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表3站点分析,分支站点分析中的参数ppdk

从:C的识别和演变4.植物中的光合途径基因

使用的测试 前树分支 模型 ω lnl 参数的估计 DF. P. BEB下的积极选择的地点
站点分析 - M0 :(单比) 0.1 -34,454.01 ω= 0.095 - - -
- M3 :(离散) 0.11 -32,794.04 p0. = 0.562 ω0. = 0.009 4. 0.000(M0 vs M3) -
p1 = 0.3021 = 0.117
p2 = 0.136 ω2 = 0.521
分支分析 - M0 - -34,454.01 ω= 0.095 - - -
- 一种 - - 34,433.04 ω0=0.0979Ω1 = 0.0006 1 <0.0001 -
- b - -34,444.44 ω0. = 0.097 ω1 = 0.024 1 <0.0001 -
- C - -34,441.56 ω0=0.098Ω1 = 0.026 1 <0.0001 -
- d - -34,453.87 ω0. = 0.095 ω1 = 0.078 1 0.606 -
- E. - -34,443.74 ω0. = 0.093 ω1 = 0.284 1 <0.0001 -
分支站点分析 - M1 - -33,410.98 p0. = 0.844 p1 = 0.156 - - -
一种 模型A。 - -33,410.98 p0 = 0.844 p1 = 0.156(p2a + p2B. = 0.000) 2 1.0000(Modela vs M1) 概率> 0.6(257i)
ω2= 1.000
b 模型A。 - -33,410.98 p0. = 0.844 p1 = 0.156 (p2a + p2B. = 0.000) 2 1.0000(Modela vs M1) 概率> 0.6(337R)
ω2= 1.000
C 模型A。 - - 33,410.98 p0. = 0.844 p1 = 0.156 (p2a + p2B. = 0.000) 2 1.0000(Modela vs M1) 概率> 0.6(否)
ω2 = 1.000
d 模型A。 - -33,410.98 p0. = 0.844 p1 = 0.156 (p2a + p2B. = 0.000) 2 1.0000型号与M1) 概率> 0.6(否)
ω2= 1.000
E. 模型A。 - -33,400.15 p0. = 0.810 p1 = 0.147 (p2a + p2B. = 0.044) 2 <0.0001(Modela vs M1) 概率> 0.6(24 N,95A一种,174i,359a,459g,489a,559eb,561克)
ω2 = 3.507
  1. 一种后概率> 95%
  2. b后概率> 99%