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表1识别清单GLYI大豆基因(大豆)以及它们的详细信息和本地化

来自:大豆乙二醛酶基因家族的全基因组分析及表达谱分析(大豆)表明其发育和非生物胁迫特异性反应

的名字 基因 蛋白质 Chro。没有 CDS坐标(5 '到3 ') cd (bp) 外显子 页长度(aa) 兆瓦(kDa) π 本地化
GmGLYI-1 Glyma.01 g146300 Glyma.01 g146300.1 1 48150827 - 48154366 1044 9 347 39.3 7.01 Cha、c；太b；Cyb
Glyma.01 g146300.2 1038 9 345 39.1 7.01 Cha、c；太b；Cyb
Glyma.01 g146300.3 930 8 309 35.1 8.44 Cha, b, c；太b；Cyb
GmGLYI-2 Glyma.01 g168400 Glyma.01 g168400.1 1 50605679 - 50608020 579 3. 192 22.0 5.04 Cy一个；电子商务b
GmGLYI-3 Glyma.04 g083100 Glyma.04 g083100.1 4 7006088 - 7009361 1041 9 346 38.5 5.83 Cha, b, c
GmGLYI-4 Glyma.05 g228500 Glyma.05 g228500.1 5 40646576 - 40651812 1101 9 366 40.6 8.17 Cha, b, c
Glyma.05 g228500.2 1089 9 362 40.2 6.28 Cha, b, c
GmGLYI-5 Glyma.06 g084500 Glyma.06 g084500.1 6 6498718 - 6501298 792 8 263 29.7 5.45 Cyb
GmGLYI-6 Glyma.07 g031700 Glyma.07 g031700.1 7 2508024 - 2510223 519 2 172 19.6 5.10 ν一个；Cyb
Glyma.07 g031700.2 369 3. 122 13.9 4.89 Cya、b
Glyma.07 g031700.3 381 2 126 14．5 5.03 Cya、b
GmGLYI-7 Glyma.07 g261400 Glyma.07 g261400.1 7 43645750 - 43649851 843 7 280 31.6 5.62 Cya、b
Glyma.07 g261400.2 732 8 243 27.2 5.34 Cya、b
Glyma.07 g261400.3 795 7 264 29.8 5.24 Cya、b
Glyma.07 g261400.4 843 8 280 31.6 5.62 Cya、b
Glyma.07 g261400.5 843 8 280 31.6 5.62 Cya、b
Glyma.07 g261400.6 819 8 272 30.7 6.11 Cya、b
GmGLYI-8 Glyma.08 g035400 Glyma.08 g035400.1 8 2811954 - 2818455 1071 9 356 39.6 6.56 Cha, b, c
GmGLYI-9 Glyma.08 g211100 Glyma.08 g211100.1 8 17046316 - 17048640 426 3. 141 16.4 4.86 Ch一个,怒一个；Cya、b
GmGLYI-10 Glyma.09 g004300 Glyma.09 g004300.1 9 340275 - 344376 975 8 324 36.9 6.62 太一个；Cyb
Glyma.09 g004300.2 891 9 296 33.5 6.13 Cya、b
Glyma.09 g004300.3 864 9 287 32.4 5.74 Cya、b
Glyma.09 g004300.4 840 8 279 31.5 6.97 Cya、b
Glyma.09 g004300.5 951 9 316 35.9 8.45 太a、b；Cyb
GmGLYI-11 Glyma.09 g193800 Glyma.09 g193800.1 9 41830881 - 41834537 1041 9 346 39.0 6.68 Cha, b, c；太b
Glyma.09 g193800.2 819 7 272 30.6 8.76 Cha、c；太b
GmGLYI-12 Glyma.09 g226500 Glyma.09 g226500.1 9 45136253 - 45137166 333 2 110 12.8 5.23 Cyb
GmGLYI-13 Glyma.11 g075000 Glyma.11 g075000.1 11 5598647 - 5600229 579 3. 192 22.1 4.97 Cya、b
GmGLYI-14 Glyma.11 g194200 Glyma.11 g194200.1 11 26776807 - 26779603 747 8 248 28.5 5.48 阿宝一个；Cyb；电子商务b
GmGLYI-15 Glyma.11 g194300 Glyma.11 g194300.1 11 26780838 - 26784795 702 8 233 26.5 9.16 Cha、c；太b
GmGLYI-16 Glyma.12 g079700 Glyma.12 g079700.1 12 6241940 - 6246776 708 7 235 26.8 9.28 太a、b
Glyma.12 g079700.2 558 6 185 21.0 5.41 Cya、b
Glyma.12 g079700.3 525 8 174 20.0 9.69 太a、b
GmGLYI-17 Glyma.12 g167400 Glyma.12 g167400.1 12 32196920 - 32200101 555 2 184 21.0 5.14 Cya、b；电子商务b
GmGLYI-18 Glyma.13 g106600 Glyma.13 g106600.1 13 22081599 - 22084230 630 5 209 23.4 6.49 Cha、c；电子商务b,太b
GmGLYI-19 Glyma.13 g168200 Glyma.13 g168200.1 13 28259866 - 28261852 504 3. 167 19.0 5.46 电子商务一个；Cyb；νb
GmGLYI-20 Glyma.15 g009500 Glyma.15 g009500.1 15 737953 - 739806 522 3. 173 19.4 5.58 Cha、b；Cyb
GmGLYI-21 Glyma.15 g108400 Glyma.15 g108400.1 15 8534420 - 8539477 864 8 287 32.4 5.74 Cya、b
GmGLYI-22 Glyma.16 g003500 Glyma.16 g003500.1 16 194687 - 196274 549 2 182 20.6 5.22 Cya、b；Chb
GmGLYI-23 Glyma.17 g052700 Glyma.17 g052700.1 17 4011185 - 4013445 621 5 206 22.9 7.08 Cha、c；太b
GmGLYI-24 Glyma.17 g115900 Glyma.17 g115900.1 17 9163290 - 9164088 438 4 145 16.5 6.88 Ch一个,电子商务a、b；νb
  1. 缩写:cd编码DNA序列,Chro染色体,页多肽长度,兆瓦分子量,P我等电点,英国石油公司碱基对,aa氨基酸,kDakilodalton,Ch叶绿体,Cy胞质,电子商务细胞外,太线粒体,ν核,阿宝过氧物酶体
  2. 一个大提琴v.2.5定位预测(http://cello.life.nctu.edu.tw/）
  3. bpSORT定位预测(http://www.genscript.com/wolf-psort.html）
  4. c叶绿体定位信号由ChloroP (http://www.cbs.dtu.dk/services/ChloroP/）
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BMC植物生物学

ISSN: 1471 - 2229

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