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表3两个群体中穗育性相关性状的稳定和主要QTL

来自:双倍单倍体小麦穗育性及相关性状的QTL定位(小麦L人口)。

特征一个 QTL 流行b Envc 最亲密的标志 距离(厘米) IWGSC Ref Seq v1.0 (Mb) LOD 添加d R2
SL QSL.perg-2B BP11xB2002 蓝色的 wsnp_Ex_rep_c70228_69172301 77.6 389.5 4.80 -3.2 16.4%
E1 RAC875_c27297_2153 78.6 385.2 3.62 -3.8 11.9%
E2 RAC875_c27297_2153 78.6 385.2 5.12 -3.1 16.6%
QSL.perg-5A B19xB2002 E5 BS00022003_51 41.2 444.8 2.84 -2.0 8.4%
E2 wsnp_Ex_c19647_28632894 44.2 470.0 3.68 -2.4 11.6%
E3 Kukri_rep_c72046_78 48.8 512.2 7.99 -4.0 24.0%
蓝色的 Kukri_rep_c72046_78 48.8 512.2 9.56 -3.4 27.8%
E1 BS00022818_51 49.3 524.2 4.50 -3.9 14.9%
QSL.perg-7A BP11xB2002 E3 Tdurum_contig16244_105 36.1 68.9 6.57 -3.7 17.0%
蓝色的 wsnp_Ku_c57198_60433631 42.2 78.4 3.99 -2.7 12.4%
E2 wsnp_Ra_rep_c69620_67130107 45.1 85.6 2.92 -2.2 8.5%
E1 wsnp_Ra_rep_c69620_67130107 46.1 85.6 3.41 -4.3 14.5%
TS QTS.perg-2D BP11xB2002 E3 Tdurum_contig17626_210 60.5 571.5 5.02 -0.9 24.1%
E2 Tdurum_contig17626_210 65.5 571.5 4.43 -0.8 17.0%
蓝色的 Tdurum_contig17626_210 68.1 571.5 8.32 -0.8 21.0%
E1 RAC875_c11093_174 82.4 590.1 10.12 -1.0 24.8%
QTS.perg-3A B19xB2002 E5 RAC875_c77648_367 3.4 12.2 5.99 -1.0 15.7%
蓝色的 Excalibur_c62042_175 5.4 13.9 5.79 -0.7 17.2%
E1 Kukri_rep_c75764_60 8.1 20.1 5.02 -0.8 20.6%
QTS.perg-7A BP11xB2002 蓝色的 Ku_c68368_1724 138.1 701.6 3.82 -0.5 8.2%
E1 wsnp_Ku_c16022_24798741 143.2 725.9 3.02 -0.5 5.7%
B19xB2002 E3 IAAV6957 90.5 675.2 5.96 -0.6 19.8%
CN QCN.perg-2A BP11xB2002 E3 BS00091763_51 83.0 773.2 3.82 -0.13 14.0%
B19xB2002 E1 BobWhite_c17113_240 81.1 751.6 3.06 -0.13 10.8%
蓝色的 Excalibur_c35919_107 83.7 754.5 5.07 -0.15 16.9%
E5 wsnp_Ex_c2137_4014287 86.6 755.9 4.88 -0.20 15.1%
QCN.perg-5A BP11xB2002 E2 wsnp_Ex_c24215_33462239 57.1 526.6 9.44 -0.16 31.2%
蓝色的 wsnp_Ex_c24215_33462239 57.1 526.6 9.46 -0.16 26.5%
B19xB2002 E3 Kukri_rep_c72046_78 48.8 512.2 5.48 -0.13 19.6%
FF QFF.perg-2B BP11xB2002 E3 JD_c10643_840 89.6 683.2 4.85 -3.75 14.8%
B19xB2002 E3 Tdurum_contig12879_1200 64.2 712.6 7.85 -3.81 30.7%
E2 Kukri_rep_c68903_301 65.1 730.2 7.15 -3.32 32.7%
