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基于RNA-SEQ的候选基因C |
|
特征 |
SNP. |
CHR. |
位置一种 |
P. |
等位基因 |
R.2(%) |
基因B. |
参考 |
注解 |
折叠变化 |
叉子 |
PZE-104010552 |
4. |
7,929,588 |
5.0×10-5 |
A / G. |
8.9 |
ZM00001D048998. |
穆等人。2017 [21.] |
叶绿素A-B结合蛋白CP26 |
-2.03939. |
交叉口 |
PZE-104092320 |
4. |
167,437,768 |
4.7×10-5 |
A / G. |
1.8 |
ZM00001D051804 |
luo等人。2015 [22.] |
谷氨酰胺合成酶根同学4 |
1.65671. |
叉子 |
PZE-104043052. |
4. |
61,411,237 |
6.5×10- 5 |
A / C. |
11. |
ZM00001D049995. |
硝酸还原酶[NADH] |
-2.39002 |
交叉口 |
PZE-104092320 |
4. |
167,437,768 |
4.7×10-5 |
A / G. |
1.8 |
ZM00001D051666 |
Zanin等人。2015 [23.] |
中性/碱性转化酶 |
1.83246 |
PRL. |
ZM005894-0463 |
4. |
31,060,531. |
5.6×10-5 |
A / C. |
9.9 |
ZM00001D049380 |
推定的氨基转移酶超家族蛋白质 |
0.66934 |
CRN. |
PZE-104016717. |
4. |
16,500,659. |
5.2×10-5 |
A / G. |
11. |
ZM00001D049059 |
他。2016 [24.] |
醇脱氢酶2 |
0.766936. |
提示 |
PZE-104049074 |
4. |
75,505,829. |
5.2×10-5 |
A / G. |
8.7 |
ZM00001D050195 |
WRKY DNA结合结构域蛋白质 |
-0.795948 |
叉子 |
PZE-104010552 |
4. |
7,929,588 |
5.0×10-5 |
A / G. |
8.9 |
ZM00001D048866 |
(Z)-3-己酮-1-乙酰转移酶 |
1.07489. |
叉子 |
PZE-104010552 |
4. |
7,929,588 |
5.0×10-5 |
A / G. |
8.9 |
ZM00001D048736 |
S-烷基 - 硫代脱发裂解酶SUR1 |
-0.576864 |
CRN. |
PZE-105047147. |
5. |
36,470,371. |
6.1×10-5 |
A / G. |
13. |
ZM00001D014200. |
表达蛋白质 |
0.402627 |
叉子 |
PUT-163A-91,875,212-4781 |
5. |
7,724,698 |
5.9×10-5 |
A / G. |
10. |
ZM00001D013263 |
表达蛋白质 |
1.51149 |
叉子 |
PZE-104043052. |
4. |
61,411,237 |
6.5×10-5 |
A / C. |
11. |
ZM00001D050092 |
张等人。2015 [25.] |
推定的淀粉粒酶家庭蛋白质 |
0.585778 |
叉子 |
PZE-104043052. |
4. |
61,411,237 |
6.5×10-5 |
A / C. |
11. |
ZM00001D049990. |
推定素/ Anth / VHS蛋白 |
1.38056 |
PRL. |
ZM005894-0463 |
4. |
31,060,531. |
5.6×10-5 |
A / C. |
9.9 |
ZM00001D049554 |
推定的甘油-3-磷酸转运蛋白1 |
-0.807844 |
PRL. |
ZM005894-0463 |
4. |
31,060,531. |
5.6×10-5 |
A / C. |
9.9 |
ZM00001D049551. |
推定的细胞色素p450蛋白 |
2.50626 |
PRL. |
ZM005894-0463 |
4. |
31,060,531. |
5.6×10-5 |
A / C. |
9.9 |
ZM00001D049502 |
孕产妇效果胚胎被捕60 |
0.542646 |
PRL. |
ZM005894-0463 |
4. |
31,060,531. |
5.6×10-5 |
A / C. |
9.9 |
ZM00001D049464 |
B盒型锌手指家庭蛋白质 |
0.980937 |
PRL. |
ZM005894-0463 |
4. |
31,060,531. |
5.6×10-5 |
A / C. |
9.9 |
ZM00001D049418. |
Germin样蛋白质亚家族1成员8 |
1.11388 |
PRL. |
ZM005894-0463 |
4. |
31,060,531. |
5.6×10-5 |
A / C. |
9.9 |
ZM00001D049407. |
多酚氧化酶氯塑酶 |
-0.61096 |
PRL. |
ZM005894-0463 |
4. |
31,060,531. |
