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表1Heterobasidion在挪威云杉的殖民期间,碳水化合物利用和木质素降解的预测作用的基因上调

来自:双RNA-seq分析为挪威云杉和坏死性病原体之间的相互作用提供了新的见解Heterobasidion annosum s.l。

蛋白质ID 基因名字 基因库加入数量 函数 信号肽
Carbohydrate-active酶(CAZYmes)
62665年 XP_009543268.1 GH2(候选人β甘露糖苷酶) 是的
107773年 gh3.3 XP_009550170.1 GH3(候选人β木糖苷酶) 是的
53076年 XP_009551166.1 GH5(候选人β糖苷酶) 没有
181245年 gh5.2 XP_009540876.1 GH5(候选β-1,4-内切葡聚糖酶n -末端CBM1模块) 是的
153422年 XP_009545732.1 GH5(候选人β糖苷酶) 是的
62063年 XP_009546979.1 GH5(含n端CBM1模块的候选β-甘露聚糖酶) 是的
60114年 gh6.1 XP_009541827.1 GH6(候选纤维生物水解酶n端CBM1模块) 是的
38802年 gh7.1 XP_009544628.1 GH7 cellobiohydrolase(候选人) 是的
426682年 XP_009545675.1 GH10(候选人木聚糖酶) 是的
56987年 gh12.4 XP_009553052.1 GH12(候选内切-β-1,4-葡聚糖酶或木葡聚糖酶) 是的
65781年 XP_009551196.1 GH13(候选人α淀粉酶) 没有
157474年 XP_009550165.1 候选人GH15(α1,4-glucanase) 是的
151266年 XP_009548433.1 GH20 exochitinase(候选人) 是的
126780年 XP_009550237.1 GH27(候选人α牛乳糖) 是的
12392年 XP_009553028.1 GH28 exopolygalacturonase(候选人) 是的一个
174466年 XP_009551306.1 GH28(候选鼠李糖醛酸α- l -鼠李糖吡喃水解酶) 是的一个
118397年 XP_009550976.1 GH28(候选人聚半乳糖醛酸酶) 是的
125676年 XP_009551310.1 GH28(与鼠李糖醛酸α- l -鼠李糖吡喃水解酶有关) 是的
153387年 XP_009550443.1 GH31(候选人α葡糖苷酶) 是的
104329年 gh45.1 XP_009549290.1 GH45 (endo-β-1,4-葡聚糖酶的远亲) 是的
445737年 XP_009549102.1 GH47(候选人α甘露糖苷酶) 没有
37715年 XP_009551149.1 GH53(候选人endo -β1,4-galactanase) 是的
57301年 XP_009553063.1 GH79(候选人β糖苷酶) 是的
322477年 XP_009548553.1 GH115(候选木聚糖α-葡萄糖苷酶) 是的
181227年 axe1 XP_009552838.1 假定乙酰木聚糖酯酶CE1 是的
163550年 XP_009545417.1 候选鼠李半乳糖醛酸乙酰酯酶 是的
64706年 XP_009545882.1 CE15(候选葡萄糖醛基甲基酯酶) 是的
165050年 XP_009553207.1 CE16碳水化合物酯酶 是的
181229年 GH61C, GH61.3 XP_009550870.1 LPMO 是的
64994年 GH61I, GH61.9 XP_009545898.1 LPMO 是的
105463年 GH61A, GH61.1 XP_009550910.1 LPMO 是的
125540年 XP_009550793.1 具有CBM1结构域的碳水化合物结合模块家族1蛋白 是的
322385年 XP_009548594.1 内切葡聚糖酶e蛋白 没有
Lignin-degrading酶
106089年 mnp1 XP_009551540.1 锰过氧化物酶1 是的
181068年 mnp2 XP_009551541.1 锰过氧化物酶2 是的
101580年 mnp5 XP_009547178.1 锰过氧化物酶5 是的
108376年 mnp6 XP_009553404.1 锰过氧化物酶6 是的
181063年 lcc12 XP_009550378.1 漆酶12(多铜氧化酶1型) 是的
163945年 aao7 XP_009549981.1 芳基-醇氧化酶(aao 是的
103798年 gor14 XP_009548140.1 GMC家族氧化还原酶 是的
157537年 背景 XP_009552848.1 推测的纤维二糖脱氢酶1 是的
426787年 XP_009545993.1 与参与木质素降解的LigE β酯酶有关 没有
105890年 lep1 XP_009551319.1 在木质素培养基上特异性表达的含BNR_4结构域蛋白 是的
105202年 XP_009547058.1 类似于Phanerochaete chrysosporium4-O-methyltransferase;可能对木质素降解有作用 是的
446810年 XP_009552373.1 类似于Phanerochaete chrysosporium3-O-methyltransferase;可能对木质素降解有作用 没有
  1. 一个目前的蛋白模型可能在N端被截断,没有信号肽序列,但在其上游检测到信号肽编码序列