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表1在PVA感染和健康样品中常见的蛋白质的丰富蛋白质的差异(基团H3P3,H3P2,H2P3,H2P2,H2P2,图。1)通过使用归一化光谱丰度因子 - 电力法全球错误模型(NSAF-PLGEM)分析
从:病毒感染和健康马铃薯叶的核蛋白质组
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描述 (Solanum Tuberosum.组Phureja DM1-3)一种 |
描述(BLAST2GO搜索)B. |
NSAF值C(健康) |
NSAF值C(PVA感染) |
FDR.D. |
得分_h1. |
得分_h2. |
得分_H3. |
得分_p1. |
得分_p2. |
得分_p3. |
PGSC0003DMP400024227. |
Kunitz胰蛋白酶抑制剂 |
米科林蛋白样 |
NA. |
0.0004 |
0.0008 |
0.0066 |
0.0038 |
0.0015. |
0.01 |
PGSC0003DMP400053772. |
60S核糖体蛋白L13 |
60S核糖体蛋白L13-1 |
NA. |
0.0020. |
0.0031 |
0.0214 |
0.0030. |
0.0029 |
0.02 |
PGSC0003DMP400052757. |
组蛋白H2B. |
可能组蛋白H2B.3. |
0.1485. |
0.0481 |
0.0419. |
NA. |
0.0473 |
0.0380 |
0.03 |
PGSC0003DMP400062436 |
核糖体蛋白L23 |
60s核糖体蛋白L23a样 |
0.0093 |
NA. |
0.0012. |
NA. |
0.0008 |
0.0011. |
0.03 |
PGSC0003DMP400031685. |
核糖体蛋白L27A |
60S核糖体蛋白L27A-3样 |
NA. |
0.0008 |
0.0008 |
0.0049 |
0.0015. |
0.0011. |
0.05 |
PGSC0003DMP400024215. |
P18. |
组蛋白脱乙酰酶复合亚基SAP18 |
NA. |
0.0016. |
0.0008 |
0.0082 |
0.0008 |
0.0011. |
0.05 |
PGSC0003DMP400042811. |
60S核糖体蛋白L18 |
60S核糖体蛋白L18-2 |
NA. |
0.0020. |
0.0027 |
0.0082 |
0.0057 |
0.0033 |
0.05 |
PGSC0003DMP400052999. |
脾蛋白蛋白 |
U2小核核糖核蛋白B“ |
0. |
0.0016. |
0.0012. |
0.0082 |
0.0019. |
0.0015. |
0.05 |
- 一种描述 (Solanum Tuberosum.组phureja dm1-3基因组注释v3.4)
- B.描述(Blast2Go搜索蛋白质序列)
- CNormalized.S.pectral.一种bF蛋白质的演员。得分_h1-h3和得分_p1-p3表示每次三个实验的值。na,不适用
- D.虚假发现率值