5.6×10-5 |
A / C. |
9.9 |
ZM00001D049365 |
甲硫氨酸氨基肽酶 |
0.319478 |
CRN. |
PZE-104016717. |
4. |
16,500,659. |
5.2×10-5 |
A / G. |
11. |
ZM00001D049187 |
磷酸糖苷脱氢酶3. |
-1.54203 |
CRN. |
PZE-104016717. |
4. |
16,500,659. |
5.2×10-5 |
A / G. |
11. |
ZM00001D049158 |
转录因子BHLH62 |
1.27949 |
CRN. |
PZE-104016717. |
4. |
16,500,659. |
5.2×10-5 |
A / G. |
11. |
ZM00001D049127 |
推定的丝氨酸/苏氨酸蛋白 |
-0.848596. |
叉子 |
PZE-104010552 |
4. |
7,929,588 |
5.0×10-5 |
A / G. |
8.9 |
ZM00001D048979. |
推定的蔗糖 - 磷酸合酶蛋白 |
2.06952 |
叉子 |
PZE-104010552 |
4. |
7,929,588 |
5.0×10-5 |
A / G. |
8.9 |
ZM00001D048925 |
氢醌葡萄糖瘤转移酶 |
1.25909. |
叉子 |
PZE-104010552 |
4. |
7,929,588 |
5.0×10-5 |
A / G. |
8.9 |
ZM00001D048901 |
转录因子BHLH47 |
2.69849 |
叉子 |
PZE-104010552 |
4. |
7,929,588 |
5.0×10-5 |
A / G. |
8.9 |
ZM00001D048843 |
Math-BTB9. |
1.16984 |
叉子 |
PZE-104010552 |
4. |
7,929,588 |
5.0×10-5 |
A / G. |
8.9 |
ZM00001D048795 |
SPR1. |
1.27812 |
叉子 |
PZE-104010552 |
4. |
7,929,588 |
5.0×10-5 |
A / G. |
8.9 |
ZM00001D048709 |
Benzoxazinles1. |
-5.53653 |
叉子 |
PZE-110109365 |
10. |
148,503,798 |
4.7×10-5 |
A / G. |
7.5 |
ZM00001D026605 |
内葡聚糖酶5. |
-5.62458 |
叉子 |
PZE-110108403. |
10. |
148,106,661. |
5.4×10-5 |
A / C. |
8.9 |
ZM00001D026603 |
Mg Chelatase亚单位H 1 |
0.836012 |
叉子 |
PZE-110108403. |
10. |
148,106,661. |
5.4×10-5 |
A / C. |
8.9 |
ZM00001D026573 |
甲基硫纤维激酶 |
-1.75366. |
叉子 |
PZE-110108403. |
10. |
148,106,661. |
5.4×10-5 |
A / C. |
8.9 |
ZM00001D026542 |
MYB系列转录因子pH15 |
-4.47132 |
CRN. |
PZE-105047221 |
5. |
36,532,569 |
5.6×10-5 |
A / G. |
11. |
ZM00001D014555 |
酪氨酸硫酸化糖肽受体1 |
-1.98805. |
叉子 |
PUT-163A-91,875,212-4781 |
5. |
7,724,698 |
5.9×10-5 |
A / G. |
10. |
ZM00001D013287 |
- |
0.957732 |
叉子 |
PUT-163A-91,875,212-4781 |
5. |
7,724,698 |
5.9×10-5 |
A / G. |
10. |
ZM00001D013269 |
β-葡聚糖酶3. |
-0.88007 |
交叉口 |
PZE-104092320 |
4. |
167,437,768 |
4.7×10-5 |
A / G. |
1.8 |
ZM00001D051829 |
U字箱含域的蛋白质44 |
0.605786. |
交叉口 |
PZE-104092320 |
4. |
167,437,768 |
4.7×10-5 |
A / G. |
1.8 |
ZM00001D051692 |
aspartyl蛋白酶AED1 |
0.609318. |
交叉口 |
PZE-104092320 |
4. |
167,437,768 |
4.7×10-5 |
A / G. |
1.8 |
ZM00001D051664 |
2g和Fe(ii) - 依赖超家族蛋白质 |
0.924731. |
交叉口 |
PZE-104092320 |
4. |
167,437,768 |
4.7×10-5 |
A / G. |
1.8 |
ZM00001D051598 |
植物特异性域TIGR01570蛋白质 |
1.82658 |
- 一种重要的SNP的物理位置基于玉米B73 Refgen_v3。B.将基因筛选在这些显着相关的SNP标记附近。C通过与RNA-SEQ和先前的研究组合来鉴定候选基因,表达式(日志2(折叠变化))基于美国RNA-SEQ