蓝色的 Kukri_rep_c68903_301 65.7 730.2 8.67 -2.66 32.7%
QFF.perg-7B B19xB2002 蓝色的 Kukri_c51101_351 61.2 630.1 5.12 1.73 15.7%
E3 Tdurum_contig47633_304 65.2 659.7 3.00 2.07 10.0%
E1 Tdurum_contig4658_106 71.7 680.2 4.56 3.61 17.2%
FS QFS.perg-2B BP11xB2002 E3 BS00064318_51 86.8 686.0 8.01 -0.78 20.2%
B19xB2002 E3 Tdurum_contig12879_1200 64.2 712.6 3.28 -0.43 11.0%
E2 RAC875_c81984_707 64.6 719.8 4.57 -0.52 16.8%
蓝色的 RAC875_c81984_707 64.6 719.8 4.64 -0.44 15.5%
QFS.perg-3A B19xB2002 E3 Excalibur_c62042_175 5.4 13.9 3.28 -0.41 11.6%
E2 Kukri_rep_c75764_60 8.1 20.1 2.83 -0.36 9.8%
E1 BS00049032_51 10.6 25.9 5.37 -0.78 23.1%
QFS.perg-5B BP11xB2002 E2 RFL_Contig5461_683 48.7 580.4 8.67 -0.88 32.1%
蓝色的 RFL_Contig5461_683 48.7 580.4 4.36 -0.46 10.9%
B19xB2002 E2 Vrn-B1: Excalibur_c5329_1335 65.3 580.7 4.17 -0.47 14.3%
fft算法 QFFTS.perg-5A BP11xB2002 E3 wsnp_Ex_c24215_33462239 57.1 526.6 3.25 0.11 10.1%
B19xB2002 E3 wsnp_CAP11_c1740_947838 51.3 536.7 4.17 0.10 17.4%
E1 RAC875_rep_c107228_92 70.5 567.7 3.12 0.13 14.3%
蓝色的 RAC875_rep_c107228_92 70.5 567.7 3.24 0.09 13.1%
QFFTS.perg-5B BP11xB2002 E2 wsnp_Ku_c35090_44349517 9.3 34.3 5.68 0.09 18.0%
E1 Kukri_rep_c71114_838 12.9 70.3 3.93 0.14 12.6%
蓝色的 Kukri_rep_c71114_838 12.9 70.3 8.53 0.15 30.2%
E3 Ex_c68034_498 15.0 21.5 6.06 0.16 20.8%
FFFS QFFFS.perg-7B B19xB2002 蓝色的 BS00063208_51 61.7 637.6 5.69 0.09 19.2%
E3 Kukri_c100592_82 62.7 648.1 4.41 0.10 16.3%
E1 RAC875_c60191_114 71.7 697.1 5.06 0.15 21.8%
R QR.perg-2A BP11xB2002 E1 wsnp_CAP8_c1580_908907 19.6 33.3 8.51 8.0 27.1%
蓝色的 wsnp_CAP8_c1580_908907 19.6 33.3 5.91 4.2 14.5%
B19xB2002 E5 Kukri_c17467_2711 0.0 4.7 2.54 3.3 5.3%
QR.perg-3B BP11xB2002 E2 Jagger_c522_55 66.2 730.2 5.21 4.4 16.4%
E3 Kukri_rep_c94476_152 77.7 745.7 3.12 9.5 22.6%
E4 CAP12_c2348_133 86.1 732.4 4.62 4.4 16.1%
蓝色的 Excalibur_c18410_136 89.3 752.1 7.65 5.2 21.1%
QR.perg-6A BP11xB2002 E3 Tdurum_contig100733_89 33.7 22.0 4.91 -8.4 19.1%
蓝色的 RFL_Contig2954_548 69.5 23.9 4.19 -3.0 7.4%
B19xB2002 E1 BobWhite_c3714_659 1.8 8.0 2.66 -5.6 11.0%
蓝色的 BS00083630_51 0.0 5.6 7.02 -5.5 26.9%
