图3

胡萝卜、咖啡和葡萄基因组的物种和基因系统发育树。胡萝卜(D)、咖啡(C)和葡萄(V)的系统发育树:ECH用蓝色闪电表示，两个胡萝卜古四倍体化事件用红色闪电表示。b基因系统发育:葡萄和咖啡基因组中的三个副同源基因分别是V1、V2、V3和ECH产生的C1、C2、C3，胡萝卜基因组中每一个都有四个同源基因和八个异同源基因。例如，V1在胡萝卜中有四个直系基因D11、D12、D13、D14和八个直系基因D21、D22、D23、D24、D31、D32、D33、D34。该种树是根据我们目前对同源基因的分析而产生的