来自:濒危半水生开花植物关键光合基因的降解Saniculiphyllum guangxiense(Saxifragaceae)
物种 | 现场采集位置 | 测序技术 | 采集数据(植物标本室) | 加入基因库 | 总测序工作量(数百万次读取) | 质体基因组平均覆盖率(减少的数据) | 质体组装长度 | 反向重复长度 |
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Boykinia aconitifolia | 美国北卡罗来纳州,阿勒哈尼县 | BGI-SEQ | 民谣249 (FLAS) | MN496058 | 734.3 | 374.8× | 154368个基点 | 25769个基点 |
连香 | 培养 | BGI-SEQ | Whitten 5886 (FLAS) | MN496059 | 799.1 | 394.8× | 159897个基点 | 26434个基点 |
Daphniphyllum macropodum | 培养 | BGI-SEQ | Whitten 5884 (FLAS) | MN496060 | 684.5 | 66.0× | 160408个基点 | 26605个基点 |
Fortunearia sinensis | 培养 | BGI-SEQ | 民间253年 (佛罗里达州) |
MN496061 | 727.7 | 90.2× | 159413个基点 | 26274个基点 |
Heuchera abramsii | 美国加利福尼亚州洛杉矶县 | Illumina公司HiSeq | 民间I-40 (OS) | MN496062 | 211.8 | 710.3× | 155527个基点 | 25838个基点 |
Heuchera阿尔巴 | 潘德尔顿县,西弗吉尼亚州,美国 | Illumina公司HiSeq | Folk 63 (OS) | MN496063 | 160.8 | 252.4× | 155360个基点 | 25632个基点 |
Heuchera丛生 | 美国加利福尼亚州文图拉县 | Illumina公司HiSeq | 民谣48 (OS) | MN496064 | 171.7 | 490.5× | 155520个基点 | 25834个基点 |
Heuchera eastwoodiae | 亚瓦派县,美国亚利桑那州 | Illumina公司HiSeq | 民俗35 (OS) | MN496065 | 82.3 | 336.0× | 155174个基点 | 25605个基点 |
白毛草 | 美国爱达荷州爱达荷县 | Illumina公司HiSeq | Folk 160 (OS) | MN496066 | 226.6 | 742.7× | 155493个基点 | 25645个基点 |
Heuchera longipetalavar。longipetala | 培养 | Illumina公司HiSeq | 民间I-21 (OS) | MN496067 | 223.6 | 768.3× | 155418个基点 | 25638个基点 |
Heuchera墨西哥var。墨西哥 | 培养 | BGI-SEQ | Folk I-51 (OS) | MN496068 | 710.8 | 150.3× | 155451个基点 | 25638个基点 |
乌塔hensis | 培养 | Illumina公司HiSeq | 民间I-56 (OS) | MN496069 | 273.3 | 738.5× | 155350个基点 | 25633个基点 |
Leptarrhena pyrolifolia | 美国华盛顿州斯卡吉特县 | BGI-SEQ | 弗罗伊登斯坦3069 (FLAS) | MN496070 | 752.2 | 253.8× | 155055个基点 | 25781个基点 |
臂吊带diphylla | 门罗县,美国俄亥俄州 | Illumina公司HiSeq | Folk 88 (OS) | MN496071 | 230.8 | 357.0× | 155646个基点 | 25753个基点 |
臂吊带pentandra | 美国华盛顿,金县 | Illumina公司HiSeq | 民俗128 (OS) | MN496072 | 264.4 | 341.2× | 155470个基点 | 25620个基点 |
Mukdenia俄罗斯 | 培养 | BGI-SEQ | 民间259 (FLAS) | MN496073 | 799.0 | 330.9× | 156927个基点 | 25585个基点 |
Oresitrophe rupifraga | 培养 | BGI-SEQ | 民间257年 (佛罗里达州) |
MN496074 | 678.1 | 261.3× | 156787个基点 | 25586个基点 |
酷栗nevadense | 沙斯塔县,加利福尼亚州,美国 | BGI-SEQ | 尼尔森2018-028 (FLAS) | MN496075 | 782.7 | 234.3× | 157715个基点 | 25887个基点 |
酷栗roezlii | 沙斯塔县,加利福尼亚州,美国 | BGI-SEQ | 尼尔森2018-027 (FLAS) | MN496076 | 723.6 | 262.7× | 157781个基点 | 25967个基点 |
Rodgersia sambucifolia | 培养 | BGI-SEQ | R.A.民谣266 (FLAS) | MN496077 | 637.3 | 193.2× | 157289个基点 | 25556个基点 |
Saniculiphyllum guangxiense | 中国云南省阜宁县 | Illumina公司HiSeq | 湘1271(坤) | MN496078 | 180.9 | 179.6× | 151704个基点 | 26109个基点 |
虎耳草属多茎目 | 培养 | BGI-SEQ | 民间258 (FLAS) | MN496079 | 623.5 | 238.2× | 151060个基点 | 25412个基点 |
Sycopsis sinensis | 培养 | BGI-SEQ | 民间256年 (佛罗里达州) |
MN496080 | 746.2 | 117.7× | 159043个基点 | 26230个基点 |