| Solyc06g073260.2 |
CSP41B |
AT1G09340 |
-0.81 |
叶绿体茎环结合蛋白41kda b，叶绿体 |
与叶绿体中的前核糖体颗粒结合，参与叶绿体核糖体RNA代谢;叶绿体完整和胚胎发育所必需的;调节昼夜系统;调节杂多糖和单糖的动员 |
叶绿体组织受损;昼夜节律受损;降低对细菌和伤害的防御反应;半乳糖分解代谢降低;单糖代谢降低;转录和翻译下降;对寒冷和干旱的反应减弱;rRNA加工减少 |
Raab, Sabine，等。“aba应答rna结合蛋白参与拟南芥幼苗的叶绿体和stromule功能。”植物学报224.4(2006):900-914。 |
| Solyc11g042940.1 |
XK1 |
AT2G21370 |
-0.53 |
d -核酮糖激酶前体 |
能低效率磷酸化d -核酮糖吗 |
减少磷酸化 |
谢，袁，等。“长联球菌PCC 7942和拟南芥糖激酶的晶体结构”PloS one 11.5 (2016): e0156067。 |
| Solyc02g069010.2 |
IMPL1 |
AT1G31190 |
-0.39 |
磷酸酶IMPL1，叶绿体 |
优先作用于d -肌醇1-磷酸的磷酸酶 |
肌醇生物合成降低;信号转导减弱 |
Torabinejad, Javad等。“VTC4是一种双功能酶，影响植物中的肌醇和抗坏血酸的生物合成。”植物生理学150.2(2009):951-961。 |
| Solyc04g080860.1 |
LON2 |
AT5G47040 |
-0.37 |
Lon蛋白酶2 |
介导过氧化物酶体基质中错误折叠和未组装多肽的选择性降解;2型过氧化物酶体靶向包含信号的蛋白质处理所必需的 |
侧根发育减少;蛋白质转运减少;减少蛋白质加工;错误折叠或不完全合成的蛋白质降低了蛋白质质量控制;蛋白质靶向过氧化物酶体减少 |
林加德，马修·J·和邦妮·巴特尔。“拟南芥LON2对于过氧化物酶体功能和持续的基质蛋白输入是必要的。”植物生理学151.3(2009):1354-1365。 |
| Solyc05g006990.2 |
NPF4.6 |
AT1G69850 |
-0.29 |
蛋白质NRT1/ PTR FAMILY 4.6 |
低亲和质子依赖性硝酸盐转运蛋白;参与本构硝酸盐摄取;参与(+)-脱落酸(ABA)转运;调节细胞摄取ABA |
脱落酸转运减少;硝酸盐同化降低;气孔运动调节减少;对线虫的反应降低 |
黄年陈，等。“拟南芥硝酸盐转运蛋白基因的克隆和功能表征，该基因编码低亲和力摄取的组成部分。”植物细胞11.8(1999):1381-1392。 |
| Solyc01g109520.2 |
RABG3F |
AT3G18820 |
０．２５ |
ras相关蛋白RABG3f |
从前舱贩运必不可少;植物生长所必需的;参与核心逆转录酶成分到核内体膜的募集 |
细胞内蛋白转运增加;增加晚期核内体向液泡的转运;Rab蛋白信号转导增强;液泡组织增加 |
Zelazny, Enric，等人。“拟南芥中核心逆转录物的内体膜募集机制。”生物化学学报288.13(2013):8815-8825。 |
| Solyc09g074680.2 |
CUL1 |
AT4G02570 |
０．２５ |
cullin-1 |
参与泛素化和随后的蛋白酶体降解;配子体发生和胚胎发生中有丝分裂过程的调控因子;参与花器官发育的;参与生长素信号转导;调节对茉莉酸盐的反应;参与光敏色素A光信号;参与叶片衰老 |
生长素激活信号通路增加;增加细胞循环;增加胚胎发育;增加茉莉酸介导的信号;韧皮部或木质部组织发生增加;蛋白质泛素化增加;昼夜节律紊乱;对茉莉酸的反应增强;增加蛋白质分解代谢 |
冯素华，等。“拟南芥CAND1是一种未修饰的cul1相互作用蛋白，参与由泛素/蛋白酶体介导的蛋白质降解控制的多种发育途径。”植物细胞16.7(2004):1870-1882。 |
| Solyc03g034200.2 |
RCF3 |
AT5G53060 |
0.26 |
rna结合KH结构域含蛋白RCF3 |
渗透胁迫诱导基因表达的负调控因子;调节热应激下的耐热性反应;与CPL1形成复合物，调节共转录过程;抑制应激诱导基因表达;参与初级miRNA加工和前miRNA生物发生;参与ja介导的真菌防御 |
