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成熟D1的缺失会导致CP43在体内的组装受损拟南芥蒂利亚纳

抽象的

背景

电极系统II(PSII)是一种高度保守的整体膜多亚基颜料 - 蛋白质复合物。PSII中的蛋白质,颜料,脂质和离子需要精确地组装以确保适当的PSII生物发生。D1是PSII核心反应中心(RC)的主亚基,通常合成为前体D1。D1通过C末端加工蛋白酶CTPA成熟对于PSII组件是必不可少的。然而,到目前为止,还没有明确阐明D1成熟如何影响PSII组件的详细机制。在这项研究中,拟南芥CtpA突变体(atctpa:SALK_056011缺乏D1成熟过程的缺乏D1成熟过程,以研究更多细节在PSII组件上的这种过程的功能。

结果

没有前体D1的c端加工,PSII组装,包括PSII单体、二聚体,特别是PSII超配合物(PSII SCs),如之前报道的那样,很大程度上受到损害。通过BN-2D-SDS PAGE进行Western blotting检测发现,虽然PSII核心蛋白D2、CP43和CP47的组装受到D1成熟过程缺失的影响,但CP43的加入受到的影响最大,这表明CP43在PSII SCs中的组装效率降低最大。此外,与成熟D1和CP43共转化的酵母细胞相比,与pD1和CP43共转化的酵母细胞生长较慢,证实D1 c端尾部的存在,阻碍了D1与CP43的相互作用效率。说明D1成熟过程对PSII组装和生物健康生长的生理重要性。

结论

淘汰赛Arabidopsis atctpa.突变体是研究D1成熟和PSII SCS组件之间意外链接的良好材料。D1成熟的损失主要影响Psii核心蛋白Cp43,内部天线结合蛋白的掺入,其在LHCII复合物的结合期间在PSII SC的形成期间在PSII二聚体中起作用。我们的调查结果提供了D1成熟在高等工厂中PSII SCS组件期间D1成熟的作用的详细支持。

背景

光合作用利用阳光来吸化二氧化碳,生产几乎所有生命都必须的生物量。光合作用的初始步骤是PSII催化的水塑醌氧化氧化氧化。PSII是一种高度保守的整体膜多亚基颜料 - 蛋白质复合物,在蓝藻,藻类和植物中发现。PSII组分包括核心蛋白,低分子量(LMM)蛋白,外部氧化复合物(OEC)蛋白,以及光收获复合物(LHC)蛋白[123.456].为了确保适当的psii生物发生,至少20种不同的亚基蛋白,以及不同的颜料,脂质和离子需要精确地组装[7].PSII在高等植物中的DE Novo组装是流量:首先组装由D1,D2,PSBE,PSBF和PSBI组成的核心“反应中心”(RC)复合物。随后,CP47模块随着内天线蛋白CP47和LMM蛋白的附着而组装,例如PSBH,PSBM,PSBT,PSBR,RC。接下来,随着CP43,OEC蛋白和LMM蛋白如PSBK,PSBW,PSBZ,RC47复合物的后续结合,转化为PSII核心单体。后来,随着PSII单体的二聚化和LHCII的附着,形成PSII-LHCII超复合物[78910.11.12.].

D1蛋白,由叶绿体基因编码PSBA.,是PSII的核心亚基,涉及PSII光局部和修复周期。PSII修复是叶绿体免受过度照明引起的损伤的保护机制。在此过程中,最常损坏的D1劣化并用新副本替换为形成新的RC [13.].虽然小PSBA.基因家族中存在3 ~ 4个基因拷贝,D1蛋白是由单个基因编码的PSBA.塑料中的基因[14.15.].所有光合生物体均以C末端的各种长度延长为前体形式(PD1)作为前体形式(PD1)。D1的成熟形式是Mn的先决条件45簇形成和外部蛋白质与psii的结合[16.].

