跳转到主要内容

表3 FaM与FaNM分析中20个差异最强的基因。显示的是相应转录本的转录名称,|log2foldchange|≥2,该转录本在其中被上调的文库(模式),基于基因名称t . pratense基因组注释,相应的植物群描述,基因名称和物种名称的下一个同源物和答:芥基因名称和基因座名称的基础上可用的信息Tair

来自:转录组分析揭示了红三叶草刈割后再生过程中的主要转录变化(三叶草pratense

ID 模式 叠连群ID | log2foldchange |≥2 类别(分类依据) 基因名字t . pratense 下一个同系物的名称 下一个同源物种的名称 答:芥基因名字 答:芥轨迹的名字
1 TPNM2 k33_17052 −9,0 生物压力(拟南芥,拟南芥,拟南芥 Tp57577_TGAC_v2_mRNA21474.v2 Medtr4g079440.1 m . truncatula na AT1G06260
2 TPNM2 k43_111792 −8日8 生物压力(m . truncatula Tp57577_TGAC_v2_mRNA26333.v2 Medtr8g101900.1 m . truncatula CCOAOMT7 AT4G26220
3. TPNM2 tdn_34568 −8、6 - - - - - - Tp57577_TGAC_v2_mRNA9104.v2 Glyma.13G061800.1 g·马克斯 - - - - - - AT5G39530
4 TPNM2 tdn_49640 −8、6 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
5 TPNM2 tdn_58745 −8日5 生物压力(拟南芥,拟南芥,拟南芥 Tp57577_TGAC_v2_mRNA20190.v2 Medtr8g075200.1 m . truncatula - - - - - - AT1G75900
6 TPNM2 tdn_47209 −8日5 增长(拟南芥,拟南芥 Tp57577_TGAC_v2_mRNA10703.v2 Medtr1g053315.1 m . truncatula - - - - - - AT1G03390
7 TPNM2 tdn_48478 −8日4 生物压力(拟南芥,拟南芥,拟南芥 Tp57577_TGAC_v2_mRNA19516.v2 Medtr2g099020.1 m . truncatula - - - - - - AT3G59510
8 TPNM2 k41_17597 −8日4 经济增长压力(拟南芥,拟南芥,拟南芥 Tp57577_TGAC_v2_mRNA8526.v2 Medtr1g036490.1 m . truncatula ATCOMT, ATOMT1 AT5G54160
9 TPNM2 k51_82581 2−8日 增长(t . pratense Tp57577_TGAC_v2_mRNA23127.v2 Medtr2g436480.1 m . truncatula KCS21 AT5G49070
10 TPNM2 tdn_82424 1−8日 增长(t . pratense Tp57577_TGAC_v2_mRNA17103.v2 Medtr2g013740.1 m . truncatula KCS10 AT2G26250
11 TPM2 k49_380 7、5 开发(答:芥 Tp57577_TGAC_v2_mRNA37185.v2 SapurV1A.0885 s0040.1 柳树紫竹 DAYSLEEPER AT3G42170
12 TPM2 tdn_49869 7、6 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
13 TPM2 tdn_54983 7、7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
14 TPM2 k37_9029 7、8 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
15 TPM2 k45_6120 8、4 - - - - - - Tp57577_TGAC_v2_mRNA2166.v2 Medtr2g007510.1 m . truncatula - - - - - - - - - - - -
16 TPM2 k71_23808 8、4 开发(拟南芥,拟南芥,拟南芥 Tp57577_TGAC_v2_mRNA14131.v2 Medtr1g021320.1 m . truncatula - - - - - - AT4G33280
17 TPM2 k59_3541 8、4 开发(拟南芥,拟南芥,拟南芥 Tp57577_TGAC_v2_mRNA34193.v2 Medtr4g089030.1 m . truncatula CYP71A26 AT3G48270
18 TPM2 k59_360 8、6 新陈代谢(亚麻粉,马铃薯粉 Tp57577_TGAC_v2_mRNA21875.v2 Lus10012445 亚麻属植物usitatissimum - - - - - - AT1G50020
19 TPM2 k53_38903 9日0 非生物压力(答:芥 Tp57577_TGAC_v2_mRNA37328.v2 Medtr8g063190.1 m . truncatula PRIN2 AT1G10522
20. TPM2 tdn_129978 9日,6 - - - - - - Tp57577_TGAC_v2_mRNA9318.v2 Medtr7g062280.1 m . truncatula - - - - - - AT5G01140