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香兰酰基焦磷酸合酶的分子克隆与功能表达锦紫苏forskohliiBriq

摘要

背景

异戊烯基二磷酸(IPP),常见的生物合成前体对哈达丹磷酸乳蛋白的乳蛋白,通过非甲戊二醇盐途径生物合成。天竺葵二磷酸二磷酸(GGPP)合成酶是Terpenoid生物合成中的重要分支点酶。因此,GGPP合酶被认为是Forskolin生物合成中的关键酶。在此,我们报告了第一次确认GGPP合成酶基因锦紫苏forskohliiBriq。

结果

开放式阅读框架为全长GGPP合成酶编码359个氨基酸的蛋白质,其中1,077个核苷酸长,计算分子量为39.3kDa。对齐C. forskohlii GGPP合酶氨基酸序列显示出与其他植物的高同源性GGPP合成酶.鉴定了几个高度保守的地区,包括两个富含天冬氨酸的基序。n末端区域的瞬态表达C. forskohlii.烟草细胞中GGPP合酶- gfp融合蛋白在叶绿体中表现出亚细胞定位。观察到类胡萝卜素产生大肠杆菌徘徊Paccar25Δ.crtE欧文氏菌uredovora和质粒C. forskohlii GGPP合酶.这些结果表明cDNA编码功能性GGPP合酶。此外,C. forskohlii GGPP合酶表达在叶中强烈,茎中的茎减少,在根中观察到的表达很少。

结论

本研究提出forskolin是通过非甲戊酸途径合成的。GGPP合成酶被认为参与forskolin的生物合成,forskolin主要在叶中合成,随后在茎和根中积累。

背景

Forskolin,Labdane二萜是从肿块根中分离的主要活性化合物锦紫苏forskohliiBriq。(唇形科)1].C. forskohlii.已被用作印度的重要民间医学。Futher,已发现Forskolin是腺苷酸环酶的有效活化剂[2,导致c-AMP水平升高,从而影响心脏活动、血压和眼压。最近,福斯柯林已在日本作为一种治疗心脏病的药物上市。由于Forskolin结构复杂,不能通过化学合成。然而,有两组报道了forskolin完全合成的成功[3.4.].

类异戊二烯是所有生物正常生长和发育过程所必需的。Isopentenyl二磷酸(IPP;C5.)是所有类异戊二烯的共同代谢前体。最近,一些研究小组证实了植物中IPP的合成有两种不同的途径。甲戊酸(MVA)途径发生在细胞质中,另一种不依赖甲戊酸的途径(2c -甲基- d -赤藓糖醇4-磷酸;MEP)途径发生于质体[5.-7.].

天竺葵二磷酸二磷酸(GGPP)合成酶催化烯丙基二磷酸的连续缩合用三个分子的IPP,以产生GGPP,是二萜的生物合成的基本线性前体,类胡萝卜素,类视黄糖和叶绿素的侧链[8.].GGPP合成酶是萜类生物合成中重要的支点戊基转移酶。

GGPP合成酶基因已在许多生物体中克隆,包括;拟南芥[9.10.],水松黄花[11.],向日葵[12.],Scoparia dulcis巴豆sublyratus[13.],硫化叶菌acidocaldarius[14.],粗糙脉孢菌[15.],老鼠和人[16.].氨基酸序列比较显示,GGPP合酶包含多个保守氨基酸残基域,包括第一个富天冬氨酸基序(FARM)和第二个富天冬氨酸基序(SARM) [17.].此外,最近的研究表明,序列中FARM前4位和5位的两个氨基酸,以及植物GGPP合酶FARM中插入的一个氨基酸,在产品长度的确定中起重要作用[13.18.].