在RC复合物形成过程中,pD1的c端延伸被c端加工蛋白酶(CtpA)加工,生成成熟的D1。CtpA是一种丝氨酸内肽酶,具有丝氨酸/赖氨酸催化二联体[17.18.19.].在SyneChocystis PCC 6803.在美国,已经发现了三个Ctp同源物(CtpA、CtpB和CtpC),只有CtpA可以裂解pD1的c端延伸。SyneChocystis PCC 6803.缺乏pD1 c端加工的突变体更容易受到光损伤[20.21.].符合SyneChocystis PCC 6803.,三个假定的CtpA同系物(At4g17740, At3g57680, At5g46390)也在拟南芥.损失功能ctpa.导致PSII活性和氧气演化受损[16.22.].D1蛋白的成熟形态缺失,其他PSII核心蛋白的丰度降低Arabidopsis atctpa.缺乏D1成熟过程的突变体[23.].基于分歧,需要进一步探索D1成熟的分子功能。

在本研究中,我们从actpa.null突变体拟南芥蒂利亚纳并更详细地研究了D1成熟在PSII组装过程中的作用。我们的结果表明,成熟D1蛋白的缺失导致PSII SCs的组装受损,这是由RC复合物的异常组装引起的,特别是CP43亚基的异常组装,揭示了D1成熟过程在PSII SCs组装过程中独特而重要的功能。

结果

CTPA的损失导致PD1的积累拟南芥

我们之前的工作表明,PD1蛋白不能在没有CTPA功能的情况下加工成熟的D1蛋白[23.].进一步研究D1成熟过程的生理作用,先前使用的拟南芥本文分别插入突变体atctpa.(AT4G17740,Salk_056011)在我们目前的研究中使用了D1成熟过程。4周龄atctpa.与WT相比,在生长条件下,突变体在生长条件下表现出广泛的缺陷,包括发育不良的生长和黄叶(图。1一种)。接下来,我们确认了D1蛋白的形式atctpa.突变和WT蛋白质印迹。结果表明,只有PD1形式被检测到atctpa.突变体,而WT中存在的D1蛋白是成熟的形式(图。1一种)。所有这些结果与上一份报告一致[23.].基于此,我们认为atctpa.突变体是研究D1成熟在PSII组装中的作用的理想材料拟南芥

图。1
图1

描述的atctpa.突变体。一个wt和atctpa.在16小时光/ 8小时暗循环和20μmol光子的条件下,在1/2 ms培养基上生长3.0%蔗糖4周- 2 s- 1光周期期间的光强度。bD1蛋白的免疫斑分析。从wt和wt中分离蛋白质蛋白质atctpa.突变植物。加载5μg叶绿素并随后用D1抗体免疫。C,DWT和HAKOID膜复合物的蓝色本地凝胶分析(BN-PAGE)atctpa.突变体基于相同的鲜重c和等同的叶绿素(CHL)d.NDH、NADPH脱氢酶复合物;PSII SCs、PSII- lhcii超配合物;PSI-M PSI单体;PSII-D PSII二聚体;PSII-M PSII单体;CF1:腺苷三磷酸酶复杂;LHCII-T LHCII三聚;LHCII-M, LHCII单体

PSII SCS的组装是不成熟D1的异常

D1蛋白的C末端加工对于青霉菌和高等植物中的PSII组装是必不可少的拟南芥17.20.21.23.24.];然而,尚未明确阐明关于PSII组装,特别是在高等植物中的D1成熟过程功能的机制。为了更详细地研究D1成熟功能,通过使用WT和使用WT的蓝色天然凝胶分析检查具有和不具有D1成熟过程的类囊体膜复合物的组装状态。atctpa.突变体,然后进行定量分析。结果表明,除了PSII单体和二聚体存在组装缺陷外,这与之前的研究结果一致[17.20.24.]发现PSII SCS的显着降低atctpa.突变体与WT相比,根据两种分析,基于相等的新鲜称重(图。1c)或相同的叶绿素(图。1d)。

为进一步评估缺乏D1成熟过程的PSII SCs组装缺陷,对蓝色天然凝胶片进行2D SDS- PAGE双向电泳和CBB染色。如图所示,与PSII SCs组装缺陷一致。1c、d, D1 (PsbA)、D2 (PsbD)、CP43 (PsbC)、CP47 (PsbB)在PSII SCs中的组装效率显著降低atctpa.与WT相比的突变体,当基于相等的鲜重进行分析时(图。2a,b)或等同的叶绿素(图。2C,D)。

