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表2 illumina测序和de novo转录组概述

从:细胞质雄性无菌系中差异表达基因的转录组分析及其在鸽豌豆中的生育恢复系(Cajanus Cajan.L.)

读取处理
akcms11(两个重复) AKPR303(两个重复) 全部的
原始读物 109,600,365 72,575,988 182,176,353
清洁读取(修剪后) 101,676,579 69,481,226 171,157,805
平均读取长度(BP) 100. 100. ˗
三位一体的De Novo集会
转录物数量(n) 1,98,587
 Percentage GC 41.14
 Contig N10 (bp) 3148.
 Contig N20 (bp) 2300
 Contig N30 (bp) 1788
 Contig N40 (bp) 1375.
 Contig N50 (bp) 1009.
 L50 value 6.
 Median contig length 357.
 Average length 641.34
 Total assembled bases 127,362,415
unigenes.
 Total number of unigenes (n) 1,71,095
 Average length (bp) 561.66
 N50 length (bp) 757.
 Total assembled bases 97,193,132