跳转到主要内容

表1用于CYP98s扩增的CODEHOP引物。对于每个引物,一致夹(XXX.XXX .xxx)以大写表示,简并芯(XXX.XXX .xxx)以小写表示。y = (C T), n = A、G、C、T, s = [G、C], r = (A、G)。对每个引物对应的共识蛋白序列进行BLASTp分析。Hits:最佳得分P450,期望值低于0.1,按得分顺序排列。

来自:利用CODEHOP策略探讨了高等植物中基因家族的保存和多样性

底漆 序列 蛋白质的共识 BLASTp找到了P450数据库(1) 预计PCR产物大小(bp)
感觉
P98a TC.ACC.GTC.GAG.tgg.gcn.atg.gc ITVEWAMA 98/76/93/81/79/71/705 270
P98c G.GTG.CAG.GAG.AAG.GTG.car.san.gar.yt RVQEKVQEEL 98/78 220
P98d G.GTG.CAG.CAG.AAG.GTC.CAG.san.gar.ytn.ga RVQQKVQEELD 98/78/703/96/73 220
反向
P98cr C.CCG.GGC.GAT.Ggc.yyr.nac.rtt NVWAIARD 98/75/93/76/71/78/83/92/706
  1. (1)BLASTp参数:矩阵PAM40/期望值(E)