数据集 |
小麦品种 |
组织 |
发展阶段/治疗 |
RNA-seq读取 |
%唯一映射的读取 |
数据源 |
参考 |
小麦发展timecourse |
t . aestivum简历。中国的春天 |
茎,根,谷粒,穗和茎。 |
每个组织有三个阶段 |
101bp配对端(PE) |
61.7% |
ENA: ERP004714 |
[5] |
光形态发生 |
t . monococcumssp。monococcumAcc。DV92 |
整个幼苗 |
黄化和暴露在光照下的幼苗。 |
50bp单端(SE) |
53.4% |
SRA: SRX283514 |
[6] |
t . monococcumssp。aegilopoidesAcc。G3116 |
整个幼苗 |
黄化和暴露在光照下的幼苗。 |
101个基点体育 |
68.0% |
SRA: SRX257915 |
干旱和热应激 |
t . aestivum简历。TAM 107 |
整个幼苗 |
干旱、高温和综合胁迫。 |
101个基点体育 |
45.9% |
SRA: SRP045409 |
[7] |
颗粒层 |
t . aestivum简历。浩方 |
胚乳,内皮,外皮。 |
花期后12天 |
50个基点SE |
31.4% |
ENA: ERP008767 |
[8] |
开始衰老叶timecourse |
t . turgidumssp。硬质l .简历。克诺斯 |
旗叶 |
抽穗期,花期后12天和22天 |
50个基点SE |
33.9% |
地理:GSE60635 |
[9] |
粮食发展timecourse |
t . aestivum简历。中国的春天 |
颗粒层 |
花期后10、20、30天 |
101个基点体育 |
56.1% |
ENA: ERP004505 |
[10] |
- SRA短读档案,NCBI [14],地理基因表达综合,NCBI [15],ENA欧洲核苷酸档案[16]