跳转到主要内容gydF4y2Ba

表2单核苷酸多态性与MCB抗茎秆隧穿显著相关。表中包含了亲本的基因型、具有有利等位基因和不利等位基因的ril数目、加值、关联显著性以及每个SNP解释的方差。之前的QTL实验在同一bin中检测到显著的SNPs显示在表格的最后一列gydF4y2Ba

来自:gydF4y2BaMAGIC玉米群体对玉米螟抗性的定位gydF4y2Ba

重要的SNPgydF4y2Ba一个gydF4y2Ba 箱子gydF4y2Ba A509gydF4y2Ba EP125gydF4y2Ba EP17gydF4y2Ba EP43gydF4y2Ba EP53gydF4y2Ba EP86gydF4y2Ba F473gydF4y2Ba PB130gydF4y2Ba 等位基因gydF4y2BabgydF4y2Ba (没有)gydF4y2BacgydF4y2Ba 添加剂的影响gydF4y2BadgydF4y2Ba 假定值gydF4y2BaegydF4y2Ba RgydF4y2Ba2 fgydF4y2Ba 先前的共定位QTL实验gydF4y2BaggydF4y2Ba
S1_19252698gydF4y2Ba 1.02gydF4y2Ba CgydF4y2Ba TgydF4y2Ba TgydF4y2Ba CgydF4y2Ba CgydF4y2Ba CgydF4y2Ba CgydF4y2Ba TgydF4y2Ba C / TgydF4y2Ba 381/132gydF4y2Ba 1.65gydF4y2Ba 4.6 e-05gydF4y2Ba 0.03gydF4y2Ba MCB EP42xEP39 [gydF4y2Ba17gydF4y2Ba];MCB EP125xPB130 [gydF4y2Ba49gydF4y2Ba]gydF4y2Ba
S1_290934634gydF4y2Ba 1.11gydF4y2Ba TgydF4y2Ba TgydF4y2Ba TgydF4y2Ba CgydF4y2Ba TgydF4y2Ba NgydF4y2Ba TgydF4y2Ba NgydF4y2Ba C / TgydF4y2Ba 64/274gydF4y2Ba 2.13gydF4y2Ba 9.9 e-05gydF4y2Ba 0.05gydF4y2Ba
S2_14798875gydF4y2Ba 2.02gydF4y2Ba TgydF4y2Ba CgydF4y2Ba NgydF4y2Ba CgydF4y2Ba CgydF4y2Ba CgydF4y2Ba NgydF4y2Ba CgydF4y2Ba T / CgydF4y2Ba 212/242gydF4y2Ba 1.48gydF4y2Ba 9.76 e-05gydF4y2Ba 0.03gydF4y2Ba
S2_179803199gydF4y2Ba 2.07gydF4y2Ba 一个gydF4y2Ba GgydF4y2Ba GgydF4y2Ba GgydF4y2Ba GgydF4y2Ba NgydF4y2Ba GgydF4y2Ba 一个gydF4y2Ba A / GgydF4y2Ba 170/348gydF4y2Ba 1.49gydF4y2Ba 9.9 e-05gydF4y2Ba 0.03gydF4y2Ba 欧洲央行B73xB52 [gydF4y2Ba50gydF4y2Ba];欧洲央行B73xDe811 [gydF4y2Ba51gydF4y2Ba];MCB EP125xPB130 [gydF4y2Ba49gydF4y2Ba]gydF4y2Ba
S3_191332395gydF4y2Ba 3.07gydF4y2Ba NgydF4y2Ba GgydF4y2Ba NgydF4y2Ba NgydF4y2Ba GgydF4y2Ba CgydF4y2Ba NgydF4y2Ba GgydF4y2Ba C / GgydF4y2Ba 138/269gydF4y2Ba 2.01gydF4y2Ba 4.7 e-06gydF4y2Ba 0.05gydF4y2Ba 欧洲央行[gydF4y2Ba30.gydF4y2Ba]gydF4y2Ba
