跳过主要内容

表3位于b位的三个片段的重复掩码分析

来自:B染色体含有活性基因,影响玉米A染色体的转录(玉蜀黍L。

在查询 在重复
分数 % div。 %德尔。 % ins。 查询序列 开始 结束 (左) 匹配重复 重复类/家庭 (左)开始 结束 开始(左)
387 35.3 2.3 2.7 comp74447 330 588 (1045) 吉普赛- 196 _zm——我 LTR /吉普赛 (8584) 1386 1129
1980 27.5 2.4 3.7 comp74447 578 1446 (187) 吉普赛- 207 - _zm - ltr LTR /吉普赛 (2160) 1919 1102
291 35.5 4.1 4.6 comp30393 39 431 (53) PREM1A_ZM_LTR LTR / Copia (1836) 1572 1182
8117 4.7 2.6 0.6 comp75688 1974 3009 (241) Gypsy67-ZM_LTR LTR /吉普赛 2581 3638 (423)
  1. 得分:史密斯-沃特曼的比赛得分
  2. % div.:匹配区域中与共识比较的%替换
  3. %德尔。:查询序列中间距相对的基数的%(已删除bp)
  4. % ins。:重复一致性中与空白相对的碱基的百分比(插入bp)