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表2与抗CH3分离物相关的SNP，通过GLM分析显示并根据P.- 值得

从：鉴定大麦抗斑点斑点相关的50 k illumina-chip SNP

＃ 标记 CHR. 物理地图位置（BP） 遗传地图位置（cm） P.-价值 等位基因 MAF，％
1 JHI-HV50K-2016-157070 3h. 17,888,495 纳 6.04E-08 * C / G. C（0.19）
2 JHI-HV50K-2016-156842 3h. 17,559,189 纳 1.20E-06 * A / G. a（0.18）
3. JHI-HV50K-2016-156999 3h. 17,817,242 纳 5.71E-11 * A / C. a（0.25）
4. JHI-HV50K-2016-156329 3h. 16,375,436 纳 3.26E-09 * G / A. g（0.25）
5. JHI-HV50K-2016-157182 3h. 17,954,351 纳 3.67E-09 * T / A. T（0.25）
6. JHI-HV50K-2016-156387 3h. 16,420,851. 纳 1.45E-08 * C / A. C（0.10）
7. JHI-HV50K-2016-156336 3h. 16,375,848 纳 1.05E-07 * 在 a（0.11）
8. BOPA1_3355-605 2h 纳 纳 1.19E-07 * C / A. C（0.19）
9. scri_rs_153880. 2h 纳 59.3. 1.19E-07 * T / C. t（0.19）
10. scri_rs_206529 2h 纳 60.5 1.19E-07 * A / G. a（0.19）
11. bopa2_12_11504 2h 520,773,185 57.0 1.19E-07 * A / G. a（0.19）
12. bopa2_12_30108 2h 556,024,085 59.3. 1.19E-07 * A / C. a（0.19）
13. JHI-HV50K-2016-98667 2h 559,662,446 纳 1.19E-07 * A / G. a（0.19）
14. scri_rs_141789. 2h 551,217,066 59.3. 1.19E-07 * A / C. a（0.19）
15. JHI-HV50K-2016-156833 3h. 17,558,292 纳 1.73E-07 * T / A. T（0.29）
16. scri_rs_83731 2h 纳 57.0 1.84E-07 * T / G. T（0.21）
17. scri_rs_162917 2h 517,229,083 57.2 1.84E-07 * A / G. A（0.21）
18. scri_rs_233449. 2h 520,779,376 57.0 1.84E-07 * G / A. g（0.21）
19. JHI-HV50K-2016-155569 3h. 15,256,329 纳 4.30E-07 * A / G. a（0.14）
20. JHI-HV50K-2016-158003 3h. 18,788,405 纳 5.36E-07 * G / A. g（0.27）
21. scri_rs_97417. 3h. 15,255,540. 12.1 1.35E-06 * C / T. C（0.34）
22. scri_rs_186769. 2h 纳 57.4 1.35E-06 * GC g（0.22）
23. BOPA1_2634-2228 2h 520,264,176 纳 1.35E-06 * C / A. C（0.22）
24. BOPA1_5160-268 2h 520,778,105 纳 1.35E-06 * G / A. g（0.22）
25. scri_rs_132839. 2h 524,447,113 57.0 1.35E-06 * A / G. a（0.22）
26. scri_rs_136740 2h 524,817,496. 57.2 1.35E-06 * A / C. a（0.22）
27. scri_rs_191136. 2h 520,437,064 57.0 1.35E-06 * T / C. T（0.22）
28. bopa2_12_30179 2h 纳 56.4 2.15E-06. A / G. a（0.19）
29. JHI-HV50K-2016-92202 2h 309,655,073 纳 2.96E-06. T / C. T（0.21）
30. bopa2_12_10035 2h 463,231,068 56.7 3.10E-06. G / A. g（0.19）
31. scri_rs_161169. 2h 483,288,774 56.7 3.10E-06. G / A. g（0.19）
32. BOPA1_5254-1845 2h 175,163,708 纳 5.42E-06. G / A. g（0.18）
33. scri_rs_109192 2h 175,053,470. 纳 5.42E-06. G / T. g（0.18）
34. JHI-HV50K-2016-226122 4h. 645,489 纳 6.20E-06. A / G. a（0.37）
35. JHI-HV50K-2016-155951 3h. 15,469,647 纳 8.49E-06. T / A. T（0.30）
36. JHI-HV50K-2016-153016 3h. 7,847,727 纳 9.22E-06. A / G. g（0.10）
37. JHI-HV50K-2016-445854 7h. 10,393,349. 纳 9.28E-06. A / G. g（0.48）
38. JHI-HV50K-2016-17526 1小时 32,102,667 纳 9.88E-06. G / A. A（0.42）
39. scri_rs_162708. 7h. 56,674,116 47.9 9.88E-06. A / G. g（0.29）
40 JHI-HV50K-2016-159556 3h. 24,223,023 纳 1.60E-04. G / A. g（0.41）
41. bopa2_12_31179 1小时 449,874,128 58.4 3.54E-04. C / G. C（0.13）
  1. 1-27（带下划线的粗体）：SNP，根据Bonferroni多次测试校正在5％（P. < 1.8302E-6).28–39 (bold): suggestive SNPs. MAF – Minor allele frequency. Chr – chromosome, na – not available. Genetic map positions are given according Morex / Barke iSelect map (http://bioinf.hutton.ac.uk/iselect/app//的）
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BMC植物生物学

ISSN：1471-2229

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