图2
figure2

类囊体膜复合物的分析atctpa.突变体。a、b2D SDS-PAGE凝胶考马斯蓝染色后,加入同等重量的WT进行BN-PAGE染色一个atctpa.bC,D2D SDS-PAGE凝胶的COOMASSIE蓝色染色跟随加载15μgWT的BN页面catctpa.d.FG.2中的蛋白质鉴定是根据Hou等人。[25.和Fu等[26.].泳道1,psii-scs;泳道2,psi-m,psii-d,psii-m&lhc-t;泳道3,psii-m;Lane 4,LHC组装,PSII核心缺乏CP43;泳道5,LHC-T和泳道6,LHC-M。如图4所示标记的囊体复合物标记。1

为了确认上面观察到的更改,执行了2D-SDS-PAGE之后的免疫印迹。始终如一地,PSII主亚单元的组装效率的变化与图2所示相同。2.作为对照,细胞色素b的组装6/f复合物(Cyt b6/ f),psi和cfocf1根据在等同叶绿素的基础上进行的分析,复杂亚基保持不变(图。3.a,b)。结果是使用在不同温室种植的植物具有相同的生长环境(图S1a, b和Tab。年代1).

图3.
图3

类囊体膜复合物蛋白在野生型和野生型中的组装状态atctpa.突变体。a、bThylakoid蛋白(15μgchl)wt一个atctpa.突变体b用2D BN/SDS-PAGE分离,免疫印迹。分别使用D1、CP43、D2、CP47、LHCII、CytF、b6、PetC、PsaD、ATPα等特异性抗体对相应蛋白进行免疫检测。类囊体复合物的标记如Figs图例所示。12

成熟D1流程损失通过损害CP43组装来扰乱PSII SCS组件

正如我们之前提到的那样,PSII SCS组装是一个良好的组织和顺序过程,涉及精确的蛋白质 - 蛋白质相互作用和许多辅助蛋白的援助[7].为了解PSII核心亚基和缺失pD1 c末端的LHCII蛋白的组装模式,利用ImageJ (https://imagej.nih.gov/ij/) (桌子1).蓝色天然凝胶分析分为六个部分:泳道1,psii scs;泳道2,PSI单体(PSI-M),PSII二聚体(PSII-D)和PSII单体(PSII-M)与LHCII三聚体(LHCII-T)结合;泳道3,psii-m和cyt b6/F;泳道4,LHCII组装,PSII核心缺乏CP43;泳道5,LHCII-T;泳道6,LHCII单体(LHCII-M)。结果,PD1可以几乎不能组装到PSII SC中而没有PD1的C末端加工,并且主要累积在PSII-M和RC47中(分别在PSII-M和RC47中的分布比为49.63和30.42%)(表1).有趣的是,在其他PSII核心蛋白中,仅CP43显示了类似的组装图案作为PD1,而D2和CP47可以在PSII SC中保持一定水平的组件,尽管与WT中的组装效率较低。

表1 WT和WT和HARACHOID膜蛋白的组装模式分析atctpa.检查在无花果。3.

因此,LHCII的组装效率显示出与CP43相似的趋势,PSII SCs的积累较少,并且在LHCII-T中的增加。在PSII de Novo组件期间,D1将D2结合到D2,然后插入CP47以形成RC47复合物。只有在插入CP47之后,CP43可以以正确的方式插入以形成PSII RC复合体[78910.].综上所述,pD1的c端存在主要影响CP43的组装,这导致LHCII蛋白组装形成PSII SCs的效率较低,因为LHCII复合物主要通过天线结合蛋白与PSII二聚体复合物结合,如CP43 [27.].

