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表1中AGO、DCL和RDR基因的鉴定素类

来自:对AGO、DCL和RDR基因家族的全基因组分析表明,rna定向的DNA甲基化参与了果实脱落素类

基因名字 基因身份证Phytozome 基因身份证CSAP 位置 蛋白质
ORF长度(bp) 长度(AA) π 兆瓦(Da)
DCL CsDCL1 orange1.1g000174m orange1.1 t00584 ChrUn: 6828329 - 6838566(−strand) 5892 1963 5.96 219934年
CsDCL2a orange1.1g000607m Cs6g03520 Chr6: 3969936 - 3982992(−strand) 4191 1396 7.65 158488年
CsDCL2b orange1.1g003062m Cs6g03500 Chr6: 3910063 - 3922,849(−strand) 4206 1401 6.48 158770年
CsDCL3 orange1.1g000379m Cs4g06370 Chr4: 3914566 - 3925,649(+股) 4959 1652 7.95 184339年
CsDCL4 orange1.1g000380m Cs4g01340 Chr4: 255555-267,608(+股) 4902 1633 6.47 183256年
RDR CsRDR1a orange1.1g002586m Cs2g17570 Chr2: 14327852 - 14333,995(+股) 3399 1132 7.13 129642年
CsRDR1b orange1.1g003789m Cs5g14110 Chr5: 11659292 - 11663430(−strand) 3249 1082 6.04 122608年
CsRDR1c orange1.1g035741m - - - - - - 脚手架00168 - 67,689 - 71,577(−strand) 2910 969 8.58 110376年
CsRDR2 orange1.1g001183m Cs5g05170 Chr5: 3069393-3,074,020(+股) 3396 1131 6.59 128958年
CsRDR31 orange1.1g001771m Cs4g15260 Chr4: 14278137 - 14289,339(+股) 3048 1015 6.8 115671年
CsRDR6a orange1.1g041430m Cs7g05350 Chr7: 2849984-2,855,672(+股) 3594 1197 6.13 136437年
CsRDR6b2 orange1.1g048783m Cs1g14730 Chr1: 18022840 - 18027,238(+股) 3501 1166 6.01 132490年
CsAGO1 orange1.1g001466m Cs5g16710 Chr5: 15851375 - 15859,311(−strand) 3222 1073 9.38 118338年
CsAGO2a orange1.1g012649m Cs2g10760 Chr2: 8058870 - 8063,724(+股) 2946 981 9.29 110071年
CsAGO2b - - - - - - Cs2g10770 Chr2: 8075960 - 8080,634(+股) 2946 981 9.26 110304年
CsAGO4a orange1.1g002449m Cs2g29070 Chr2: 28612071-28,619,504(−strand) 2763 920 8.98 102998年
CsAGO4b orange1.1g002636m Cs3g06860 Chr3: 9639528 - 9647,482(+股) 2697 898 9.43 100950年
CsAGO5a1 orange1.1g002204m Cs7g17940 Chr7: 13746350-13,751,613(−strand) 2865 954 9.27 106773年
CsAGO5b2 orange1.1g003630m Cs7g17970 Chr7: 13774473-13,781,129(−strand) 2847 948 9.50 105299年
CsAGO5c2 - - - - - - Cs7g17930 Chr7: 13732122-13,738,824(−strand) 3021 1006 9.28 112004年
CsAGO5d - - - - - - Cs6g14430 Chr6: 15643144 - 15650,122(−strand) 2688 895 9.23 99978年
CsAGO6 orange1.1g002661m Cs2g20520 Chr2: 17331361-17,339,897(−strand) 2688 895 9.41 100500年
CsAGO6-like2 orange1.1g048669m Cs6g16080 Chr6: 17010270-17,016,001(−strand) 2814 937 9.71 105659年
CsAGO7 orange1.1g001684m Cs7g03360 Chr7: 1453333 - 14577453(−strand) 3093 1030 9.24 117036年
CsAGO10 orange1.1g001954m Cs9g07740 Chr9: 4853982 - 4862787(−strand) 2979 992 9.34 111516年
  1. 1植物群基因结构注释
  2. 2更新的基因结构注释