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表2植物激素相关基因表达情况

来自:比较蛋白质组学和转录组学分析为蓖麻种子大小的形成提供了新的见解

通路 基因名字 基因身份证 ZB107
(RPKM)
ZB306
(RPKM)
log2 FC 假定值 罗斯福
生长素 AUX1 29741年.t000002 0.86 3.68 2.1 9.58 e-20 2.23 e-19
AUX1 28883年.t000036 80.12 0.86 −6.54 0 0
TIR1 29908年.t000274 30.59 5.71 −2.42 9.34 e - 230 1.07 e - 228
辅助| IAA 29844年.t000020 1.26 3.45 1.46 3.59 e-05 5.60 e-05
辅助| IAA 28179年.t000006 232.36 56.82 −2.03 0 0
ARF10 27538年.t000014 74.25 12.3 −2.59 0 0
ARF2 29647年.t000040 21.7 74.29 1.78 0 0
GH3 28152年.t000001 394.07 113.06 −1.8 0 0
阿富汗二月 29838年.t000091 0.18 43.59 7.92 2.44 e - 139 1.84 e - 138
阿富汗二月 29739年.t000134 40.68 12.65 −1.69 5.39 e-50 1.95 e-49
与原 CRE1 29005年.t000011 101.67 2.08 −5.61 0 0
AHP4 29912年.t000167 18.47 120.46 2.71 6.50 e - 248 8.01 e - 247
AHP1 29726年.t000066 91.15 26.59 −1.78 3.85 e - 113 2.44 e - 112
B-ARR 29950年.t000033 21.97 0.44 −5.63 4.71 e - 215 5.11 e - 214
A-ARR 29908年.t000174 47.41 20.25 −1.23 2.01 e-51 7.43 e-51
遗传算法 GID1 29686年.t000008 28.97 3.86 −2.91 2.58 e - 142 1.97 e - 141
GID2 30170年.t000622 40.12 12.36 −1.70 3.00 e-55 1.16 e-54
德拉 29807年.t000012 71.54 8.52 −3.07 0 0
阿坝 PP2C 30075年.t000035 0.07 273.45 12.01 0 0
PP2C 30128年.t000337 69.77 14.66 −2.25 0 0
SnRK2 28725年.t000009 175.59 66.55 −1.40 0 0
SnRK2 29908年.t000118 10.86 22.02 1.02 3.62 e-27 9.62 e-27
沛富 29801年.t000121 55.02 15.19 −1.86 1.35 e - 201 1.39 e - 200
乙烯 ETR 28802年.t000007 49.56 19.23 −1.37 1.09 e - 198 1.10 e - 197
ETR 29680年.t000086 21.25 87.53 2.04 2.69 e - 155 2.20 e - 154
CTR1 29678年.t000014 43.32 10.27 −2.08 8.75 e - 205 9.11 e - 204
CTR1 30147年.t000229 18.26 38.74 1.09 1.08 e-53 4.08 e-53
MPK6 29688年.t000016 47.68 20.31 −1.23 3.95 e - 63 1.65 e - 62
EIN2 30078年.t000113 76.78 25.36 −1.60 0 0
EIN3 30169年.t000172 20.42 9.36 −1.13 5.01 e-53 1.88 e-52
EBF1/2 29848年.t000185 130.53 16.02 −3.03 0 0
ERF1/2 30147年.t000602 1.74 0.59 −1.56 0 0
BR BAK1 30190年.t000257 92.68 5.03 −4.20 0 0
BRI1 29950年.t000019 0.13 79.08 9.23 0 0
BRI1 29820年.t000032 25.76 0.34 −6.23 0 0
BKI1 30170年.t000310 5.19 0.55 −3.23 8.68 e-19 1.98 e-18
BSK 30190年.t000453 42.70 12.11 −1.82 6.44 e - 97 3.60 e - 96
BSU1 30128年.t000269 40.56 19.45 −1.06 1.46 e - 100 8.36 e - 100
BZR1/2 29646年.t000010 120.71 43.54 −1.47 3.29 e - 232 3.79 e - 231
TCH4 30041年.t000001 37.08 6.77 −2.45 2.06 e - 91 1.10 e - 90
CYCD3 29168年.t000023 16.16 2.08 −2.96 4.11 e - 93 2.23 e - 92
  1. RPKM (Reads Per kb Per Million Reads)表示一个基因的表达水平
  2. FC, ZB306/ZB107的log2折叠变化
  3. FDR, False Discovery Rate,在多次测试和分析中确定合适的p值阈值的方法