D1成熟过程的丧失阻碍了D1与酵母 - 两个杂化分析表明的D2和CP43的相互作用

为了确认我们上面提到的假设,我们使用了交配的酵母分裂泛素系统,其可以识别积分(囊体)膜蛋白之间的蛋白质 - 蛋白质相互作用[28.来检测D1与PSII其他核心亚基之间的互作效率是否受c端影响。采用全长成熟D1(氨基酸1-344)和pD1(氨基酸1-353)作为诱饵,全长D2、CP43和CP47作为猎物。结果表明,虽然成熟D1和pD1均可与CP43和D2互作,但D1 / pD1与D2的互作效率低于与CP43的互作效率,说明成熟D1 / pD1与CP43的结合强于与D2的结合(图2)。4一种)。此外,表达成熟D1和CP43 / D2的酵母细胞比表达PD1和CP43 / D2的合成定义的(SD)培养基的CP43 / D2的酵母细胞增长得更快,缺乏TRP,Leu,他和腺嘌呤(SD-TRP Leu His Ade)(无花果。4a),表明PD1的C末端的存在阻碍了D1与CP43 / D2的相互作用。为了鉴定与上述基因的转化酵母细胞中的差异更清楚,我们接下来监测转化的酵母细胞的生长曲线,如图2所示。4B和标签。年代2.实际上,具有PD1的转化酵母细胞的生长速率比用成熟D1转化的转化酵母细胞的生长速率较慢,确认没有D1成熟过程的受影响的相互作用效率。

图4.
装具

PD1的C末端延伸阻碍了D1与酵母双杂化分析中RC复合蛋白的相互作用。一个成熟D1 / pD1与RC复合物蛋白互作的酵母双杂交分析。将表达不同NubG-X (CP43, CP47和D2)结构的D1-Cub或pD1-Cub酵母细胞培养至对数期(OD)600= 0.5),并在SD-TRP-Leu板上发现5μl部分的串联稀释液,并在SD-TRP-Leu-His-Ade板上没有或2mm 3-AT,并在30℃下孵育2天。使用Pds1-NX载体作为阴性对照,NUBI被用作阳性对照。b含有30μg/ mL卡那胺的SD-TRP-Leu-His-Ade液体培养基中培养的酵母菌株的生长曲线。将细胞在30℃下以200rpm生长,用于指定的时间。标签显示统计分析。年代2.不同的字母表示不同的值之间的显着差异。邓肯的多个范围测试,p≤0.05,n = 6

讨论

在蓝杆菌中SyneChocystus 6803.,去除PD1的C末端尾部是锰簇组装的粗遗传术,这对于一个完全官能的PSII复杂是必不可少的[10.17.29.].还指出,D1成熟过程对于将PSII外本蛋白结合到PSII中是必要的[16.].然而,在高等植物中丧失D1成熟过程引起的缺陷并不与上述完全相同。在atctpa.突变体,其D1成熟过程丧失,尽管水氧化锰簇变得具有氧气进化的缺氧减少表明的功能失调,但外蛋白(PSBO,PSBP和PSBQ)的结合不受影响[23.].最明显的变化是PSII SCs组装的减少(图2)。12),在蓝藻中不存在SyneChocystis.PCC 6803 sp。

PSII是一个多亚单元复合体,其装配是一个精确控制的顺序过程。如图所示。5,PD1与PSII引发复合物相互作用,该粘合复合物包含D2以形成PSII最小RC复合物。稍后,招募CP47以形成PSII RC47复合物。然后组装CP43以产生PSII单体,并且PSII二聚体形成为PSII单体的二聚化[7].在血管植物中,PSII主外周天线蛋白形成LHCII三聚体,其通过与PSII核心蛋白的关联以强烈或中等界定的方式借助于次要的LHCII物种(CP24,CP26和CP29)与PSII二聚体结合CP43 / CP47 [24.30.31.].

图5.
figure5

提出了PSII装配过程中pD1 c端加工的功能方案。一个高等植物中的正常psii组件。bPD1的C末端处理的损失导致PSII组件在高等植物中的PSII组件中的CP43稳定/稳定的组装

