跳过主要内容gydF4y2Ba
图2 | BMC Plant BiologygydF4y2Ba

图2gydF4y2Ba

来自:gydF4y2Ba燕麦(禾本科)的重复DNA景观:全基因组序列中主要重复类定义的染色体和基因组进化gydF4y2Ba

图2gydF4y2Ba

中选择重复的簇图和点图gydF4y2Ba燕麦属gydF4y2Ba物种。对于每次重复,都会显示RepeatExplorer集群(左;黄色节点表示重复集群内所有组装的contigs;红节点代表更详细分析的contig成员,包括通过扩增和原位杂交。右面板中显示了所选contig的自点图;平行对角线表示串联重复。gydF4y2Ba一个gydF4y2BaAs_16mer43bp,在289CL8C154聚类中鉴定。gydF4y2BabgydF4y2BaAF226603_45bp在289CL8C248群集中。gydF4y2BacgydF4y2Ba集群Ab-R18。gydF4y2BadgydF4y2BaAb-R19。gydF4y2BaegydF4y2BaAst-R87。gydF4y2BafgydF4y2BaAb-T145。gydF4y2BaggydF4y2BaAh-T118。gydF4y2BahgydF4y2BaAs-T119。gydF4y2Ba我gydF4y2BaAs-T153。gydF4y2BajgydF4y2BaAs-T175。gydF4y2BakgydF4y2Ba集群312CL17C141中的pAs120a。gydF4y2BalgydF4y2BaAst-R171。gydF4y2Ba米gydF4y2BaAst-T116。gydF4y2BangydF4y2BaAh-R31。gydF4y2BaogydF4y2BaAb-T159。gydF4y2BapgydF4y2BaAst-R176。重复的名称包括样本家族成员的物种起源:Ab,gydF4y2Ba燕麦属短gydF4y2Ba;啊,gydF4y2Ba答:hirtulagydF4y2Ba;Ast,gydF4y2Ba答:strigosagydF4y2Ba;为,gydF4y2Ba答:漂白亚麻纤维卷gydF4y2Ba重复式:T型,串联式;R,逆转录转座子gydF4y2Ba

返回文章页gydF4y2Ba