GLPA QGLPA.perg-1A B19xB2002 蓝色的 wsnp_Ex_c4310_7770452 144.4 464.3 10.85 -27年 32.7%
E1 RAC875_c53185_802 148.4 480.5 5.84 -30 21.3%
E4 RAC875_c53185_802 148.4 480.5 5.70 -33年 21.9%
QGLPA.perg-3A B19xB2002 蓝色的 Excalibur_c46600_919 44.9 648.0 2.54 -11年 5.9%
E1 Kukri_c18420_705 51.2 663.2 3.13 -19年 9.1%
E5 Tdurum_contig15928_135 75.0 709.1 3.98 -24年 11.0%
QGLPA.perg-5B BP11xB2002 蓝色的 RAC875_c60758_623 64.3 597.2 5.11 18 13.2%
E3 BS00037023_51 72.3 654.5 3.15 41 14.6%
B19xB2002 E5 Tdurum_contig13773_321 69.4 595.7 6.51 36 24.4%
QGLPA.perg-7A BP11xB2002 蓝色的 Kukri_c64330_58 33.3 62.9 3.02 -13年 7.3%
E3 Tdurum_contig82510_556 37.5 76.9 2.95 -33年 10.0%
B19xB2002 E1 IACX17522 34.8 57.9 3.73 -25年 11.2%
CH QCH.perg-1A B19xB2002 蓝色的 wsnp_Ex_c4310_7770452 144.2 464.3 9.55 -29年 29.40%
E4 RAC875_c53185_802 148.4 480.5 5.21 -37年 20.9%
E1 BS00023126_51 157.4 480.6 5.15 -36年 22.0%
QCH.perg-2B BP11xB2002 E1 wsnp_Ra_c4126_7552133 84.0 409.3 5.98 -35年 25.0%
E3 Kukri_rep_c91092_553 84.8 442.3 3.83 -48年 13.7%
B19xB2002 E3 wsnp_Ex_rep_c104478_89183627 57.1 447.8 2.82 -35年 10.0%
GN QGN.perg-5A B19xB2002 E2 BS00083507_51 42.2 461.5 4.56 1.8 14.6%
E5 BS00083507_51 42.2 461.5 3.89 2.3 14.5%
蓝色的 Ex_c19057_965 44.7 473.6 5.00 1.8 17.5%
吉瓦 QGW.perg-5A BP11xB2002 E3 Tdurum_contig67291_367 78.1 573.8 5.59 3.0 20.1%
蓝色的 Tdurum_contig67291_367 78.1 573.8 3.12 1.2 8.1%
B19xB2002 E3 BS00032146_51 79.8 615.2 3.36 1.5 12.8%
QGW.perg-6B B19xB2002 E4 Kukri_rep_c117390_70 43.4 127.6 7.13 -1.7 21.6%
E2 Kukri_c38398_164 45.5 135.1 5.15 -1.6 14.0%
蓝色的 Kukri_c38398_164 45.5 135.1 5.73 -1.8 18.2%
  1. 一个SL穗长(毫米)TS每穗总小穗(n°穗−1),CN穗的紧实度(mm节点)−1),FF每穗可育小花(n°穗−1),FS每穗可育小穗(n°穗−1),fft算法每总小穗的可育小花(n°小穗−1),FFFS每可育小穗的可育小花(n°小穗−1),R脊柱(mg飙升−1),GLPA颖片+外稃+外稃+芒(mg穗−1),CH谷壳(收获时无粒穗干重mg穗−1),GN粒数(n°穗)−1),吉瓦粒重(毫克)
  2. b种群BP11xB2002, Baguette Premium 11 × BioINTA 2002;B19xB2002, Baguette 19 × BioINTA 2002
  3. c环境E1: Pergamino 2012, E2: Pergamino 2013, E3: Pergamino 2015, E4: Marcos Juárez 2015, E5: Pergamino 2016, BLUE
  4. d附加效应:父母的等位基因对较大值的贡献。加性效应的正值表明Baguette等位基因增加了相应的性状。负的加性效应表明BioINTA2002等位基因增加了相应的性状