它指出,PD1可以与D2-CYT B559复合物相互作用以形成D1-D2复合物,而CP47和CP43在PD1的C末端处理之后结合到D1-D2复合物中[12.].始终如一地,我们还发现,D2的有效组装不受PD1的存在影响。但是,CP43的有效组装显然是影响。有趣的是,尽管在CP47的适当组装之后仅发生CP43的插入时,CP47的组装并不多大于D1成熟的影响(图。3.、表1和图.. s1选项卡。年代1).这是可解释的,因为CP47定位于D2,而CP43根据PSII SCS结构定位为D1 [27.32.33.34.].此外,无花果。4与成熟D1和CP43之间的PD1和CP43的较低的相互作用效率进行了比较,与用PD1和CP43共转化的酵母细胞的较慢生长速率表示,与用成熟D1和CP43共转化的酵母细胞的较慢生长速率。总的来说,这些数据表明,没有D1成熟的PSII SCs的有缺陷组装主要由CP43的令人不安的高效组装引起,从而影响随后的PSII SCS组装过程。例如,将LHCII的差异与PSII二聚体的关联(图。3.、表1和图.. s1选项卡。年代1),其与PSII的关联主要涉及内触角蛋白,如高等植物中的CP43 [27.35.].另外,作为PSII缺乏的二次效果,降低了PSI组分和ATPα水平(图。3.).

已经获得了许多信息,关于CP43与PSII RC复合物的结合。两个研究的CP43装配因子是低PSII积累2(LPA2)和低PSII积累3(LPA3)[36.37.].LPA2是一个小的固有类囊体膜蛋白,而LPA3没有跨膜结构域。虽然它们不同源,但它们被鉴定为通过与类囊体膜蛋白Albino 3(一种cpSRP转位酶)的相互作用来协助CP43进入PSII。我们的研究结果表明,pD1的c端加工蛋白酶AtCtpA也在CP43有效融入PSII SCs中发挥重要作用。从当前工作中总结出的D1成熟工艺功能方案如图所示。5: pD1与D2-cyt b559配合物结合形成RC配合物,RC配合物由pD1、D2、PsbE、PsbF和PsbI组成。在RC复合物形成过程中,pD1在其c端被AtCtpA延伸,生成成熟的D1。在D1未成熟的情况下,虽然对内天线蛋白CP47的结合影响不大,但形成的RC47复合物功能失调。接下来,CP43以低得多的组装效率插入到功能失调性RC47复合物中,形成功能失调性单体PSII (PSII [1])。最后,功能失调PSII [1]形成功能障碍二聚体psii(psii [2])。在此过程中,PD1的C-Terminus延伸将改变PD1-RC47复合物的空间构象,其影响CP43的正确组装和随后的其他亚基组装。除此之外,PSII SCS亚基的关联由于PD1的存在而变得松散地变得松散,这导致在洗涤剂存在下的囊膜膜隔离和溶解过程中从PSII SCS的某些亚基的更容易地脱离,这包括减少psii scsatctpa.我们发现的突变体(图。23.4和表格1).

结论

通过使用该细节的更多详细研究PSII SCS组装atctpa.缺乏PD1的C末端加工过程的突变体,我们发现PSII SCS组件中的缺陷由D1成熟的损失引起的主要位于PSII核心蛋白CP43,内部天线结合蛋白的缺乏掺入中PSII SCS形成过程中LHCII复合物与PSII二聚体的关系。我们的发现表示D1成熟过程如何在高等工厂中PSII SCS组装过程中的功能。

方法

植物材料和生长条件

拟南芥(Columbia-0)和T-DNA插入突变株(SALK_056011, locus At4g17740)拟南芥资源中心(哥伦布,哦)。在16小时光/ 8h暗循环的条件下含有3.0%蔗糖(pH5.7)的1/2 ms培养基中的1/2 ms培养基中生长4周,20μmol光子m- 2 s- 1光周期期间的光强度。

蓝色本机PAGE和2D SDS-PAGE

分别从50株野生型和50株野生型中提取叶绿体atctpa.- 植物。如前所述进行蓝色天然凝胶电泳[25.38.].对于2D SDS-PAGE,用剃刀刀片切除蓝色天然凝胶泳道,并在75℃下孵育2×SDS样品缓冲液20分钟,然后在75℃下孵育20分钟。在25°C下20分钟。将具有变性蛋白质的泳道置于12%SDS凝胶的顶部,然后进行第二尺寸分离。

免疫印迹分析

对于免疫印迹,在12%SDS凝胶上分离蛋白质样品并转移到硝化纤维素膜(Biotrace TM Nitrocellulose,Mexico),然后进行Western印迹分析。在用5%牛奶封闭后,随后将膜与针对所指示的蛋白产生的一抗孵育,并使用Super Simply TM West Pico Plus化学发光底物试剂盒(Thermo Scientific,USA)检测。