S3_212770896gydF4y2Ba 3.08gydF4y2Ba G / CgydF4y2Ba 60/451gydF4y2Ba 2.16gydF4y2Ba 7.16 e-05gydF4y2Ba 0.03gydF4y2Ba
S3_218807815gydF4y2Ba 3.09gydF4y2Ba GgydF4y2Ba GgydF4y2Ba GgydF4y2Ba GgydF4y2Ba GgydF4y2Ba GgydF4y2Ba NgydF4y2Ba TgydF4y2Ba G / T)gydF4y2Ba 396/81gydF4y2Ba 1.87gydF4y2Ba 9.4 e-05gydF4y2Ba 0.03gydF4y2Ba 欧洲央行D06xD408 [gydF4y2Ba52gydF4y2Ba]gydF4y2Ba
S3_218807820gydF4y2Ba 3.09gydF4y2Ba GgydF4y2Ba GgydF4y2Ba GgydF4y2Ba GgydF4y2Ba GgydF4y2Ba GgydF4y2Ba NgydF4y2Ba 一个gydF4y2Ba G /gydF4y2Ba 397/80gydF4y2Ba 1.92gydF4y2Ba 6.5 e-05gydF4y2Ba 0.03gydF4y2Ba
S4_127856740gydF4y2Ba 4.05gydF4y2Ba TgydF4y2Ba NgydF4y2Ba GgydF4y2Ba GgydF4y2Ba NgydF4y2Ba GgydF4y2Ba GgydF4y2Ba GgydF4y2Ba G / T)gydF4y2Ba 372/97gydF4y2Ba 1.88gydF4y2Ba 8.0 e-05gydF4y2Ba 0.03gydF4y2Ba
S4_127955231gydF4y2Ba 4.05gydF4y2Ba 一个gydF4y2Ba 一个gydF4y2Ba GgydF4y2Ba GgydF4y2Ba NgydF4y2Ba GgydF4y2Ba GgydF4y2Ba GgydF4y2Ba G /gydF4y2Ba 399/128gydF4y2Ba 1.77gydF4y2Ba 3.6 e-05gydF4y2Ba 0.03gydF4y2Ba
S4_155128691gydF4y2Ba 4.06gydF4y2Ba TgydF4y2Ba TgydF4y2Ba TgydF4y2Ba NgydF4y2Ba TgydF4y2Ba NgydF4y2Ba TgydF4y2Ba TgydF4y2Ba G / T)gydF4y2Ba 63/345gydF4y2Ba 2.38gydF4y2Ba 1.2 e-05gydF4y2Ba 0.05gydF4y2Ba
S4_155830369gydF4y2Ba 4.06gydF4y2Ba CgydF4y2Ba NgydF4y2Ba CgydF4y2Ba NgydF4y2Ba CgydF4y2Ba CgydF4y2Ba NgydF4y2Ba CgydF4y2Ba T / CgydF4y2Ba 43/361gydF4y2Ba 2.55gydF4y2Ba 3.2 e-05gydF4y2Ba 0.05gydF4y2Ba
S4_155830370gydF4y2Ba 4.06gydF4y2Ba TgydF4y2Ba NgydF4y2Ba TgydF4y2Ba NgydF4y2Ba TgydF4y2Ba TgydF4y2Ba NgydF4y2Ba TgydF4y2Ba G / T)gydF4y2Ba 43/361gydF4y2Ba 2.55gydF4y2Ba 3.2 e-05gydF4y2Ba 0.05gydF4y2Ba
S4_155830400gydF4y2Ba 4.06gydF4y2Ba GgydF4y2Ba NgydF4y2Ba GgydF4y2Ba NgydF4y2Ba GgydF4y2Ba GgydF4y2Ba NgydF4y2Ba GgydF4y2Ba T / GgydF4y2Ba 43/361gydF4y2Ba 2.55gydF4y2Ba 3.2 E05gydF4y2Ba 0.05gydF4y2Ba
