跳过主要内容

表1 WheatExp . RNA-seq数据集

来自:WheatExp:多倍体小麦的RNA-seq表达数据库

数据集 小麦品种 组织 发展阶段/治疗 RNA-seq读取 %唯一映射的读取 数据源 参考
小麦发展timecourse t . aestivum简历。中国的春天 茎,根,谷粒,穗和茎。 每个组织有三个阶段 101bp配对端(PE) 61.7% ENA: ERP004714 5
光形态发生 t . monococcumssp。monococcumAcc。DV92 整个幼苗 黄化和暴露在光照下的幼苗。 50bp单端(SE) 53.4% SRA: SRX283514 6
t . monococcumssp。aegilopoidesAcc。G3116 整个幼苗 黄化和暴露在光照下的幼苗。 101个基点体育 68.0% SRA: SRX257915
干旱和热应激 t . aestivum简历。TAM 107 整个幼苗 干旱、高温和综合胁迫。 101个基点体育 45.9% SRA: SRP045409 7
颗粒层 t . aestivum简历。浩方 胚乳,内皮,外皮。 花期后12天 50个基点SE 31.4% ENA: ERP008767 8
开始衰老叶timecourse t . turgidumssp。硬质l .简历。克诺斯 旗叶 抽穗期,花期后12天和22天 50个基点SE 33.9% 地理:GSE60635 9
粮食发展timecourse t . aestivum简历。中国的春天 颗粒层 花期后10、20、30天 101个基点体育 56.1% ENA: ERP004505 10
  1. SRA短读档案,NCBI [14],地理基因表达综合,NCBI [15],ENA欧洲核苷酸档案[16