增加热适应;增加茉莉酸介导的信号;mRNA加工增加;miRNA加工增加;增加对真菌的防御反应的调节;增加基因表达的调节;增加对渗透胁迫的反应;增加RNA剪接 |
熊黎明，等。“hos5 -拟南芥渗透胁迫诱导基因表达的负调节因子。”植物学报19.5(1999):569-578。 |
| Solyc12g095990.1 |
TIF4A-2 |
AT1G54270 |
0.26 |
真核起始因子4A-2 |
参与帽蛋白识别的eIF4F复合体亚基;mRNA与核糖体结合所必需的;解开mrna的5'-UTR中的RNA二级结构;有效结合小核糖体亚基所必需的 |
细胞质翻译起始增加;增加对镉离子的反应 |
Vergnolle, Chantal等人。“低温诱导的磷脂酶C和D途径的早期激活决定了拟南芥细胞悬液中两个不同基因簇的反应。”植物生理学(2005):1217-1233。 |
| Solyc12g089150.1 |
SYP61 |
AT1G28490 |
0.26 |
突触融合蛋白- 61 |
在分泌途径中起作用的囊泡运输蛋白;参与渗透胁迫耐受性和脱落酸调控气孔反应 |
脱落酸激活信号增强;高尔基囊泡运输增加;细胞内蛋白转运增加;增加囊泡对接和融合 |
Shahriari, Mojgan等人。“aaa型atp酶AtSKD1有助于拟南芥液泡的维持。”植物学报(2010):71-85。 |
| Solyc05g055600.2 |
VPS33 |
AT3G54860 |
0.27 |
液泡蛋白分类相关蛋白33同源物 |
参与调节液泡体和前腔室的膜融合 |
胞吐过程中囊泡对接增加 |
Rojo, Enrique，等。“AtC-VPS蛋白复合物定位于拟南芥的液泡体和前泡室。”细胞分子生物学14.2(2003):361-369。 |
| Solyc08g065890.2 |
EPSIN1 |
AT5G11710 |
0.28 |
网格蛋白相互作用子epsin1 |
在通过网格蛋白包被的囊泡从trans-Golgi网络到核内体的运输中起作用;刺激网格蛋白组装;在跨高尔基网络的可溶性货物蛋白的液泡运输中起作用 |
增加蛋白靶向液泡 |
宋振熙，等。“拟南芥EPSIN1通过与网格蛋白、AP-1、VTI11和VSR1相互作用，在植物细胞中可溶性负载蛋白的液泡运输中发挥重要作用。”植物细胞18.9(2006):2258-2274。 |
| Solyc01g096290.2 |
RPL40A |
AT2G36170 |
0.28 |
泛素- 60s核糖体蛋白L40 |
通过蛋白酶体参与蛋白质降解;在细胞信号传导过程中，引发剂Met-lead通过附着形成线性聚合物链 |
增加修饰依赖的蛋白质分解代谢;蛋白质泛素化增加;增加翻译;增强对细菌的防御反应 |
Ditt, Renata F.，等。拟南芥转录组对农杆菌的反应分子植物-微生物相互作用19.6(2006):665-681。 |
| Solyc08g007360.2 |
MAG5 |
AT5G47480 |
0.28 |
蛋白转运蛋白SEC16A同源物 |
需要有效的蛋白质从内质网输出到高尔基体;在ER出口部位作为COPII涂层组装的支架和调节器 |
COPII囊泡涂层增加;内质网组织增加;增加蛋白质运输 |
Takagi, Junpei，等。“MAIGO5在拟南芥高尔基相关内质网出口位点的蛋白质输出中起作用。”植物细胞25.11(2013):4658-4675。 |
| Solyc04g082560.2 |
ITSN2 |
N/A |
0.29 |
intersectin-2 |
在内吞膜运输和肌动蛋白组装机制之间提供间接链接的连接蛋白;调节网格蛋白包被囊泡的形成;参与整合素-1的内吞作用 |
内吞作用增加;树突延长增加;Rho蛋白信号转导调控增强;病毒过程增加 |
Mettlen, Marcel，等人。“内吞辅助蛋白在功能上是由它们对网格蛋白包被的凹坑成熟的不同影响来区分的。”细胞分子生物学20.14(2009):3251-3260。 |
| Solyc03g034180.2 |
GRF2 |
AT1G78300 |
