| 干旱 |
谷子 |
19 lncRNAs |
19 |
2000年IlluminaHiSeq存在 |
对照干旱胁迫反应 |
［59］ |
| 干旱 |
杨树trichocarpa |
2542年lincRNAs |
504 |
2000年HiSeq™,RT-qPCR |
干旱——应激反应 |
［56］ |
| 干旱 |
大米 |
98年lncRNAs |
98 |
Illumina HiSeq 2500, qRT-PCR |
在干旱反应中的调节作用 |
［57］ |
| 干旱 |
拟南芥 |
干旱诱导的lncRNA (DRIR) |
干旱诱导的lncRNA (DRIR) |
2000年HiSeq RT-qPCR |
参与对干旱反应基因的调控 |
［37］ |
| 干旱 |
大米 |
3714 |
21 |
RT-qPCR, PLncPRO |
干旱胁迫下差异表达 |
［72］ |
| 干旱 |
小麦 |
- - - - - - |
59110年 |
Illumina公司HiSeq。2000年,中存在 |
干旱胁迫反应下的差异表达 |
［73］ |
| 干旱和寒冷 |
木薯 |
682年lncRNAs |
318 |
HiSeq 2500,qRT-PCR, CNCI, CPC， |
激素信号转导、蔗糖代谢途径等。 |
［60］ |
| 干旱 |
Pyrus betulifolia |
14478年 |
251 |
Illumina HiSeq 4000, CNCI, CPC, qRT-PCR |
各种代谢过程 |
［70］ |
| 干旱 |
黍virgatum L |
16551年的小说《lncRNAs |
1597 |
HiSeq2500,存在 |
调节干旱胁迫响应 |
［52］ |
| 干旱 |
玉米 |
3488 |
1535 |
Illumina HiSeq 2500, qRT-PCR |
氧化还原酶活性，水结合，电子载体活性 |
［54］ |
| 干旱 |
Cleistogenes songorica |
3397年lncRNAs |
468 |
HiSeq2500, CPC, CNCI, CPATqRT-PCR |
调节干旱胁迫响应 |
［62］ |
| 干旱 |
木薯 |
833 |
124 |
Hiseq 4000, qRT-PCR, CNCI, CPC， |
细胞相关代谢、卡尔文循环、激素代谢等。 |
［53］ |
| 干旱 |
木薯 |
1405 |
185 |
中存在 |
褪黑素反应控制干旱胁迫反应 |
［74］ |
| 干旱 |
木薯 |
1379 |
194 |
中存在 |
ABA信号调节 |
［71］ |
| 热应力 |
小麦 |
125年的 |
77 |
Solexa测序技术小麦Affymetrix基因芯片，qRT-PCR |
热响应性 |
［75］ |
| 热应力 |
芸苔属植物拉伯ssp。对 |
4594年的lncRNAs |
1686 |
Illumina Hiseq. 2500, qRT-PCR CPC,CNCI |
这些RNA的差异表达表明不同的植物激素参与了热胁迫耐受。 |
［64］ |
| 热应激和干旱 |
芸苔属植物juncea |
7613年的lncRNAs |
1614 |
中存在 |
与干旱和热应激下的酶和非酶抗氧化剂有关 |
［76］ |
| 冷和热 |
Chinease卷心菜 |
10001年 |
2236 |
Illumina HiSeq™2000 qRT-PCR, CPC |
共调控冷热靶基因67个和192个 |
［77］ |
| 冷应激 |
香蕉 |
12462年lncRNAs |
20. |
Illumina HiSeqTM 4000, qPCR, CPC |
冷应激反应 |
［78］ |
| 冷应激 |
拟南芥 |
379 |
135 |
Illumina HiSeq 2500, RT-qPCR |
寒冷或冰冻的适应 |
［79］ |
| 冷应激 |
拟南芥 |
SVALKA |
SVALKA |
|
抑制CBF1表达和抗冻性 |
［80］ |
| 冷应激 |
小道消息 |
2088 |
466 |
HiSeq 2500, qRT-PCR, CNCI, CPC， |
与冷应激反应有关 |
［81］ |
| 冷应激 |
白菜 |
2088 |
549 |
Illumina HiSeqTM 2000, qPCR |
控制春化 |
［82］ |
| 冷应激 |
大米 |
1485年lncRNAs |
566 |
Illumina HiSeq 2500平台，qRT-PCR |
控制冷应激反应 |
［83］ |
| 冷应激 |
Medicago |
|
|
|
|
|
|
truncatula |
