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图4 | BMC Plant BiologygydF4y2Ba

图4gydF4y2Ba

来自:gydF4y2BaDRIK1是一种应激反应类受体假激酶,其晶体结构揭示了ATP结合缺失的分子基础gydF4y2Ba

图4gydF4y2Ba

晶体结构的gydF4y2BaZm评选gydF4y2BaDRIK1 apo形式。gydF4y2Ba一个gydF4y2Ba卡通代表gydF4y2BaZm评选gydF4y2BaDRIK1-KD结构的载脂蛋白形式。结构特点:富含甘氨酸(p -环青色;铰链区域-黄色;催化循环粉色;DLE(更常见的DFG)图案-蓝色;激活段-橙色;C-helix——紫色。其他蛋白质区域是绿色的。gydF4y2BabgydF4y2Ba仔细看看ATP捆绑袋。对ATP结合和口袋稳定很重要的氨基酸以棒状表示(黄色的碳;氧气在红色;蓝色为氮),红色虚线为它们之间的相互作用。氨基酸表面LeugydF4y2Ba240gydF4y2Ba,酪氨酸gydF4y2Ba363gydF4y2Ba和低浓缩铀gydF4y2Ba375gydF4y2Ba均为浅橙色。(gydF4y2BacgydF4y2Ba和gydF4y2BafgydF4y2Ba载脂蛋白的催化口袋gydF4y2BaZm评选gydF4y2BaDRIK1-KD (PDB: 6 cpy)。低浓缩铀gydF4y2Ba240gydF4y2Ba;酪氨酸gydF4y2Ba363gydF4y2Ba和低浓缩铀gydF4y2Ba375gydF4y2Ba以棒状显示,这些氨基酸的表面分别是绿色、蓝色和红色。(gydF4y2BadgydF4y2Ba和gydF4y2BaggydF4y2Ba) CARK1催化口袋与AMP-PNP共晶(PDB: 5XD6)。AMP-PNP用木棍表示,原子的颜色如下:碳绿色;氮-蓝色;氧-红色;磷酸-橙色。(gydF4y2BaegydF4y2Ba和gydF4y2BahgydF4y2Ba重叠的gydF4y2BaZm评选gydF4y2BaDRIK1 ATP结合位点与ampp - pnp来自CARK1结构。蛋白质分子表面为白色,透明度为50%gydF4y2Ba

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