类胡萝卜素产生于GGPP的两个分子的偶联。类胡萝卜素生物合成基因簇(CRT.的基因)欧文氏菌uredovora被阐明了[19.,目前被用于研究类胡萝卜素相关基因在异种系统中的功能。这CRT.基因簇由6个基因组成;crtB(植物合酶),crtE(GGPP合成酶)crtI(植物去饱和酶),crtX(玉米黄质β葡糖苷酶),crtY(番茄红素环化酶)和crtZ(β-胡萝卜素羟化酶)。因此,使用类胡萝卜素使用大肠杆菌隐匿的CRT.基因簇可用于GGPP合酶活性的测定。

GGPP合成酶被认为是forskolin生物合成的关键酶。在此,我们报道了cDNA编码C. forskohlii.GGPP合成酶及其异源表达大肠杆菌

结果与讨论

cDNA的克隆和测序C. forskohlii GGPP合酶基因

全长的开放阅读框架(ORF)GGPP合成酶基因编码蛋白质359个氨基酸,1077个核苷酸长,计算分子量为39.3 kDa。氨基酸序列c . forkohliiGGPP合酶在整个编码区均表现出高度同源性Catharanthus Roseus.(75%),拟南芥(73%),Sinapis阿尔巴(72%),巴豆sublyratus(69%),Scoparia dulcis(67%)和(64%)(图。1).然而,与原核GGPP合成酶的氨基酸序列的比较显示出低的同源水平(30-53%)。高度保守的残留物被指定为Domains I-VII。鉴定了两个保守的天冬氨酸富含族的图案,DDXX(x)d。农场和SARM已被证明在底物结合和催化中是重要的[20.-22.].

图1
图1

氨基酸序列比对C. forskohlii.GGPP合酶及其它植物GGPP合酶。黑色盒装的残基表示六个比较序列中的至少五个的位置,而灰色遮蔽表明相似的氨基酸。破折号表示用于优化对齐的差距。氨基酸数量在左侧和右边缘显示。星号展示了七个域,该七个结构域高度保守,其中富冬季富含富氨酸的基序(结构域II和VI)。物种和加入号码是C. forskohlii.AY515700;美国dulcisAB034250_1;c . sublyratusAB034249_1;c . roseus也叫T09966.;美国阿尔巴T10452;答:芥F85434.

的推定定位信号的瞬态表达式C. forskohlii.烟草细胞中的GGPP合酶

植物GGPP合酶序列比对显示,其n端同源性较低。我们有理由假设这些GGPP合酶在其n端有定位信号,将其定位到特定的亚细胞区室。的n端区域C. forskohlii.通过ChloroP 1.1 Prediction Server预测GGPP合酶在叶绿体中定位。在努力确定本地化C. forskohlii.GGPP合酶,该序列编码的80个氨基酸序列在n端C. forskohlii.将GGPP合酶融合到GFP报告基因的N-末端,并转化为2烟细胞。推定定位信号的模式C. forskohlii.GGPP合酶与阳性叶绿体靶向信号[35SΩ-pt-sGFP(S65T)]相同(图。2).的n端区域C. forskohlii.GGPP合酶含有叶绿体定位信号。最近,植物GGPP合酶已被确定易位到质体、线粒体和细胞质中[9.23.].

图2.
figure2

GFP和GFP融合蛋白在-2烟细胞中的瞬时表达。(A) GFP蛋白[35SΩ-sGFP (S65T)];(B)拟南芥叶绿体靶向信号(pt)-GFP融合蛋白[35SΩ-pt-sGFP (S65T)];(C) GGPP合酶- gfp融合蛋白推定定位信号[35SΩ-GGPP合成酶-SGFP(S65T)]

异源表达及活性C. forskohlii.GGPP合成酶

为了表达C. forskohlii GGPP合酶,构建并克隆到质粒pBluescript II KS中-.GGPP合酶与lacZ的计算分子量为41.6 kDa,在大肠杆菌IPTG诱导后携带PGGPPS(图。3.).

