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表3 Top 5充实独联体-元素在下调/上调基因的假定启动子区域ask1转录组

来自:拟南芥花芽的蛋白质组学和转录组学分析揭示了拟南芥SKP1-LIKE1的重要功能

低聚物 #在查询 基因组中# 低聚物的启动子数量 基因组中含有低聚物的启动子数量 二项分布p价值
500 bp的下调基因启动子ask1
CACGTG 30. 7766 12/42 3253/33602 3.53 e-04
ACACGT 23 7390 17/42 5609/33602 1.61 e-04
CGCAAA 13 4569 13/42 3995/33602 6.16 e-04
GCCACG 11 2914 10/42 2594/33602 8.46 e-04
GATAAG 27 9179 19/42 7797/33602 9.09 e-04
1000 bp的下调基因启动子ask1
CACGTG 42 12404 16/42 5033/33602 1.57 e-04
AACTGT 33 17175 28/42 13171/33602 2.04 e-04
GATAAG 41 18464 28/42 13811/33602 4.93 e-04
ATTATG 60 33774 35/42 20241/33602 8.37 e-04
CGTGTA 22 7824 17/42 6717/33602 1.25 e 03
500 bp的基因启动子ask1
CACGTG 72 7766 24/74 3253/33602 4.95 e-08
ACACGT 57 7390 30/74 5609/33602 7.19 e-07
ACGTGG 30. 5475 22/74 4404/33602 9.42 e-05
AAGTGG 31 7504 27/74 6502/33602 2.63 e-04
ACACTC 23 5788 23/74 5177/33602 3.37 e-04
1000 bp的上调基因启动子ask1
CACGTG One hundred. 12404 30/74 5033/33602 6.83 e-08
ACACGT 77 12599 38/74 9080/33602 5.14 e-06
ACGTGG 46 9196 31/74 7047/33602 2.50 e-05
ATATTA 177 65927 68/74 25116/33602 1.22 e-04
TGAGAC 48 12304 36/74 10027/33602 2.98 e-04