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表3结果,SNP基因座具有由关联和RNA-SEQ联合鉴定的根部性状和一致的候选基因

从:转录组和基因组 - 范围的协会研究显示玉米氮缺乏症的长度非编码RNA

基于RNA-SEQ的候选基因C
特征 SNP. CHR. 位置一种 P. 等位基因 R.2(%) 基因B. 参考 注解 折叠变化
叉子 PZE-104010552 4. 7,929,588 5.0×10-5 A / G. 8.9 ZM00001D048998. 穆等人。2017 [21.] 叶绿素A-B结合蛋白CP26 -2.03939.
交叉口 PZE-104092320 4. 167,437,768 4.7×10-5 A / G. 1.8 ZM00001D051804 luo等人。2015 [22.] 谷氨酰胺合成酶根同学4 1.65671.
叉子 PZE-104043052. 4. 61,411,237 6.5×10- 5 A / C. 11. ZM00001D049995. 硝酸还原酶[NADH] -2.39002
交叉口 PZE-104092320 4. 167,437,768 4.7×10-5 A / G. 1.8 ZM00001D051666 Zanin等人。2015 [23.] 中性/碱性转化酶 1.83246
PRL. ZM005894-0463 4. 31,060,531. 5.6×10-5 A / C. 9.9 ZM00001D049380 推定的氨基转移酶超家族蛋白质 0.66934
CRN. PZE-104016717. 4. 16,500,659. 5.2×10-5 A / G. 11. ZM00001D049059 他。2016 [24.] 醇脱氢酶2 0.766936.
提示 PZE-104049074 4. 75,505,829. 5.2×10-5 A / G. 8.7 ZM00001D050195 WRKY DNA结合结构域蛋白质 -0.795948
叉子 PZE-104010552 4. 7,929,588 5.0×10-5 A / G. 8.9 ZM00001D048866 (Z)-3-己酮-1-乙酰转移酶 1.07489.
叉子 PZE-104010552 4. 7,929,588 5.0×10-5 A / G. 8.9 ZM00001D048736 S-烷基 - 硫代脱发裂解酶SUR1 -0.576864
CRN. PZE-105047147. 5. 36,470,371. 6.1×10-5 A / G. 13. ZM00001D014200. 表达蛋白质 0.402627
叉子 PUT-163A-91,875,212-4781 5. 7,724,698 5.9×10-5 A / G. 10. ZM00001D013263 表达蛋白质 1.51149
叉子 PZE-104043052. 4. 61,411,237 6.5×10-5 A / C. 11. ZM00001D050092 张等人。2015 [25.] 推定的淀粉粒酶家庭蛋白质 0.585778
叉子 PZE-104043052. 4. 61,411,237 6.5×10-5 A / C. 11. ZM00001D049990. 推定素/ Anth / VHS蛋白 1.38056
PRL. ZM005894-0463 4. 31,060,531. 5.6×10-5 A / C. 9.9 ZM00001D049554 推定的甘油-3-磷酸转运蛋白1 -0.807844
PRL. ZM005894-0463 4. 31,060,531. 5.6×10-5 A / C. 9.9 ZM00001D049551. 推定的细胞色素p450蛋白 2.50626
PRL. ZM005894-0463 4. 31,060,531. 5.6×10-5 A / C. 9.9 ZM00001D049502 孕产妇效果胚胎被捕60 0.542646
PRL. ZM005894-0463 4. 31,060,531. 5.6×10-5 A / C. 9.9 ZM00001D049464 B盒型锌手指家庭蛋白质 0.980937
PRL. ZM005894-0463 4. 31,060,531. 5.6×10-5 A / C. 9.9 ZM00001D049418. Germin样蛋白质亚家族1成员8 1.11388
PRL. ZM005894-0463 4. 31,060,531. 5.6×10-5 A / C. 9.9 ZM00001D049407. 多酚氧化酶氯塑酶 -0.61096
PRL. ZM005894-0463 4. 31,060,531. 5.6×10-5 A / C. 9.9 ZM00001D049365 甲硫氨酸氨基肽酶 0.319478
CRN. PZE-104016717. 4. 16,500,659. 5.2×10-5 A / G. 11. ZM00001D049187 磷酸糖苷脱氢酶3. -1.54203
CRN. PZE-104016717. 4. 16,500,659. 5.2×10-5 A / G. 11. ZM00001D049158 转录因子BHLH62 1.27949
CRN. PZE-104016717. 4. 16,500,659. 5.2×10-5 A / G. 11. ZM00001D049127 推定的丝氨酸/苏氨酸蛋白 -0.848596.