图3.
图3

SDS-PAGE分析了GGPP合成酶的表达II KS-载体。M =分子质量标准用kDa表示;第1道=控制(大肠杆菌用pBluescriptII KS转换-);lane 2 = IPTG诱导6h后总蛋白提取;lane 3 =经IPTG处理的细胞的可溶性细胞质部分;lane 4 = IPTG处理的细胞的不溶部分

通过与泌尿病生成的遗传互补研究表达的GGPP合酶的功能活性CRT.基因簇。类胡萝卜素是在大肠杆菌窝藏一CRT.群集基因来自大肠uredovora.替换A.CRT.具有相同活性的未知基因的基因,可用于确定该基因的功能[15.].在此,C. forskohlii GGPP合酶基因克隆到pBluescript II KS中-矢量(PGGPPS)以生产alacZ融合蛋白。pGGPPS随后被转化为大肠杆菌DH10B携带质粒PACCAR25ΔcrtE在这一crtE编码GGPP合成酶的基因被删除。在转化体中观察到类胡萝卜素呈黄色,表明pGGPPS携带了取代黄酮功能的基因crtE基因(图。4.).比较了转化子的类胡萝卜素产量大肠杆菌携带转化质粒pACCAR25ΔcrtE和pBAA编码小鼠GGPP合成酶(阳性对照)[16.],携带转化质粒pACCAR25ΔcrtE和一个pBluescript II KS-(pBS)载体(阴性对照)。这一结果表明,cDNA的编码区C. forskohlii GGPP合酶编码有功能的GGPP合酶。

图4.
装具

类胡萝卜素的生产大肠杆菌含有质粒pACCAR25ΔcrtE和质粒表达。(1)小鼠GGPP合成酶pBAA;(2)质粒表达C. forskohlii.pGGPPS GGPP合酶;(3) pBluescript II KS-向量,pBS

的表达GGPP合成酶器官基因C. forskohlii.

的表达GGPP合成酶RT-PCR法在不同器官中检测C. forskohlii..分析了八十个月植物的根,茎和叶子中提取的总RNA。这C. forskohlii GGPP合酶基因在叶片中强烈表达,而表达在茎中降低并在根中几乎表达(图。5.).因此,叶被认为是forskolin合成的主要位置。我们以前报道过在无性繁殖的植物器官中forskolin的浓度C. forskohlii.[24.].茎根和茎碱被测定含有比器官更高浓度的斯科啉。此外,分别分别分析茎底,表皮和皮质,血管束和髓质的部分。在血管束组织中鉴定出最高浓度的孢子蛋白。从这些数据中,我们提出了参与雌激素的生物合成的GGPP合酶主要在叶片中合成,随后分布于茎,最终累积在茎碱基和根中。

图5.
figure5

的表达GGPP合成酶在根,茎和叶C. forskohlii.文化。10微升PCR产物在每个车道中加载。下面的面板显示18S rRNA片段作为内部控制。

通过非甲戊酸途径产生Forskolin

努力通过非甲戊酰型途径研究FORSKOLIN生物合成途径,将各种浓度的FOSMIDOMCIN,非甲醛途径中的1-脱氧-D-木糖-5-磷酸盐还原酶(DXR)酶的特异性抑制剂进行施用这C. forskohlii.测定根的forskolin含量(图。6.).治疗导致了苏克林的减少,而10μmFosmidomcin对Forskolin生产没有影响。在较高浓度下,观察到剂量依赖性抑制效果。在1000μmfosmidomycin,与无抑制剂治疗的对照组织相比,克洛林含量高达50%。因此,认为被认为是通过非甲戊二醇酯途径合成的。

图6.
figure6

Fosmidomycin对Forskolin生产的影响。

最近13.c -葡萄糖饲养实验使用13.C-NMR分析方法提示forskolin的生物合成途径为非甲戊酸途径[25.].另外,从非甲戊酸途径第一步特异性酶中克隆到DXR基因C. forskohlii.[26.].

结论

C. forskohlii.克隆了GGPP合成酶并确定了其亚细胞定位。n端含有一个定位于叶绿体的信号。通过与胡萝卜素基因的遗传互补研究GGPP合酶的功能表达CRT.基因簇。类胡萝卜素是在crtE基因被替换为C. forskohlii.GGPP合成酶。GGPP合成酶被认为参与forskolin的生物合成,forskolin最初在叶片中合成,随后分布到茎中,最终在茎基部和根中积累。

