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表2转基因与GNM分析中20个差异最强的基因。显示的是相应转录本的转录名称,|log2foldchange|≥2,该转录本在其中被上调的文库(模式),基于基因名称t . pratense基因组注释,相应的植物群描述,基因名称和物种名称的下一个同源物和答:芥基因名称和基因座名称的基础上可用的信息Tair

来自:转录组分析揭示了红三叶草刈割后再生过程中的主要转录变化(三叶草pratense

ID 模式 叠连群ID | log2foldchange |≥2 类别(分类依据) 基因名字t . pratense 下一个同源基因的名称 下一个同源物种的名称 答:芥基因名字 答:芥轨迹的名字
1 GHNM tdn_99733 −9.5 增长(m . truncatula Tp57577_TGAC_v2_mRNA4544.v2 Medtr4g029550.1 m . truncatula - - - - - - - - - - - -
2 GHNM k41_54584 −6.3 生物压力(拟南芥,拟南芥,拟南芥 Tp57577_TGAC_v2_mRNA28349.v2 Medtr5g073620.1 m . truncatula ATEXO70B1 AT5G58430
3. GHNM tdn_92791 −5.5 非生物和生物压力(拟南芥,拟南芥,拟南芥 Tp57577_TGAC_v2_mRNA20498.v2 Medtr1g041150.1 m . truncatula ATCPK1 AT5G04870
4 GHNM k41_130218 −5.5 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
5 GHNM tdn_53091 −4.8 植物激素(拟南芥,拟南芥 Tp57577_TGAC_v2_mRNA39912.v2 Medtr4g010250.1 m . truncatula - - - - - - AT5G20190
6 GHNM tgg_43136 −4.4 转录(拟南芥,拟南芥 Tp57577_q_v2_mRNA29629.v2 Medtr4g098630.1 m . truncatula ANAC071 AT4G17980
7 GHNM tdn_141837 −4.3 非生物压力(拟南芥,拟南芥,拟南芥 Tp57577_TGAC_v2_mRNA760.v2 Medtr2g022700.1 m . truncatula ATGPT2 AT1G61800
8 GHNM tdn_40997 −4.2 非生物压力(拟南芥,拟南芥,拟南芥 Tp57577_TGAC_v2_mRNA25718.v2 Medtr4g130540.1 m . truncatula HSP70B AT1G16030
9 GHNM k71_5292 −4.1 生物压力(T.pratense, m . truncatula Tp57577_TGAC_v2_mRNA23166.v2 Medtr0163s0020.1 m . truncatula LECRK-IX.1 AT5G10530
10 GHNM k59_6358 −3.9 增长(拟南芥,拟南芥,拟南芥 Tp57577_TGAC_v2_mRNA12337.v2 Medtr3g435430.1 m . truncatula ATEXP15 AT2G03090
11 GHM tdn_86219 8.0 生物压力(拟南芥,拟南芥,拟南芥 Tp57577_TGAC_v2_mRNA29036.v2 Medtr4g066210.1 m . truncatula BGLU12 AT5G42260
12 GHM k23_115785 8.0 非生物压力(拟南芥,拟南芥,拟南芥 Tp57577_TGAC_v2_mRNA22071.v2 Glyma.01G001000.1 g·马克斯 - - - - - - AT5G58110
13 GHM tdn_91159 8.1 生物压力(拟南芥,拟南芥,拟南芥 Tp57577_TGAC_v2_mRNA7745.v2 Medtr4g035870.1 m . truncatula - - - - - - AT5G62360
14 GHM k65_43517 8.3 植物激素(T.pratense, a芥 Tp57577_TGAC_v2_mRNA6281.v2 Medtr1g082750.1 m . truncatula ATAMI1 AT1G08980
15 GHM tgg_18067 8.4 - - - - - - Tp57577_TGAC_v2_mRNA32019.v2 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
16 GHM k61_38813 9.0 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
17 GHM k49_82496 9.0 非生物和生物压力(G. max, A. thaliana Tp57577_TGAC_v2_mRNA37976.v2 Glyma.06G268800.1 g·马克斯 - - - - - - AT4G04790
18 GHM k67_38815 9.1 生物压力(T.pratense Tp57577_TGAC_v2_mRNA41666.v2 Medtr0062s0020.1 m . truncatula - - - - - - - - - - - -
19 GHM k45_11164 9.6 转录(T.pratense Tp57577_TGAC_v2_mRNA29953.v2 Medtr3g092510.1 m . truncatula ATRBP37 AT4G10610
20. GHM tdn_25484 9.6 增长(菜豆 Tp57577_TGAC_v2_mRNA13093.v2 Phvul.006G033800.1 菜豆 - - - - - - - - - - - -