| Solyc08g083360.2 |
PNSB3 |
AT3G16250 |
-1.23 |
叶绿体亚复合体b3的光合NDH亚基 |
NDH将电子从NAD(P)H:质体醌传递到光合链中的醌;将氧化还原反应与质子易位相结合 |
光合电子传递减少 |
钱海峰，等。“PGR5和NDH途径在光合循环电子转移中对干扰光系统的除草剂亚致死处理有不同的反应。”农业化学学报62.18(2014):4083-4089。 |
| Solyc01g087690.1 |
SIGD |
AT5G13730 |
-1.06 |
RNA聚合酶sigma因子sigD，叶绿体 |
促进质体编码RNA聚合酶的附着;调节ndhF基因的转录 |
对光刺激的反应减弱;减少转录;RNA生物合成的调节降低 |
Lerbs-Mache,席尔瓦。“高等植物质体西格玛因子的功能:基因表达的调节或仅仅是转录的保存?”植物分子生物学73.5 -5(2011):235-249。 |
| Solyc02g085950.2 |
RBCS3B |
AT5G38410 |
-1.03 |
二磷酸核酮糖羧化酶小链 |
RuBisCO催化两个反应:d -核酮糖1,5-二磷酸的羧化以及戊糖底物的氧化破碎;两种反应在同一活性部位同时发生并相互竞争 |
Decarbon固定;叶绿体二磷酸核酮糖羧化酶复合物组装减少;光呼吸和光合作用减弱;对蓝光和红光的反应减弱 |
Menges, Margit等人。“拟南芥细胞周期调控基因表达。”生物化学杂志277.44(2002):41987-42002。 |
| Solyc12g036170.1 |
PNSB4 |
AT1G18730 |
-1.03 |
叶绿体亚复合体b4的光合NDH亚基 |
NDH将电子从NAD(P)H:质体醌传递到光合链中的醌;将氧化还原反应与质子易位相结合 |
光合电子传递减少 |
钱海峰，等。“PGR5和NDH途径在光合循环电子转移中对干扰光系统的除草剂亚致死处理有不同的反应。”农业化学学报62.18(2014):4083-4089。 |
| Solyc11g006020.1 |
ndhO |
AT1G74880 |
-0.93 |
NAD(P) h -醌氧化还原酶亚基O，叶绿体 |
NDH将电子从NAD(P)H:质体醌传递到光合链中的醌;将氧化还原反应与质子易位相结合 |
NADH脱氢酶复合物组装减少;减少了光合作用 |
石川，纪子，远藤刚和佐藤文彦。叶绿体NAD (P) H脱氢酶受损的拟南芥突变体的电子传递活性植物科学研究(2008):521-526。 |
| Solyc02g066920.2 |
CRR7 |
AT5G39210 |
-0.84 |
7、叶绿体 |
光合电子传递链的叶绿体NAD(P)H脱氢酶复合物的形成和活性所必需的;NDH亚复合物A积累所需;参与亚复合物A生物发生的翻译后步骤 |
NAD(P)H脱氢酶复合物组装减少 |
Kamruzzaman Munshi, M, Yoshichika Kobayashi和Toshiharu Shikanai。拟南芥叶绿体NAD (P) H脱氢酶复合物稳定所需的一种新蛋白质CRR7的鉴定。植物学报44.6(2005):1036-1044。 |
| Solyc04g082930.1 |
LHCB7 |
AT1G76570 |
-0.82 |
叶绿素a-b结合蛋白7，叶绿体 |
捕获并传递激发能量;在非光化学猝灭中耗散能量;对初级光化学有贡献 |
光系统I的光合作用和光收集减少;蛋白质-发色团链接受损;对蓝光和远红光的反应减弱 |
彼得森，理查德·B和尼尔·p·舒尔特。“捕光复合体B7改变了拟南芥叶片光合捕光调节的辐照度响应。”植物生理学报171.3-4(2014):311-318。 |
| Solyc10g077040.1 |
CRD1 |
AT3G56940 |
-0.80 |
镁原卟啉单甲基酯环化酶 |
催化叶绿素生物合成中等环的形成;介导环化酶反应 |
叶绿素生物合成减少;叶绿体组织减少;光合作用下降;四吡咯代谢过程调节降低 |
托特，斯蒂芬等人。拟南芥CHL27位于包膜和类囊体膜中，是合成原叶绿素所必需的。美国科学院学报100.26(2003):16119-16124。 |
| Solyc06g048410.2 |
FSD1 |
AT4G25100 |
-0.79 |
铁超氧化物歧化酶[Fe] 1，叶绿体 |
分解超氧阴离子自由基 |
对镉胁迫的反应减弱;对铜离子的反应降低;对光强度的反应减弱;降低对氧化应激和臭氧的反应 |