方法

植物材料和试剂

C. forskohlii.植株在无激素MS (Murashige和Skoog)培养基中培养,25°C, 16小时光照周期。光照强度为3000勒克斯,相对湿度为60%。采用茎尖培养法繁殖的茎条(长10 mm)在蛭石中依次培养。BY-2烟草单细胞悬浮液[27.在补充有0.2 mg L的液体改性LS(Leinsmaier和Skoog)培养基中培养-12,4-d(2,4-二氯音氧乙酸)在25°C的黑暗条件下在轨道培养箱中。限制性内切酶、连接酶、pcr -聚合酶购自日本东京Takara Shuzo株式会社和日本东京Toyobo株式会社。Fosmidomycin (FR-3154)购自美国俄勒冈州Molecular Probes公司。化学试剂购自Sigma化学公司(圣路易斯,美国)和Nacalai Tesque公司(东京,日本)

菌株和质粒

大肠杆菌TOP10F”和大肠杆菌DH10B携带质粒PACCAR25ΔcrtE被用于本次调查中。利用pUC119载体进行cDNA克隆和测序。pBluescript II KS-矢量被用作GGPP合成酶表达质粒。35SΩ-sGFP(S65T)质粒作为绿色荧光蛋白(GFP)报告质粒。pBI121植物病媒和农杆菌肿瘤术LBA4404用于将GFP和GFP融合基因转化为植物细胞。

cDNA的克隆和测序C. forskohlii GGPP合酶基因

总RNA从根中提取C. forskohlii.用酸胍-苯酚-氯仿萃取法培养[28.].以oligo-dT适配引物、M-MLV逆转录酶和总RNA为模板,合成单链cDNA。简并引物基于之前克隆的植物GGPP合酶基因高度保守的氨基酸序列设计[13.].用Taq DNA聚合酶和简并引物A、B、C、D套式PCR扩增出470 bp的cDNA片段(见表)1).使用基因特异性引物I和J的CDNA末端(RACE)快速扩增CDNA的3'结束,并通过嵌套的PCR获得522bp产物。对于5'族,通过末端脱氧核苷酸转移酶在其5'末端在其5'端中聚酰基化。用特定引物G和H和H和FA和F进行第一和第二PCR,得到285bp产物。通过嵌套的PCR使用特定引物K,L,M和N扩增1,077bp的整个编码区域,由5'和3'赛产品设计。

表1 cDNA克隆引物GGPP合成酶

所有扩增的cDNA片段经PCR引物纯化后,在引物引入的位点用限制性内切酶酶切,克隆到载体pUC119中。转换后大肠杆菌TOP10F',使用BIGDYE终结器周期测序试剂盒使用型号310遗传分析仪(PE生物系统)测序疏松插入物的克隆。

将从核苷酸序列推导的氨基酸序列与使用FASTA程序的基因组网www服务器中的序列数据库进行比较。使用基因组群集服务器中的Clustalw多序列对准进行多种氨基酸序列对准。

的推定定位信号的构造和表示C. forskohlii.GGPP合成酶

n端240 bp片段C. forskohlii GGPP合酶引物P和Q进行PCR扩增,PCR产物经酶切克隆到萨尔我- - - - - -以区域35SΩ-sGFP(S65T)质粒的I位点。35SΩ-pt-sGFP(S65T)为叶绿体靶向阳性对照[29.30.].GFP,GGPP合成酶- gfp融合和pt-GFP融合,CaMV35SΩ启动子和NOS3终止子[35SΩ-sGFP (S65T), 35SΩ-GGPP合成酶-sGFP (S65T)和35SΩ-pt-sGFP (S65T)分别亚克隆到III-EcoR我的PBI121向量网站然后转换为LBA4404。将转化体在28℃下在含有25μg/ ml卡那霉素和25μg/ ml利福平的利福平的YEB液体培养基中培养两天。将转化体洗涤两次并重新悬浮在YEB培养基中。农杆菌属转化株(108.将细胞)施加至四毫升五天含量的止常悬浮培养培养物。将培养物在28℃下在暗条件下孵育两天。使用尼康Eclipse TE2000-U模型通过荧光显微镜分析GFP和GFP融合蛋白。在400倍放大率下观察细胞。

