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表2 PINIR中实体及对应表的描述

来自:PINIR: Pin-II型蛋白酶抑制剂的综合信息资源

实体 表名 内容
Pin-IIπ MST_PI_GENERAL_FEATURES 存储Pin-II pi的性质和组成的一般信息,如它的单位登录号,蛋白质名称,生物体,基因名称等
分类 MST_TAXONOMY 存储Pin- II pi所属的生物详细信息。它是从Uniprot数据库捕获的
序列域 DET_SEQUENCE_DOMAINS 获取pi和域的关系。存储关于在PI序列中发现的域的信息
MST_DOMAINS 存储Pin-II PI抑制重复域(IRD)序列信息。它包括IRD序列,Domain Type和RCL和Linker序列
域类型 MST_DOMAIN_TYPE 基于IRD序列中的链接器组织,存储各种域类型:类型1 (H - L型)、类型2 (L - H型)和类型3 (H + L型)
反应循环 MST_REACTIVE_LOOPS 存储关于在域中出现的反应中心循环(活动站点循环)的信息。它包括发现的目标蛋白酶和在P1, P2和P1 '位置的残基
目标蛋白酶 MST_TARGET_PROTEASE 存储Pin-II抑制域的可能靶蛋白酶。它们被分为:胰蛋白酶;胰凝乳蛋白酶;弹性蛋白酶;和未知的
链接器 MST_LINKERS 存储关于Pin-II型PI的两个域之间出现的各种连接器序列的信息。它包括Linker序列和类型
交叉引用 DET_CROSS_REFERENCES 存储与PINIR条目相关的其他数据库的详细信息
域的生化特性 DET_DOMAIN_BIOCHEMICAL_PROPERTIES 捕获IRD的抑制电位
域生物物理属性 DET_DOMAIN_BIOPHYSICAL_PROPERTIES 捕获IRD和蛋白酶的生物物理结合参数
域的二硫键 DET_DOMAIN_DISULFIDE_BONDS 捕获区域中二硫键的发生和位置
Iso-Electric点 DET_ISO-ELECTRIC_POINTS 捕获Pin-II型PI序列的等电点细节,即特定分子不带净电荷的pH值
基因本体论 DET_PI_GENE_ONTOLOGY 存储从GO项目派生的选定术语的列表,它提供Pin-II类型PI的Functional属性
基因本体论类型 MST_GENE_ONTOLOGY_TYPE 存储基因本体论的三大类:细胞成分;生物过程;和分子功能
信号肽 DET_SIGNAL_PEPTIDE 捕获Pin-II型PI序列的定位信号
Spatio时间分布 DET_SPATIO_TEMPORAL_DISTRIBUTION 捕获Pin-II型PI的定位和组织特异性发生
出版 MST_PUBLICATION 该表存储与PINIR条目相关的出版物引用相关的信息
氨基酸组成 DET_AMINO_COMPOSITION 它存储了Pin-II型PI和Domain序列的氨基酸组成信息,包括一个氨基酸在序列中存在的百分比和数量