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表1本研究分析的菌核病抗头腐病候选基因(CGs)。在AMP中成功扩增的cg被划线。一个本文中使用的首字母缩略词。Gene target,染色体,Gene start and Gene end指的是Badouin et al.(2017)注释的基因,可在heliagene.org

来自:向日葵抗核霉病的遗传基础研究

向日葵ID一个 参考 褶皱变化 p价值 测序引物 基因的目标 基因开始(bp) 基因(bp)结束 染色体
菌核菌差异表达分析(向日葵 HeAn_12562 Ehrenbolger等人(2013)49 2.36 0.01 F: 5 'agcccagtgtcaaatcaacc3 ' AtRLP48 85297951年 85299659年 HanXRQChr10
R: 5 ' tccatacttacggttccactca 3 '
HeAn_12761 Ehrenbolger等人(2013)49 0.31 0.001 F: 5 'atgcaagcatgtgaagcagt 3 ' PLY2 39465262年 39466985年 HanXRQChr17
R: 5 'ccccaagcaacatgactttt 3 '
HeAn_28738 Ehrenbolger等人(2013)49 2.95 0.001 F: 5 ' ggtggaccattttcatcaagg 3 ' HanXRQChr14g0449241 # # # # # # # # # # # # # # # # HanXRQChr14
R: 5 ' cgtgggacagcaacactaaa 3 '
Hean_315 Ehrenbolger等人(2013)49 −2.5 0.052 F: 5 ' ccactcatctccccaaaaa 3 ' HSP41 12595842年 12596417年 HanXRQChr06
R: 5 'caccttcgccactttaatcc 3 '
HeAn_35791 Ehrenbolger等人(2013)49 −2.78 0.001 F: 5 'ccgtcaccattttcacattg3 ' HanXRQChr13g0415061 # # # # # # # # # # # # # # # # HanXRQChr13
R: 5 'taaattttgggaaccggaca3”
HeAn_36589 Ehrenbolger等人(2013)49 −3.7 0.055 F: 5 'ctccgcaacctccactacat 3 ' HSP21 84168138年 84168620年 HanXRQChr03
R: 5 'gaggcagcttctccacagtc 3 '
HeAn_41021 Ehrenbolger等人(2013)49 12.50 0 F: 5 ' cgtcttcgttgcatcat3 ' HanXRQChr16g0506041 39200062年 39209510年 HanXRQChr16
R: 5 'aggaggaggatgaggagcat 3 '
HeAn_41022 Ehrenbolger等人(2013)49 −4.55 0 F: 5 'caggccaaagtcgagaatgt 3 ' ASF2 39035731年 39038365年 HanXRQChr16
R: 5 ' cacaagggaaacaaacactg 3 '
菌核菌差异表达分析(芸苔属植物显著 G21 赵等人(2007)34] AT3G17130 18.74 4.49 e-5 F: 5 ' tgaaggtccatctcctcttattttc 3 ' HanXRQChr13g0395221 59003751年 59004311年 HanXRQChr13
R: 5 ' gtcgctaaagctccgttcac 3 '
赵等人(2007)34 18.03 4.82 e-6 F: 5 ' ggaaccttatccacccgaat 3 ' HanXRQChr06g0170521 17800642年 17804614年 HanXRQChr06
AT4G03400 R: 5 ' gcaaatctttctcggtgtcc 3 '
G26 赵等人(2007)34 14.92 9.72 e-6 F: 5 ' ctgatgagtggtcggaggtt 3 ' HanXRQChr10g0292811 95584317年 95586370年 HanXRQChr10
AT3G10190 R: 5 ' ccatcattgtcggcgtcta 3 '
G28 赵等人(2007)34] AT1G19100 14.23 8.31 e - F: 5 ' caggatagtagtcccgatggtg 3 ' HanXRQChr15g0463011 95505年 102279年 HanXRQChr15
R: 5 ' tcaaaggttccagtcgcaaa 3 '
G30 赵等人(2007)34 12.17 1.20 e - F: 5 ' cccgacacttattaagactcg 3 ' HanXRQChr13g0406751 # # # # # # # # # # # # # # # # HanXRQChr13
