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表1基因组组装、基因注释和BUSCO验证的总结

来自:对辣椒新生基因组的比较分析揭示了辣椒NLRs的动态种内差异

ECW 科幻小说 CM334一个 Zunla-1b Chiltepinb
脚手架数量 44107年 44731年 37989年 967017年 1973483年
脚手架总长度 2.88 Gb 2.88 Gb 3.03 Gb 3.35 Gb 3.48 Gb
支架的N50 385 kb 418 kb 2.5 Mb 1.23 Mb 446 kb
contigs数量 83882年 87732年 337328年 1102606年 2109725年
contigs的总长度 2.84 Gb 2.84 Gb 2.96 Gb 3.21 Gb 3.30 Gb
N50个contigs 114 kb 110 kb 30 kb 55 kb 52 kb
基因数量 35355年 35158年 35884年 35336年 34476年
平均/总CDS长度 1113 bp / 39 Mb 1174 bp / 41 Mb 1091 bp / 39 Mb 1020 bp / 36 Mb 1006 bp / 35 Mb
平均外显子/内含子长度 240 bp / 874 bp 242 bp / 793 bp 243 bp / 945 bp 239 bp / 716 bp 249 bp / 734 bp
完整BUSCOs的比例 91.2% 92.3% 88.8% 90.6% 84.6%
  1. 一个Kim等人描述的基因组和注释[3.6
  2. b秦等人描述的基因组和注释[4