Skip to main content

Table 2 Allele frequency database, expected heterozigosity (He), observed heterozygosity (Ho) and polymorphic information content (PIC) estimates for a random set of 25 microsatellite markers analyzed with a sample of 40C. meloaccessions.

From:Development of microsatellite markers from an enriched genomic library for genetic analysis of melon (Cucumis meloL.)

Locus Allele (bp) Frequency He Ho PIC Locus Allele (bp) Frequency He Ho PIC
CMBR1 140 0.03 0.53 0.27 0.47 CMBR33 180 0.15 0.65 0.22 0.57
150 0.20 150 0.03
160 0.12 160 0.39
130 0.65 CMBR39 150 0.03 0.60 0.00 0.52
CMBR100 110 0.10 0.45 0.10 0.42 160 0.03
130 0.05 190 0.03
140 0.13 170 0.49
120 0.73 165 0.03
CMBR107 170 0.53 0.51 0.18 0.37 180 0.41
180 0.47 CMBR42 110 0.11 0.44 0.00 0.40
CMBR108 160 0.03 0.30 0.06 0.28 150 0.14
200 0.03 160 0.73
170 0.11 100 0.03
180 0.83 CMBR43 230 0.08 0.68 0.22 0.65
CMBR14 130 0.39 0.53 0.39 0.42 280 0.03
140 0.04 240 0.25
150 0.57 290 0.15
CMBR18 160 0.03 0.33 0.06 0.29 250 0.49
170 0.17 CMBR44 100 0.35 0.46 0.13 0.35
150 0.81 110 0.65
CMBR19 180 0.05 0.48 0.08 0.44 CMBR5 170 0.58 0.49 0.40 0.37
150 0.01 180 0.43
160 0.05 CMBR56 180 0.01 0.36 0.08 0.31
110 0.18 210 0.03
170 0.70 170 0.18
CMBR20 150 0.08 0.50 0.05 0.46 150 0.78
180 0.01 CMBR64 130 0.05 0.53 0.06 0.48
140 0.01 140 0.16
110 0.15 150 0.13
160 0.69 160 0.66
170 0.05 CMBR7 90 0.10 0.54 0.46 0.49
CMBR22 170 0.23 0.59 0.15 0.52 80 0.06
160 0.04 100 0.19
150 0.14 110 0.64
180 0.59 CMBR70 200 0.15 0.46 0.00 0.41
CMBR24 160 0.23 0.55 0.11 0.49 150 0.10
140 0.03 190 0.03
170 0.12 CMBR71 100 0.65 0.46 0.05 0.35
180 0.62 110 0.35
CMBR25 150 0.12 0.70 0.08 0.63 CMBR73 110 0.19 0.61 0.50 0.53
160 0.13 100 0.28
170 0.39 120 0.54
180 0.36 CMBR89 120 0.06 0.63 0.00 0.56
CMBR27 240 0.01 0.55 0.40 0.45 130 0.51
260 0.05 150 0.11
250 0.38 140 0.31
270 0.56