质粒的构建C. forskohlii.GGPP合成酶表达

的cDNA的编码区C. forskohlii GGPP合酶通过PCR使用特异性引物M和O扩增PCR。消化了PCR产物;纯化并克隆到Kpn一世-Sal.我网站的pBluescript II KS-矢量,即pggpps。将该质粒转化为大肠杆菌XL1-Blue MRF'为过表达。转化菌在含有50 μg/ml氨苄青霉素和25 μg/ml氯霉素的LB液体培养基中培养。用1 mM异丙基-1-硫代-β- d -半乳糖(IPTG)诱导培养,37℃培养6小时。收集细胞,用50 mM Tris-HCl pH 8.0离心洗涤。将颗粒重新悬浮,加入溶菌酶,孵育30分钟。然后将混合物以一分钟为间隔超声4次,每次15秒。在10000 × g离心10分钟后得到可溶部分。进行SDS-PAGE以检测蛋白[31.].

遗传互补表达

的pACCAR25ΔcrtE质粒包含基因簇crtBcrtIcrtXcrtYcrtZ编码类胡萝卜素生物合成酶,除crtE(编码GGPP合成酶)。质粒pBAA含有小鼠GGPP合成酶(阳性对照质粒)和大肠杆菌DH10B携带质粒PACCAR25ΔcrtE由日本Shimane大学M. Kawamukai博士提供[16.].pBluescript II KS-载体pBS作为阴性对照。pGGPPS、pBAA和pBS转化为大肠杆菌DH10B携带质粒PACCAR25ΔcrtE.将转化子均置于含有50 μg/ml氨苄青霉素和25 μg/ml氯霉素的LB琼脂培养基上,在25℃下孵育2 ~ 3天。

反向transcriptase-PCR (rt - pcr)

一个八个月的孩子C. forskohlii.分十二部分进行分析;叶(L1-L4),茎(S1-S5)和根(R1-R3)。数量是根据器官的成熟程度而定的。从植株各部位提取总RNA。以1微克总RNA为模板,合成第一链cDNA(采用SuperScript first - strand synthesis System for RT-PCR, Invitrogen)。利用引物M、O、cDNA第一链和kod -聚合酶进行扩增C. forskohlii GGPP合酶在变性条件下,98°C, 15秒;退火,60°C, 2秒,拉伸,74°C, 5秒。作为内对照的18S rRNA片段,在相同条件下用引物R和S进行扩增C. forskohlii GGPP合酶放大。扩增产物经1.0%琼脂糖凝胶电泳分析。

forskolin生产分析

C. forskohlii.用不同浓度的fosmidomycin处理植株,然后用HPLC法研究forskolin的含量,如前所述[26.].通过与202nm紫外吸收法检测的Forskolin标准品(Sigma)的保留时间进行比较,检测Forskolin。

缩写

CRT.

雌激素基因

农场:

第一个aspartate-rich主题

绿色荧光蛋白:

绿色荧光蛋白

GGPP:

geranylgeranyl二磷酸

议员:

2 c-methyl-d-erythritol 4-phosphate

MVA:

甲羟戊酸

指控:

富有的富含富含股票的主题

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35SΩ-sGFP(S65T)质粒由日本静冈县大学丹羽宇雄博士慷慨提供。

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作者的贡献

SE进行了分子遗传学研究,参与了序列比对、forskolin分析并起草了手稿。TF参与了本次研究的设计与协调。MK参与了遗传互补与协调。YS构思了这项研究,并参与了其设计和协调。所有作者阅读并批准了最终的手稿。

Surang Engprasert, Futoshi Taura, Makoto Kawamukai对这项工作做出了同样的贡献。

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关于这篇文章

引用这篇文章

Engprasert, S., Taura, F., Kawamukai, M.。et al。香兰酰基焦磷酸合酶的分子克隆与功能表达锦紫苏forskohliiBriq。BMC植物杂志4,18(2004年)。https://doi.org/10.1186/1471-2229-4-18

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关键字

  • 绿色荧光蛋白
  • 类胡萝卜素
  • forskolin.
  • 异戊烯基二磷酸酯
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