图6

低亲和和高亲和硝酸盐转运体的分子系统发育分析c .藜麦．硝酸转运蛋白同源物核苷酸编码序列的系统发育优化树c .藜麦， Chenopodiaceae的另外两种(美国oleracea和b .寻常的),答:芥．利用基于Tamura-Nei模型的最大似然法推断了其进化历史。在低亲和转运蛋白(LAT)同源物的系统发育分析(一个)，则显示具有最高log likelihood(−21,210.48)的树。在高亲和转运蛋白(HATs)的系统发育分析中(b)，则显示具有最高log likelihood(−29,578.42)的树。关联类群聚集在一起的树的百分比显示在树枝旁边。利用最大复合似然法(Maximum Composite Likelihood, MCL)估计的成对距离矩阵，利用Neighbor-Joining和BioNJ算法自动获得启发式搜索的初始树，然后选择具有较优对数似然值的拓扑。离散伽玛分布被用来模拟不同地点的进化率差异。树是按比例绘制的，分枝长度是用每个位点替换的数量来衡量的。分析涉及23 (一个)及40 (b)核苷酸序列。所有现场覆盖率小于95%的岗位被淘汰。每个序列的登录号都有标注。本研究中以基因表达为特征的基因同源物包含在盒子中。在MEGA7中进行进化分析