AT5G02140 R: 5 ' gctgatcctagtcaacaactgc 3 '
G33 赵等人(2007)34 12.16 1.20 e-5 F: 5 ' ttgcattatcctgattgttattatcttg 3 ' HanXRQChr16g0509301 62305294年 62307846年 HanXRQChr16
AT3G19630 R: 5 ' ttgatgaattataccaacctaccaaa 3 '
G34 赵等人(2007)34 13.89 3.97 e - F: 5 ' taggcgatcgatgctcactt 3 ' HanXRQChr14g0449241 # # # # # # # # # # # # # # # # HanXRQChr14
AT3G28390 R: 5 ' tcaaggcgagtagggtaagc 3 '
菌核病的头腐病和茎腐病关联图(向日葵 HaGLP3 Fusari等人(2012)17 _ _ F: 5 ' tcacattctcttcatcctatgctc 3 ' HanXRQChr12g0360281 18742800年 18743470年 HanXRQChr12
R: 5 ' ccagttccaccaagaacagc 3 '
HaGLP4 Fusari等人(2012)17 _ _ F: 5 ' tgcttgtaacctcctcctcctcctcct3 ' AB19A # # # # # # # # # # # # # # # # HanXRQChr10
R: 5 ' tgtgggaaaagcatgatgtc 3 '
HaGLP5 Fusari等人(2012)17 _ _ F: 5 ' tcaagtgctatggctactaatgattt 3 ' HanXRQChr06g0181801 74845978年 74847869年 HanXRQChr06
R: 5 'tcgatgtataaatgtatggtaaaagaa 3 '
HaCOI_1 Talukder等人(2014)18 _ _ F: 5 ' ccgatttgccactggataac 3 ' COI1 # # # # # # # # # # # # # # # # HanXRQChr14
R: 5 ' acacgctggatagtcgttcc 3 '
HaCP Fusari等人(2012)17 _ _ F: 5 ' tgctattgatgctggcagtt 3 ' CYSEP # # # # # # # # # # # # # # # # HanXRQChr09
R: 5 ' aatcatgtttcacataccaaatctt 3 '
HaDRP Fusari等人(2012)17 _ _ F: 5 ' caaaggaagcaacaacacca 3 ' HanXRQChr01g0029501 # # # # # # # # # # # # # # # # HanXRQChr01
R: 5 ' tcgctgattcgatacccttt 3 '
HaPAL Fusari等人(2012)17 _ _ F: 5 ' tgtggtcttcaaattcattaataacc 3 ' PAL1 62564693年 62568081年 HanXRQChr07
R: 5 ' ggccattcctaacaggatca 3 '
HaTRP Fusari等人(2012)17 _ _ F: 5 ' tttttaggccaacctcac 3 ' HanXRQChr16g0506311 40982842年 40983492年 HanXRQChr16
R: 5 ' cccttaatcataattcacgaatgtc 3 '
HaWP Fusari等人(2012)17 _ _ F: 5 ' ccaaacccgatgatgataaa 3 ' HanXRQChr10g0289571 69322685年 69323065年 HanXRQChr10
R: 5 ' aacaaacaaacaagccacatt 3 '
HaWRKY5 Fusari等人(2012)17 _ _ F: 5 ' acaccctcaacttgcaccaaa 3 ' HanXRQChr17g0533851 2017423年 2019342年 HanXRQChr17
R: 5 ' gcccatggatctgaagacaaa 3 '
HaWRKY7 Fusari等人(2012)17 _ _ F: 5 ' caagccgctagagatggaac 3 ' HanXRQChr16g0509771 66374292年 66377376年 HanXRQChr16
R: 5 ' tcaaccctgtggtgttttga 3 '
HaRhobp_B Fusari等人(2012)17 _ _ F: 5“TTGAGGGATTCTAATTGTTATAGTTGA3” ATROPGEF7 85118928年 85122332年 HanXRQChr08
R: 5 ' TTCGGGTGTTCGTCCTTTT 3 '