郭，W. Y.，等。伴侣蛋白20介导铁超氧化物歧化酶(Fe SOD)活性，独立于其在拟南芥叶绿体中的协同伴侣蛋白作用。新植物学家197.1(2013):99-110。 |
| Solyc02g080540.1 |
ATPC1 |
AT4G04640 |
-0.74 |
ATP合酶γ链，叶绿体 |
在膜上存在质子梯度时，由ADP产生ATP |
ATP生物合成降低;降低ATP合成耦合质子传输;光系统II中光合电子传递的减少 |
Dal Bosco, Cristina，等。拟南芥叶绿体ATP合成酶γ亚基失活导致高非光化学荧光猝灭和核基因表达改变。生物化学杂志279.2(2004):1060-1069。 |
| Solyc03g097320.2 |
SIGA |
AT1G64860 |
-0.72 |
RNA聚合酶因子sigA |
至关重要的蛋白质;控制psaA基因的转录，从而调节光系统化学计量学;维持和谐的电子流和光合效率 |
对光刺激的反应减弱;细胞对氧化还原状态的反应减弱;dna模板转录降低;光系统化学计量调节受损;RNA生物合成的调节降低 |
哈基米，穆罕默德-阿里等人。“植物和细菌之间主要sigma70型转录因子c端结构域的进化保护。”生物化学杂志275.13(2000):9215-9221。 |
| Solyc07g032640.1 |
PSBO1 |
AT5G66570 |
-0.66 |
促氧蛋白1-1，叶绿体 |
稳定锰团簇，锰团簇是水分解的主要部位 |
降低对细菌的防御反应;减少光抑制;光合作用下降;减少光系统II的装配和稳定性;蛋白质去磷酸化的调节降低 |
村上玲子等。“psbO受损的拟南芥突变体的特征，psbO是光系统II中编码外源性33-kDa蛋白的两个基因之一。”FEBS通讯523.1-3(2002):138-142。 |
| Solyc03g120430.2 |
GLYK |
AT1G80380 |
-0.66 |
d -甘油酸3-激酶，叶绿体 |
光合作用C3循环不可或缺的辅助代谢途径，使陆生植物能在含氧大气中生长 |
氧化光合碳途径受损;减少光呼吸 |
博尔特，拉尔夫等人。d -甘油酸3-激酶，拟南芥光呼吸循环中最后一种未知酶，属于一个新的激酶家族。植物细胞17.8(2005):2413-2420。 |
| Solyc08g080050.2 |
PGRL1A |
AT4G22890 |
-0.64 |
PGR5蛋白1A，叶绿体 |
铁氧氧化酶-质体醌还原酶参与光系统I的循环电子流 |
光合作用下降;光系统I的光合电子传递减少 |
DalCorso, Giovanni，等。“在拟南芥中，含有PGRL1和PGR5的复合物参与了线性电子流和循环电子流之间的切换。”Cell 132.2(2008): 273-285。 |
| Solyc10g007690.2 |
LHCA3 |
AT1G61520 |
-0.62 |
光系统I叶绿素a/b结合蛋白3-1，叶绿体 |
光收集复合体的功能是光受体;捕获并传递激发能量到与其密切相关的光系统 |
光合作用下降;蛋白质-发色团链接受损;对寒冷和光照压力的反应减弱 |
Ganeteg, Ulrika等人。“利用反义抑制在体内研究了叶绿素a/b结合蛋白Lhca2和Lhca3的性质。”植物生理学(2001):150-158。 |
| Solyc01g005520.2 |
MET1 |
AT1G55480 |
-0.62 |
蛋白质MET1，叶绿体 |
参与光系统II超复合体的形成和修复 |
减少了光合作用 |
石川，Atsushi，等。拟南芥中编码PDZ、K-Box和TPR基序蛋白的ZKT基因的分子特征生物科学，生物技术和生物化学69.5(2005):972-978。 |
| Solyc04g064670.2 |
PPD4 |
AT1G77090 |
-0.62 |
含psbP结构域的蛋白4，叶绿体 |
参与光合作用 |
减少了光合作用 |
Dal Bosco, Cristina，等。拟南芥叶绿体ATP合成酶γ亚基失活导致高非光化学荧光猝灭和核基因表达改变。生物化学杂志279.2(2004):1060-1069。 |
| Solyc05g026550.2 |
ndhL |
AT1G70760 |
-0.60 |
NAD(P) h -醌氧化还原酶亚基L，叶绿体 |
NDH将电子从NAD(P)H:质体醌传递到光合链中的醌;将氧化还原反应与质子易位相结合 |
NADH脱氢酶复合物(质体醌)组装减少;光系统I的光合电子传递减少 |
