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表2 mRNA样本D和C比较后,RNA-seq数据中下调和上调基因中最丰富的10个转录本

来自:低糖生物碱含量马铃薯种间杂交种植物毒活性的转录和蛋白质组学研究

基因名字 轨迹 log2 FC一个 罗斯福
p价值b
差异度
花青素5-aromatic acyltransferase-like LOC102605147 9.45 9.20 e-14
枯草菌素样蛋白酶SBT1.7,转录变体X2 LOC102596363 9.19 9.51 e-13
推测为无特征蛋白YER190C-A LOC107057927 8.24 5.49平台以及
可能的抗病蛋白At1g61310,转录变体X1 LOC102600040 6.68 7.34 e-06
1-Aminocyclopropane-1-carboxylate氧化酶五喜欢 LOC102589195 6.67 1.66 e-06
Trans-resveratrol di-O-methyltransferase-like LOC107057698 6.65 1.61 e-06
但一个个LOC102590955 LOC102590955 6.58 1.09 e-05
双组分响应调节器ARR2 LOC102596771 6.51 1.90 e-05
但一个个LOC107058900 LOC107058900 6.48 1.65 e-05
Miraculin-like LOC102589829 6.27 6.09 e-05
衰减度
碳酸酐酶,chloroplastic-like LOC102589374 −9.94 3.32 e-20
Miraculin-like LOC107061746 −9.28 3.78 e-13
类大麻二酚酸合酶2 LOC102604287 −9.17 1.02 e-12
21 kDa蛋白质像 LOC102592643 −9.00 2.55 e-12
推测为UPF0481蛋白At3g02645 LOC102605914 −9.00 3.09 e-12
过氧化物酶16 LOC102581043 −8.40 1.77平台以及
蛋白质解毒29-like LOC102581213 −8.39 8.42 e-42
类金属硫蛋白2型 LOC102589950 −8.32 3.98平台以及
非特异性脂转移蛋白1样 LOC102599380 −8.22 5.72平台以及
苏氨酸脱水酶生物合成,类叶绿体 LOC102583664 −8.21 5.59平台以及
  1. 一个Log2估计褶皱变化
  2. b罗斯福调整p价值