0.31 |
14-3-3样蛋白GF14欧米茄 |
与与G盒结合的DNA结合复合物有关 |
增加油菜素类固醇介导的信号 |
DeLille, Justin M.，等。“拟南芥14-3-3信号调节家族。”植物生理学126.1(2001):35-38。 |
| Solyc05g053830.2 |
N/A |
AT4G14160 |
0.31 |
蛋白转运蛋白SEC23 |
促进内质网运输囊泡的形成 |
增加了copii涂层囊泡货物装载量;细胞内蛋白质运输增加 |
De Craene, Johan-Owen等人。“利用酵母酵母突变体的功能互补研究植物COPII囊泡外衣亚基。”PLoS One 9.2 (2014): e90072。 |
| Solyc01g104970.2 |
BAK1 |
AT4G33430 |
0.31 |
油菜素类固醇不敏感1相关受体激酶1 |
参与油菜素类固醇对细菌/真菌/卵菌的信号响应;调节程序性细胞死亡 |
油菜素类固醇介导的信号通路增加;程序性细胞死亡增加;增强对细菌/真菌/卵菌的防御反应 |
李，贾，等。BAK1是一种拟南芥LRR受体样蛋白激酶，与BRI1相互作用并调节油菜素类固醇信号。Cell 110.2(2002): 213-222。 |
| Solyc11g013260.1 |
PHB3 |
AT5G40770 |
0.32 |
prohibitin-3,线粒体 |
参与稳定新合成线粒体蛋白的hold酶/unfoldase;线粒体和细胞代谢和生物发生所必需的;需要调节乙烯介导的信号;参与生长维持;在一氧化氮介导反应中的作用 |
细胞周转增加;增强对细菌的防御反应;增加侧根发育;线粒体组织增加;对生长素、乙烯和一氧化氮的反应增加;增加盐胁迫;增加水杨酸的生物合成 |
基督徒Matthew J.等人。“在拟南芥幼苗中，AtPHB3抑制剂的突变缺失导致极端的本构乙烯反应表型，并伴有乙烯诱导基因表达的部分缺失。”实验植物学杂志58.8(2007):2237-2248。 |
| Solyc09g061340.1 |
PCMP-E76 |
AT2G13600 |
0.33 |
含五肽重复蛋白At2g13600 |
参与糖代谢过程中线粒体mRNA的修饰 |
线粒体mRNA修饰增加;增加RNA修饰;增加糖介导的信号通路;增加糖代谢 |
朱，强，等。SLO2是一种影响多个RNA编辑位点的线粒体五肽重复蛋白，是能量代谢所必需的。植物学报(2012):836-849。 |
| Solyc08g076100.2 |
BZIP16 |
AT2G35530 |
0.33 |
bZIP转录因子 |
转录激活剂;G-box和G-box样基序是定义在某些植物基因启动子中的顺式作用元件，受光诱导或激素控制等不同刺激的调控 |
增加转录;增加细胞间信号;提高光合作用;促进植物生长 |
沈怀顺，等。“AtbZIP16和AtbZIP68是gbf的两个新成员，它们可以与拟南芥中的其他G族bzip相互作用。”BMB报告41.2(2008):132-138。 |
| Solyc11g010950.1 |
ELP4 |
AT3G11220 |
0.33 |
拉长复合蛋白4 |
RNA聚合酶II伸长子复合物的组分;通过调节细胞分裂率促进器官发育;管制产生碳或进口蔗糖的机制;参与种子萌发过程中脱落酸信号的抑制;生长素分布或信号传导所必需的;防止花青素积累 |
对蔗糖的反应增强;花青素代谢降低;细胞周转增加;生长素介导的信号通路增加;加强碳利用监管;增加叶片发育的调节;增强对氧化应激的反应;增加tRNA摆动尿苷修饰 |
Nelissen, Hilde，等人。“拉长体突变体在植物中发现了一种功能细长复合体，在器官生长过程中对细胞增殖起作用。”美国国家科学院学报102.21(2005):7754-7759。 |
| Solyc11g033270.1 |
M3KE1 |
AT3G13530 |
0.34 |
MAP3K, epsilon蛋白激酶 |
丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶参与皮层活动的时空组织;花粉发育过程中质膜正常功能所必需的;参与调节细胞扩张、细胞伸长和胚胎发育 |