Thieme, Christoph J.，等。“内源性拟南芥信使rna被运送到远处的组织。”自然植物1.4(2015):15025。 |
| Solyc11g008620.1 |
PGLP1B |
AT5G36790 |
-0.56 |
磷酸乙醇酸磷酸酶1B，叶绿体 |
RuBisCO氧化反应产生的2-磷酸乙醇酸去磷酸化的光呼吸酶 |
降低脱磷酸作用;减少光呼吸 |
Reiland, Sonja，等。“大规模拟南芥磷蛋白组分析揭示了新的叶绿体激酶底物和磷酸化网络。”植物生理学150.2(2009):889-903。 |
| Solyc04g057980.2 |
ndhH |
ATCG01110 |
-0.56 |
NAD(P)H-醌氧化还原酶亚单位H，叶绿体 |
NDH将电子从NAD(P)H:质体醌传递到光合链中的醌;将氧化还原反应与质子易位相结合 |
光合作用下降;对光反应减弱 |
Lerbs-Mache,席尔瓦。“高等植物质体西格玛因子的功能:基因表达的调节或仅仅是转录的保存?”植物分子生物学73.5 -5(2011):235-249。 |
| Solyc02g091560.2 |
SHM1 |
AT4G37930 |
-0.53 |
丝氨酸羟甲基转移酶1，线粒体 |
在光呼吸途径中催化丝氨酸和甘氨酸的相互转化;参与控制非生物胁迫引起的细胞损伤;调节敏感的防御反应 |
对四氢叶酸的反应降低;l -丝氨酸代谢降低;单碳代谢降低;减少光呼吸;过敏反应降低;对镉、冷、热和光的应激反应减弱 |
莫雷诺，胡安·伊格纳西奥等。拟南芥SHMT1，一种在光呼吸途径中起作用的丝氨酸羟甲基转移酶，影响对生物和非生物胁迫的抗性。植物学报41.3(2005):451-463。 |
| Solyc05g052600.2 |
N/A |
AT3G55800 |
-0.50 |
sedoheptulose-1 7-bisphosphatase,叶绿素 |
参与果糖1,6-二磷酸代谢 |
降低对细菌的防御反应;减少糖质新生;还原戊糖-磷酸循环受损;减少了光合作用 |
Kiddle, Guy等人。“叶片抗坏血酸含量对拟南芥防御和光合作用基因表达的影响”抗氧化剂和氧化还原信号5.1(2003):23-32。 |
| Solyc01g107660.2 |
SEP1 |
AT4G34190 |
-0.47 |
应激增强蛋白1 |
参与非光化学猝灭;在类囊体膜中发挥作用，对光胁迫作出反应 |
对强光的反应减弱;光合作用下降;对伤害的反应降低 |
Maejima, Kensaku等。拟南芥中E类mads结构域转录因子被一种植物质效应物phyllogen降解。植物信号与行为10.8 (2015):e1042635。 |
| Solyc10g080080.1 |
NTRC |
AT2G41680 |
-0.46 |
nadph依赖性硫氧还蛋白还原酶 |
质体2-Cys过氧还蛋白的电子给体;叶绿素生物合成和光合装置的生物发生所必需的;通过氧化还原活化adp -葡萄糖焦磷酸化酶调节淀粉生物合成 |
细胞氧化还原稳态受损;过氧化氢分解代谢过程降低;叶绿素生物合成调控减弱;淀粉生物合成调节降低;超氧自由基的去除减少 |
Moon, Jeong Chan，等。“c型拟南芥硫氧还蛋白还原酶ANTR-C作为叶绿体中2-Cys过氧还蛋白的电子供体。”生化和生物物理研究通讯348.2(2006):478-484。 |
| Solyc02g072140.1 |
GIL1 |
AT5G58960 |
-0.44 |
光中的蛋白质向地性 |
必需的红色和远红光诱导和光敏色素介导的负向性放松导致下胚轴生长方向的随机化 |
向地性受损;对红光或远红光的反应减弱 |
Allen, Trudie等。“光敏色素介导的拟南芥下胚轴的嗜耕性需要GIL1，并赋予适应性优势。”植物学报46.4(2006):641-648。 |
| Solyc11g008990.1 |
VIPP1 |
AT1G65260 |
-0.36 |
膜相关蛋白VIPP1，叶绿体 |
质体囊泡形成和类囊体膜生物发生所必需 |
类囊体膜组织减少;囊泡组织减少 |
Kroll, Daniela，等。VIPP1，拟南芥类囊体膜形成所必需的核基因。国家科学院学报98.7(2001):4238-4242。 |
| Solyc05g014310.2 |
HHL1 |
AT1G67700 |
-0.34 |
HHL1蛋白，叶绿体 |
参与光保护;与LQY1形成复合体，参与PSII-LHCII超复合体在强光条件下的修复和重组周期 |
对轻度压力的反应增强 |