酵母双杂交测定和生长曲线分析

酵母双杂交试验使用分裂泛素系统(DUAL membrane, Dualsystems Biotech)进行,如前所述[39.40].将成熟氨基酸D1(氨基酸1-344)和pD1(氨基酸1-353)克隆到编码Cub-LexA-VP16片段的pCCW-STE载体中,作为相互作用的诱饵。将CP43、CP47和D2克隆到pDSL-Nx载体(编码NubG片段)中进行检测。酵母菌株NMY32分别与诱饵和猎物结构体共转化。用不含或含2 mM 3-氨基- 1,2,4 -三唑(3-AT)的合成定义(SD)培养基(SD-Trp Leu His Ade, FunGenome)测定酵母细胞在琼脂平板上的相互作用。在600 nM (OD)处测定吸光度,得到液体培养酵母细胞的生长曲线600).每种转化的六种菌落在SD-TRP Leu含有30μg/ ml卡那胺的ADE培养基中培养。od.600在不同的时间点记录值。使用Pds1-NX载体作为阴性对照,NUBI被用作阳性对照。

统计分析

imagej(https://imagej.nih.gov/ij/)来确定PSII亚基在不同亚配合物中的分布比例。

可用性数据和材料

本研究中产生或分析的所有数据都包含在本文及其补充材料中。在当前研究期间使用和/或分析的数据集可从合理的请求上从相应的作者获得。本研究中使用的生物材料可从合理的请求后从相应的作者获得。

缩写

LHCII:

聚光复合物

LHCII-M:

LHC单体

lhcii-t:

LHCII三角形

LMM:

低分子量亚基

描述:

Oxygen-evolving复杂

PSI:

光系统I

psii:

拍照II

psii scs:

Psii超级复合物

psii-d:

psii二聚体

PSII-M:

Psii单体

PSI-M:

PSI单体

RC:

反应中心

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下载参考

致谢

我们感谢Aigen Fu博士在稿件修订中的富有洞察力和贡献。

资金

该工作得到了国家重点研究和发展计划(2016YFD0100604)的支持。资金机构在设计的研究,收集,分析和解释方面没有发挥作用,并撰写稿件。

作者信息

隶属关系

作者

贡献

YFC,SL和XH设计了实验,YFS,YFC,YKW和XH进行了实验,YFS起草了稿件,YFC和XH修订了手稿。所有作者阅读并认可的终稿。

通讯作者

对应到鑫侯

伦理宣言

伦理批准和同意参与

不适用。

同意出版

不适用。

相互竞争的利益

提交人声明他们没有竞争利益。

额外的信息

出版商的注意

施普林格《自然》杂志对已出版的地图和机构附属机构的管辖权要求保持中立。

补充信息

附加文件1:图S1。

类囊体膜复合物蛋白在野生型和野生型中的组装状态atctpa.突变体。(a,b)囊体蛋白(15μgchl)wt(a)和atctpa.突变体(B)通过2D BN / SDS-PAGE分离,并如图所示进一步进行免疫印迹。分别使用D1、CP43、D2、CP47、LHCII、CytF、b6、PetC、PsaD、ATPα等特异性抗体对相应蛋白进行免疫检测。标签。S1。WT和WT和HAPIAL MATHAKOID膜蛋白的组装分析atctpa.如图S1所示。如图S1中检查的主要类囊体膜蛋白的组装分析。通过图像J. - ,未检测到。标签。S2。在图2中检查的生长曲线的统计分析。4湾不同的字母表示不同的值之间的显着差异。邓肯的多个范围测试,p≤0.05,n = 6.标签。S3。本研究中使用的引物。红色字母代表酶的消化遗址。

权利和权限

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史勇,车勇,王勇。等等。成熟D1的缺失会导致CP43在体内的组装受损拟南芥蒂利亚纳BMC植物BIOL.21,106(2021)。https://doi.org/10.1186/s12870-021-02888-9

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关键词

  • 前体D1
  • 拍照II
  • Psii超级复合物
  • 反应中心
  • ctpa.
  • 拟南芥蒂利亚纳