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图1 |BMC植物生物学

图1

从:咖啡中非种族特异性抗病抗性1(NDR1)原始蛋白质的鉴定与表征

图1

对于NDR1蛋白的两个咖啡候选者属于NHL家族。推定拟南芥通过用作两个推导的咖啡氨基酸序列,通过喷射算法鉴定CANCR1A / B蛋白的直脑。检索到的序列使用群集X程序的2.0.10对齐[59.然后,在BoxShade服务器上在线处理结果对齐(http://www.ch.embnet.org/software/box_form.html.)。提出了包含三个NHL主题的保守区域。图案的位置用红线和数字表示。ASterik显示了两种咖啡蛋白(F69L)之间取代的氨基酸残基的位置。全长序列对齐可以在附加文件中找到1。加入编码基因的数量拟南芥蛋白质如下:NDR1 [AGI:AT3G20600];NHL1 [AGI:AT3G11660];NHL2 [AGI:AT3G11650];NHL5 [AGI:AT1G61760];NHL6,[AGI:AT1G65690];NHL11 [AGI:AT2G35970];NHL12 [AGI:AT2G35960;NHL16 [AGI:AT3G20610];NHL18 [AGI:AT3G52470];NHL21 [AGI:AT4G05220]; NHL22 [AGI:At4g09590]; NHL23 [AGI:At5g06330]; NHL26 [AGI:At5g53730]; NHL38 [AGI:At3g20590]; unknown, [AGI:At5g05657]. The accession number of the尼古利亚娜塔瓦姆Hin1编码序列是Genbank:AB091429.1。

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