金，红雷，等。“在拟南芥中，对高光敏感的1与PHOTOSYSTEM II1的低量子产量相互作用，并在保护PHOTOSYSTEM II免受光损伤中起作用。”植物细胞26.3(2014):1213-1229。 |
| Solyc05g050680.1 |
CKB4 |
AT2G44680 |
0.28 |
酪蛋白激酶II亚基β -4 |
调节α亚基的基础催化活性;参与蛋白酶体依赖性PIF1降解和促进光形态建成;参与翻译起始的规定 |
改善昼夜节律;改善光周期，增加花期 |
丹尼斯，迈克尔·D和凯伦·s·布朗宁。拟南芥CK2全酶对植物翻译起始因子的差异磷酸化生物化学学报284.31(2009):20602-20614。 |
| Solyc02g091410.2 |
DEGP7 |
AT3G03380 |
0.29 |
蛋白酶Do 7 |
丝氨酸蛋白酶 |
增加光抑制 |
孙旭武，等。拟南芥基质叶绿体Deg7蛋白酶参与光抑制后光系统II的修复。植物生理学152.3(2010):1263-1273。 |
| Solyc05g055470.2 |
NAC078 |
AT5G04410 |
0.29 |
NAC结构域蛋白78 |
跨膜蛋白水解激活转录;诱导类黄酮的生物合成，是花青素积累的必要条件，以应对高光胁迫 |
增加转录;增加类黄酮生物合成的调节;增强对高光强的反应 |
Morishita, Teruyuki等。“拟南芥NAC转录因子ANAC078在强光下调节类黄酮生物合成。”植物与细胞生理学50.12(2009):2210-2222。 |
| Solyc08g076100.2 |
BZIP16 |
AT2G35530 |
0.33 |
bZIP转录因子 |
转录激活剂;G-box和G-box样基序是定义在某些植物基因启动子中的顺式作用元件 |
增加转录;增加细胞间信号;提高光合作用;促进植物生长 |
沈怀顺，等。“AtbZIP16和AtbZIP68是gbf的两个新成员，它们可以与拟南芥中的其他G族bzip相互作用。”BMB报告41.2(2008):132-138。 |
| Solyc11g017300.1 |
CSN5A |
AT1G22920 |
0.33 |
COP9信号体复合亚基5a |
参与光形态建成和对茉莉酸盐的反应;泛素偶联途径的基本调控因子;参与黑暗中光形态建成的抑制;PSIAA6降解所需 |
减少光形态发生;细胞周转增加;蛋白质去内分泌化增加;增加红光光转导;增强防御反应;对生长素的反应增加;花器官发育增加 |
郭成富等。“拟南芥c-Jun共激活子的同源物既以单体形式存在，也以COP9复合体形式存在，它们的丰度受到多效cop/det/fus突变的差异影响。”植物细胞10.11(1998):1779-1790。 |
| Solyc08g007270.2 |
HAT4 |
AT4G16780 |
0.34 |
同源亮氨酸拉链蛋白HAT4 |
细胞伸长和特异性细胞增殖过程的负调节因子;光胁迫下红光反应的中介;负调控它自己的表达 |
增加侧根形成;增加红光光转导;对生长素的反应增加;对细胞分裂素的反应增加;增加二次增厚;增加避阴 |
Schena, Mark, Alan M. Lloyd和Ronald W. Davis。“拟南芥的HAT4基因编码一种发育调节因子。”基因与发育7.3(1993):367-379。 |
| Solyc04g082810.2 |
AHL27 |
AT1G20900 |
0.35 |
AT-hook motif核定位蛋白 |
通过下调pamp触发的FRK1表达负向调节对病原体的先天免疫;调节开花和下胚轴伸长;染色质重塑因子负向调控叶片衰老 |
染色质组织增加;增加花的发育;先天免疫反应受损;叶片衰老加剧;增加光形态发生;分生组织的营养向生殖阶段转变增加 |
林平玉等。“染色质结构控制AT-hook蛋白的过表达延长了叶片寿命，增加了植物收获后的贮藏寿命。”植物学报52.6(2007):1140-1153。 |
| Solyc12g026400.1 |
DEGP9 |
AT5G40200 |
0.41 |
蛋白酶Do 9 |
降解双组分响应调节因子ARR4的丝氨酸蛋白酶;作用于ARR4的上游，调节细胞分裂素和光信号通路中ARR4的活性;调节光和细胞分裂素信号之间的串扰 |
提高光合作用 |
Chi, Wei，等。DEG9是一种丝氨酸蛋白酶，通过调节拟南芥响应调节因子4的水平来调节细胞分裂素和光信号。美国国家科学院学报113.25 (2016):E3568-E3576。 |