细胞分裂增加;加强对胚胎发育的调节;增加细胞生长的调节;通过蛋白质磷酸化增加信号转导 |
Seguí-Simarro, José M.等。在胁迫诱导的甘蓝型油菜小孢子胚胎发生过程中，丝裂原激活蛋白激酶受到发育调控。组织化学与细胞生物学123.4-5(2005):541-551。 |
| Solyc01g096350.2 |
CRK3 |
AT2G46700 |
0.34 |
cdpk相关激酶3 |
在包括钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用;磷酸化组蛋白H3和GLN1-1的丝氨酸/苏氨酸激酶 |
对脱落酸刺激的反应增强;细胞内信号转导增加;叶片衰老加剧;多肽丝氨酸磷酸化增加 |
杜，魏，等。拟南芥钙依赖性蛋白激酶相关激酶的生化和表达分析。植物科学学报(自然科学版)28(2):344 - 344。 |
| Solyc05g052510.2 |
CHC1 |
AT3G11130 |
0.34 |
网格蛋白重链1 |
网格蛋白是包衣坑和囊泡多面体外壳的主要蛋白质;调节内吞作用，是PIN生长素转运蛋白正确的极性分布所必需的 |
网格蛋白依赖性内吞作用增加;细胞内蛋白转运增加;受体介导的内吞作用增加;气孔运动增加 |
Kitakura, Saeko，等。“网格蛋白介导拟南芥中PIN生长素转运蛋白的内吞作用和极性分布。”植物细胞23.5(2011):1920-1931。 |
| Solyc02g030210.2 |
N/A |
AT2G41710 |
0.36 |
AP2乙烯响应转录因子At2g41710 |
作为转录激活剂;与GCC-box致病相关启动子元件结合;参与胁迫因子和胁迫信号转导通路组分对基因表达的调控 |
增加乙烯激活信号通路;增加生殖组织的生长/发育 |
Seki, Motoaki，等。拟南芥cDNA全长集的功能注释。科学通报(2002):341 - 341。 |
| Solyc02g069310.2 |
NPR3 |
AT5G45110 |
0.36 |
调节蛋白NPR3 |
E3泛素-蛋白连接酶复合物的底物特异性适配器;介导蛋白质泛素化和随后的蛋白酶体降解;调节对病原体的基础防御反应 |
增强对细菌和真菌的防御反应;蛋白质泛素化增加;增加茉莉酸介导的信号;增加全身获得性耐药性 |
张跃林，等。“拟南芥中两个NPR1谬误基因对防御反应的负调控。”植物学报48.5(2006):647-656。 |
| Solyc05g021100.2 |
SWAP70 |
AT2G30880 |
0.36 |
开关相关蛋白70 |
参与细胞内信号转导的;调节对细菌的防御反应 |
增强对细菌的防御反应;细胞内信号转导增加 |
Van Leeuwen, Wessel等人。"学习植物信号传递的脂质语言"植物科学趋势9.8(2004):378-384。 |
| Solyc01g089900.2 |
ALG12 |
AT1G02145 |
0.39 |
dol-P-Man:男人(7)GlcNAc (2) -PP-Dol alpha -, 6-mannosyltransferase |
n -链低聚糖组装所需;将第8甘露糖残基以α -1,6连接添加到dolichl - pp -寡糖前体dolichl - pp - man7glcnac2上 |
多黎糖链低聚糖生物合成增加;n链糖基化增加;增加ERAD信号 |
Hong, Zhi，等。“α 1,6甘露糖基转移酶的突变抑制了拟南芥中缺陷油菜素类固醇受体的内质网相关降解。”植物细胞21.12(2009):3792-3802。 |
| Solyc10g074570.1 |
CPK4 |
AT4G09570 |
0.39 |
钙依赖性蛋白激酶 |
在包括钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用;钙介导脱落酸信号通路的调节因子 |
细胞内信号转导增加;多肽丝氨酸磷酸化增加;脱落酸激活信号增强;蛋白质自磷酸化增加 |
罗德里格斯·米拉，米格尔·A，等。“一种新的酵母双杂交方法来鉴定CDPK底物:AtCPK11和AtDi19(一种核锌指蛋白1)之间相互作用的特征。”FEBS快报580.3(2006):904-911。 |
