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表7性状抽穗日期的GWAS结果

来自:世界范围春大麦农艺性状的全基因组关联研究

单核苷酸多态性 空空的 位置 假定值 log10 (P) R2(%) 效果 QTL 参考QTL 文学
SNP111 1 h 128.14 0.19 0.0032 2.49 0.63 -2.51 QTL1_HD HvFT3 61
SNP119 1 h 138.92 0.23 0.0198 1.70 0.33
SNP129 2 h 27.29 0.37 0.0099 2.00 0.38
SNP130 2 h 28.44 0.36 0.0080 2.10 0.39 -1.29 QTL2_HD PpdH1 62
SNP133 2 h 31.02 0.38 0.0280 1.55 0.39 61
SNP135 2 h 33.73 0.10 0.0262 1.58 0.51
SNP142 2 h 41.66 0.27 0.0096 2.02 0.40
SNP148 2 h 53.53 0.34 0.0043 2.37 0.47 -1.37 QTL3_HD
SNP170 2 h 63.53 0.32 0.0007 3.10 0.88
SNP174 2 h 63.53 0.41 0.0011 2.96 0.68
SNP177 2 h 63.53 0.32 0.0013 2.89 0.55 QTL4_HD HvFT4 / eam6 616364
SNP173 2 h 63.53 0.33 0.0033 2.48 0.53
SNP183 2 h 66.83 0.44 0.0265 1.58 0.39 -2.32
SNP191 2 h 71.12 0.44 0.0043 1.0061 0.0012
SNP196 2 h 73.04 0.10 0.0061 2.21 0.65 QTL5_HD eps2 62
SNP199 2 h 73.75 0.14 0.0012 2.92 0.49 2.53
SNP242 2 h 115.78 0.39 0.0207 1.68 0.54 -1.98 QTL6_HD
SNP284 3 h 8.23 0.24 0.0111 1.95 0.42 -1.45 QTL7_HD
SNP340 3 h 59.89 0.35 0.0047 2.33 0.38 1.80 QTL8_HD HvGI 61
SNP520 4 h 82.42 0.32 0.0198 1.70 0.47 -1.15 QTL9_HD
SNP543 4 h 123.29 0.26 0.0024 2.62 0.67 -1.59 QTL10_HD
SNP559 5 h 39.97 0.46 0.0146 1.84 0.32 -1.20 QTL11_HD HvCO3 65
SNP630 5 h 100.28 0.20 0.0203 1.69 0.58
SNP635 5 h 102.06 0.13 0.0278 1.56 0.34 -2.02 QTL12_HD
SNP636 5 h 103.92 0.28 0.0278 1.56 0.35
SNP639 5 h 108.18 0.38 0.0236 1.63 0.53
SNP728 6小时 28.39 0.43 0.0132 1.88 0.28 -1.43 QTL13_HD
SNP778 6小时 60.23 0.49 0.0306 1.51 0.37 -2.15 QTL14_HD
SNP829 6小时 124.85 0.33 0.0281 1.55 0.37 1.52 QTL15_HD
SNP854 7小时 37.55 0.36 0.0060 2.22 0.57 2.50 QTL16_HD HvFT1 6163
SNP855 7小时 38.32 0.35 0.0009 3.01 0.54
SNP875 7小时 68.46 0.06 0.0180 1.74 0.48 -2.33 QTL17_HD
SNP908 7小时 84.92 0.35 0.0266 1.58 0.37 1.66 QTL18_HD HvCO1 6165
SNP921 7小时 104.78 0.35 0.0131 1.88 0.59 -1.79 QTL19_HD
  1. 与k -模型相关的抽穗日期的显著标记,相应的MAF,P关联值,方差由标记解释(R)2)、QTL区间内最显著标记的作用、QTL名称、文献中的参考QTL或基因。