叉子 PZE-104010552 4. 7,929,588 5.0×10-5 A / G. 8.9 ZM00001D048979. 推定的蔗糖 - 磷酸合酶蛋白 2.06952
叉子 PZE-104010552 4. 7,929,588 5.0×10-5 A / G. 8.9 ZM00001D048925 氢醌葡萄糖瘤转移酶 1.25909.
叉子 PZE-104010552 4. 7,929,588 5.0×10-5 A / G. 8.9 ZM00001D048901 转录因子BHLH47 2.69849
叉子 PZE-104010552 4. 7,929,588 5.0×10-5 A / G. 8.9 ZM00001D048843 Math-BTB9. 1.16984
叉子 PZE-104010552 4. 7,929,588 5.0×10-5 A / G. 8.9 ZM00001D048795 SPR1. 1.27812
叉子 PZE-104010552 4. 7,929,588 5.0×10-5 A / G. 8.9 ZM00001D048709 Benzoxazinles1. -5.53653
叉子 PZE-110109365 10. 148,503,798 4.7×10-5 A / G. 7.5 ZM00001D026605 内葡聚糖酶5. -5.62458
叉子 PZE-110108403. 10. 148,106,661. 5.4×10-5 A / C. 8.9 ZM00001D026603 Mg Chelatase亚单位H 1 0.836012
叉子 PZE-110108403. 10. 148,106,661. 5.4×10-5 A / C. 8.9 ZM00001D026573 甲基硫纤维激酶 -1.75366.
叉子 PZE-110108403. 10. 148,106,661. 5.4×10-5 A / C. 8.9 ZM00001D026542 MYB系列转录因子pH15 -4.47132
CRN. PZE-105047221 5. 36,532,569 5.6×10-5 A / G. 11. ZM00001D014555 酪氨酸硫酸化糖肽受体1 -1.98805.
叉子 PUT-163A-91,875,212-4781 5. 7,724,698 5.9×10-5 A / G. 10. ZM00001D013287 - 0.957732
叉子 PUT-163A-91,875,212-4781 5. 7,724,698 5.9×10-5 A / G. 10. ZM00001D013269 β-葡聚糖酶3. -0.88007
交叉口 PZE-104092320 4. 167,437,768 4.7×10-5 A / G. 1.8 ZM00001D051829 U字箱含域的蛋白质44 0.605786.
交叉口 PZE-104092320 4. 167,437,768 4.7×10-5 A / G. 1.8 ZM00001D051692 aspartyl蛋白酶AED1 0.609318.
交叉口 PZE-104092320 4. 167,437,768 4.7×10-5 A / G. 1.8 ZM00001D051664 2g和Fe(ii) - 依赖超家族蛋白质 0.924731.
交叉口 PZE-104092320 4. 167,437,768 4.7×10-5 A / G. 1.8 ZM00001D051598 植物特异性域TIGR01570蛋白质 1.82658
  1. 一种重要的SNP的物理位置基于玉米B73 Refgen_v3。B.将基因筛选在这些显着相关的SNP标记附近。C通过与RNA-SEQ和先前的研究组合来鉴定候选基因,表达式(日志2(折叠变化))基于美国RNA-SEQ