S4_156193095gydF4y2Ba 4.06gydF4y2Ba CgydF4y2Ba CgydF4y2Ba CgydF4y2Ba NgydF4y2Ba NgydF4y2Ba CgydF4y2Ba TgydF4y2Ba CgydF4y2Ba T / CgydF4y2Ba 78/308gydF4y2Ba 2.32gydF4y2Ba 2.8 e-06gydF4y2Ba 0.06gydF4y2Ba
S4_181340312gydF4y2Ba 4.09gydF4y2Ba CgydF4y2Ba TgydF4y2Ba NgydF4y2Ba NgydF4y2Ba CgydF4y2Ba TgydF4y2Ba NgydF4y2Ba NgydF4y2Ba T / CgydF4y2Ba 207/144gydF4y2Ba 1.69gydF4y2Ba 9.3 E05gydF4y2Ba 0.04gydF4y2Ba
S4_221752511gydF4y2Ba 4.09gydF4y2Ba NgydF4y2Ba NgydF4y2Ba GgydF4y2Ba GgydF4y2Ba NgydF4y2Ba GgydF4y2Ba GgydF4y2Ba GgydF4y2Ba A / GgydF4y2Ba 19/282gydF4y2Ba 3.68gydF4y2Ba 7.1 E05gydF4y2Ba 0.05gydF4y2Ba
S5_24771445gydF4y2Ba 5.03gydF4y2Ba 一个gydF4y2Ba NgydF4y2Ba GgydF4y2Ba GgydF4y2Ba GgydF4y2Ba 一个gydF4y2Ba GgydF4y2Ba GgydF4y2Ba G /gydF4y2Ba 345/117gydF4y2Ba 1.82gydF4y2Ba 2.4 e-05gydF4y2Ba 0.04gydF4y2Ba 欧洲央行D06xD408 [gydF4y2Ba52gydF4y2Ba];MCB B73xCML103 [gydF4y2Ba20.gydF4y2Ba]gydF4y2Ba
S6_147725553gydF4y2Ba 6.05gydF4y2Ba 一个gydF4y2Ba 一个gydF4y2Ba NgydF4y2Ba 一个gydF4y2Ba NgydF4y2Ba NgydF4y2Ba NgydF4y2Ba NgydF4y2Ba A / TgydF4y2Ba 401/49gydF4y2Ba 2.50gydF4y2Ba 4.6 e-05gydF4y2Ba 0.04gydF4y2Ba 欧洲央行B73xDe811 [gydF4y2Ba51gydF4y2Ba];MCB B73xCML103 [gydF4y2Ba20.gydF4y2Ba];MCB EP125xPB130 [gydF4y2Ba49gydF4y2Ba]gydF4y2Ba
S6_150800759gydF4y2Ba 6.05gydF4y2Ba 一个gydF4y2Ba 一个gydF4y2Ba NgydF4y2Ba 一个gydF4y2Ba GgydF4y2Ba GgydF4y2Ba GgydF4y2Ba GgydF4y2Ba A / GgydF4y2Ba 247/264gydF4y2Ba 1.42gydF4y2Ba 7.0 e-05gydF4y2Ba 0.03gydF4y2Ba
S6_156035854gydF4y2Ba 6.06gydF4y2Ba 一个gydF4y2Ba NgydF4y2Ba 一个gydF4y2Ba 一个gydF4y2Ba 一个gydF4y2Ba NgydF4y2Ba CgydF4y2Ba CgydF4y2Ba A / CgydF4y2Ba 356/179gydF4y2Ba 1.46gydF4y2Ba 8.2 e-05gydF4y2Ba 0.03gydF4y2Ba 欧洲央行D06xD408 [gydF4y2Ba52gydF4y2Ba];MCB EP125xPB130 [gydF4y2Ba49gydF4y2Ba]gydF4y2Ba
