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表1
新创
非洲菊叶片转录组组装。非洲菊转录组是由一个抗白粉病(UFGE 4033)和一个易感(06-245-03)选育系的短读cDNA序列构建而成的,使用了四个汇编器(Trinity, TransAbyss, SoapDenovo和Velvet pipeline)。
来自:
非洲菊叶片转录组的测序和分析揭示了抗病性和易感基因的差异表达,并与白粉病抗性相关
特性
值
记录分布
成绩单数量(编号)
145348年
最小的成绩单(基地)
125
最大的成绩单(基地)
32039年
核苷酸的总数
111409237年
平均抄本长度(碱基)
761
200个碱基以下的转录本
4903
超过1000个碱基的转录本
31896年
转录本超过10000个碱基
10
带有开放式阅读框架的成绩单
67312年
意味着ORF百分比
81.21
装配长度
n90
358
n70
617
将军
1124
n30
1837
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