结节中。我们之前的RNA-Seq数据[18]和R中的pheatmap包被用来制作这个Heatmap。这5个结核样品包括分枝期(6个)、开花期(7个)、结果期(8个)、荚果期(9个)和收获期(10个)的结核,这5个重要的发育阶段在我们之前的研究中都有描述[18

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