S6_164776991gydF4y2Ba 6.07gydF4y2Ba NgydF4y2Ba 一个gydF4y2Ba GgydF4y2Ba 一个gydF4y2Ba GgydF4y2Ba GgydF4y2Ba 一个gydF4y2Ba GgydF4y2Ba G /gydF4y2Ba 347/168gydF4y2Ba 1.55gydF4y2Ba 4.5 e-05gydF4y2Ba 0.03gydF4y2Ba 欧洲央行B73xMo47 [gydF4y2Ba50gydF4y2Ba];MCB EP125xPB130 [gydF4y2Ba49gydF4y2Ba]gydF4y2Ba
S7_109722251gydF4y2Ba 7.02gydF4y2Ba GgydF4y2Ba 一个gydF4y2Ba 一个gydF4y2Ba 一个gydF4y2Ba NgydF4y2Ba NgydF4y2Ba GgydF4y2Ba NgydF4y2Ba G /gydF4y2Ba 244/246gydF4y2Ba 1.42gydF4y2Ba 9.9 e-05gydF4y2Ba 0.03gydF4y2Ba 欧洲央行B73xB52 [gydF4y2Ba53gydF4y2Ba]gydF4y2Ba
S8_24527783gydF4y2Ba 8.03gydF4y2Ba NgydF4y2Ba GgydF4y2Ba GgydF4y2Ba GgydF4y2Ba NgydF4y2Ba NgydF4y2Ba GgydF4y2Ba GgydF4y2Ba T / GgydF4y2Ba 27/393gydF4y2Ba 3.00gydF4y2Ba 9.4 e-05gydF4y2Ba 0.04gydF4y2Ba 欧洲央行B73xMo47 [gydF4y2Ba50gydF4y2Ba]gydF4y2Ba
S8_28525990gydF4y2Ba 8.03gydF4y2Ba TgydF4y2Ba GgydF4y2Ba GgydF4y2Ba GgydF4y2Ba GgydF4y2Ba GgydF4y2Ba GgydF4y2Ba GgydF4y2Ba T / GgydF4y2Ba 59/502gydF4y2Ba 2.16gydF4y2Ba 8.2 E05gydF4y2Ba 0.03gydF4y2Ba
S8_28526020gydF4y2Ba 8.03gydF4y2Ba 一个gydF4y2Ba CgydF4y2Ba CgydF4y2Ba CgydF4y2Ba CgydF4y2Ba CgydF4y2Ba CgydF4y2Ba CgydF4y2Ba A / CgydF4y2Ba 59/503gydF4y2Ba 2.16gydF4y2Ba 8.1 e-05gydF4y2Ba 0.03gydF4y2Ba
S8_28526026gydF4y2Ba 8.03gydF4y2Ba CgydF4y2Ba 一个gydF4y2Ba 一个gydF4y2Ba 一个gydF4y2Ba 一个gydF4y2Ba 一个gydF4y2Ba 一个gydF4y2Ba 一个gydF4y2Ba C /一个gydF4y2Ba 59/503gydF4y2Ba 2.16gydF4y2Ba 8.1 E05gydF4y2Ba 0.03gydF4y2Ba
  1. 一个gydF4y2Ba下划线(_)前的数字表示染色体数目,下划线(_)后的数字表示SNP在bp中的物理位置gydF4y2Ba
  2. bgydF4y2Ba斜杠(/)前的等位基因增加性状,斜杠后的等位基因减少性状gydF4y2Ba
  3. cgydF4y2Ba否=一个给定变种的纯合株数。斜杠前的数字表示增加性状的等位基因,斜杠后的数字表示减少性状的等位基因gydF4y2Ba
  4. dgydF4y2Ba加性效应计算为增加性状的等位基因的纯合子平均值与减少性状的纯合子平均值之差的一半gydF4y2Ba
  5. egydF4y2Ba根据观测到的F与预期的偏差,显著性阈值为p = 1 × 10gydF4y2Ba−4gydF4y2Ba
  6. fgydF4y2BaRgydF4y2Ba2gydF4y2Ba即SNP所解释的表型变异的比例gydF4y2Ba
  7. ggydF4y2Ba在第一个地方我们展示了玉米螟的种类,在第二个地方展示了绘制种群,在第三个地方展示了参考文献。不同的实验用分号隔开gydF4y2Ba