24368年独特lncRNAs |
983年和1288年 |
4000年Illumina公司HiSeq Q-PCR |
控制冷应激反应 |
［84］ |
| 盐度 |
拟南芥 |
干旱诱导的lncRNA (DRIR) |
干旱诱导的lncRNA (DRIR) |
2000年HiSeq RT-qPCR |
参与盐度响应基因的调控 |
［37］ |
| 盐度和干旱 |
鹰嘴豆 |
3457 |
13 |
RT-qPCR, PLncPRO |
干旱和盐胁迫下的差异表达 |
［72］ |
| 盐度 |
大麦 |
CNT0018772和CNT0031477 |
2 |
qPCR |
在盐度胁迫中具有上下调节作用 |
［85］ |
| 盐度 |
棉花 |
1117年独特lncRNAs |
44 |
Illumina HiSeq 4000 RT-qPCR |
控制盐胁迫基因 |
［86］ |
| 盐度和硼 |
玉米 |
48345年 |
1710 |
Illumina MiSeq, RT-qPCR, AgriGO |
烟草胺的生物合成和代谢过程，基因调控 |
［87］ |
| 盐度 |
杨树 |
10,646和10,531个lncrna |
8592年和3425年 |
HiSeq 2500 |
调节osmotin 34，NHX7RARE-COLD -诱导2 b,和WRKY基因33 |
|
| 镉的压力 |
大米 |
3558 |
69个lncrna上调，75个lncrna下调 |
Illumina HiSeq 2000,CPC, RT-qPCR |
与光合途径相关的基因参与了对Cd胁迫的响应 |
［88］ |
| 和盐度 |
小麦 |
44698年 |
2064年和2278年 |
|
在许多生物过程中起调节作用 |
［89］ |
| Ca2＋声道输出的拦截器 |
小麦 |
6309 |
177 |
HiSeqTM2000,存在 |
影响各种生物过程 |
［90］ |
| 氧化应激 |
大米 |
7000年lncRNAs |
|
Hiseq2000, DEGSeq |
下调聚腺苷化lncrna参与非生物胁迫耐受 |
［91］ |
| 洪涝灾害 |
玉米 |
6099 |
3190 |
Illumina HisSeq 4000, qRT-PCR |
代谢途径，如糖酵解和蛋氨酸代谢对水淹的反应 |
［92］ |
| 磷酸饥饿 |
拟南芥 |
1212年的小说《lncRNAs |
309 |
Illumina公司Hiseq 2000/2500, |
磷酸饥饿信号与调控 |
［93］ |
|
|
|
|
中存在 |
细胞壁组织和光合作用 |
|
| 缺磷 |
Medicago truncatula |
785 |
358年和224年 |
Illumina公司Hiseq2000、qRT-PCRCPC CNCI |
参与各种信号转导，化学解毒 |
［61］ |
| 磷利用效率 |
大麦 |
188年和209年 |
- - - - - - |
Illumina公司测序,存在 |
与磷酸盐饥饿有关 |
［94］ |
| 缺氮 |
杨树 |
388 |
126 |
|
低营养的适应 |
［95］ |
| 缺氮 |
玉米 |
7245 |
637 |
Illumina公司HiSeq™2500年,共产党,qPCR |
氮代谢，氧化磷酸化 |
［96］ |
| 缺氮 |
大米 |
2588个推测的lncRNA |
2588 |
Illumina HiSeq 2500, qRT-PCR |
n-饥饿反应的调节作用 |
［14］ |
| 缺氮 |
大麦 |
498年lncRNAs |
56 |
Illumina Hiseq Xten平台 |
n-饥饿反应的调节作用 |
［97］ |
|
|
|
|
qPCR |
|
［98］ |
| 缺硼 |
枳壳 |
2101年独特lncRNAs |
|
Illumina HiSeq X Ten平台 |
b饥饿反应的调节作用 |
|
|
trifoliata |
|
|
中存在 |
|
|
| 低营养不足 |
拟南芥 |
60个差异表达的lincrna |
60个差异表达的lincrna |
HiSeq2000TM,存在 |
控制各种营养反应 |
［99］ |
| 中国共产党=编码潜在的计算器 |
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| CNCI = Coding-Non-Coding指数 |
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| 编码潜能评估工具 |
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