| Solyc12g099010.1 |
GFS12 |
AT5G18525 |
0.40 |
蛋白质GFS12 |
BCHC1的主要作用是抑制BCHC1, BCHC1本身是蛋白质储存、液泡运输调节和植物效应物触发免疫的负面因子 |
增强对细菌的防御反应;增加蛋白靶向液泡 |
Teh, Ooi-kock，等等。“在拟南芥中，beach结构域蛋白以级联方式共同介导液泡蛋白转运和抗病性。”分子植物8.3(2015):389-398。 |
| Solyc08g005270.2 |
RCD1 |
AT1G32230 |
0.41 |
非活性聚[adp -核糖]聚合酶RCD1 |
调节发育期间的激素反应;胚胎发生、营养和生殖发育以及非生物应激反应所必需的 |
增强对细菌的防御反应;增加胚胎发育;增加乙烯激活信号通路;增加茉莉酸介导的信号;侧根形态发生增加;增加一氧化氮生物合成;程序性细胞死亡增加;增加对干旱、渗透、臭氧和氧化物胁迫的反应 |
Ahlfors, Reetta等人。拟南芥自由基诱导的细胞死亡1属于WWE蛋白-蛋白相互作用结构域蛋白家族，并调节脱落酸、乙烯和茉莉酸甲酯反应。植物细胞16.7(2004):1925-1937。 |
| Solyc03g025940.1 |
N/A |
AT3G48880 |
0.42 |
盒/ LRR-repeat蛋白质 |
参与对革兰氏阴性细菌的内源性信使反应 |
增加RNA信号;增强对革兰氏阴性细菌的防御反应 |
Thieme, Christoph J.，等。“内源性拟南芥信使rna被运送到远处的组织。”自然植物1.4(2015):15025。 |
| Solyc06g083510.2 |
PBL25 |
AT3G24790 |
0.44 |
丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶PBL25 |
参与发芽和植物防御过程中的蛋白质磷酸化信号 |
增强防御反应;蛋白质磷酸化增加;增加繁殖 |
王，易，等。“转录组分析显示，拟南芥的花粉萌发和花粉管生长伴随着基因表达的变化。”植物生理学148.3(2008):1201-1211。 |
| Solyc01g100720.2 |
IMPA4 |
AT1G09270 |
0.45 |
输入蛋白亚基α -4 |
介导核蛋白穿过核膜输入;农杆菌virD2蛋白核导入的细胞受体 |
增强对肿瘤、结节或生长共生体的防御反应;nls蛋白向细胞核转运增加;增加共生细胞内运输 |
Bhattacharjee, Saikat等人。“IMPa-4，一种拟南芥输入素α亚型，优先参与农杆菌介导的植物转化。”植物细胞20.10(2008):2661-2680。 |
| Solyc10g085000.1 |
BSK5 |
AT5G59010 |
0.55 |
丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶BSK5 |
油菜素类固醇信号正调控因子;参与非生物耐受力;脱落酸介导的干旱和盐胁迫反应所必需的 |
增加油菜素类固醇介导的信号;对脱落酸的反应增加;增强对寒冷的反应;增加对盐胁迫的反应 |
唐文强，等。“bsk在拟南芥中介导受体激酶BRI1的信号转导。”科学(2008):557-560。 |
| Solyc09g008460.2 |
RABC2A |
AT5G03530 |
0.60 |
ras相关蛋白RABC2a |
参与细胞内囊泡运输和蛋白质运输 |
细胞内蛋白转运增加;增强Rab蛋白信号转导 |
Hashimoto, Kohsuke等。实验植物学杂志59.13(2008):3523-3531。 |
| Solyc05g012210.2 |
AFP3 |
AT3G29575 |
0.76 |
忍者家族蛋白AFP3 |
作为脱落酸反应和应激反应的负调节因子 |
减少转录;增强信号转导 |
de Torres-Zabala, Marta等人。“丁香假单胞菌pv。番茄会劫持拟南芥脱落酸信号通路，从而引发疾病。”EMBO期刊26.5(2007):1434-1443。 |
