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表1转录组测序数据分析

来自:桑树抗感反应转录组分析有enterolobii感染

样本 原始读取,n一个 干净读取,n (%)b Q20(99%基本呼叫准确度),%c Q30(99.9%的基本呼叫准确率),%d GC含量,%e
KB0d - 60909044年 60493992例(99.32%) 98.2 94.71 46.43
KB0d - 62997456年 62491878例(99.2%) 98.68 96.05 45.91
KB0d - 66197912年 65647714例(99.17%) 98.5 95.33 46.73
GB0d - 54258632年 53912710例(99.36%) 98.31 94.91 46.89
GB0d - 64601656年 64131504例(99.27%) 98.78 96.17 46.9
GB0d - 63892702年 63436502例(99.29%) 98.83 96.35 47.0
KBjz8d - 59244696年 58881156例(99.39%) 98.33 94.97 47.05
KBjz8d - 60152896年 59777740例(99.38%) 98.22 94.69 47.23
KBjz8d - 57259132年 56906180例(99.38%) 98.31 94.91 47.33
KBck8d - 60755908年 60391936例(99.4%) 98.32 94.92 47.74
KBck8d - 52040558年 51686572例(99.32%) 98.26 94.81 47.29
KBck8d - 64174538年 63719678例(99.29%) 98.27 94.82 47.34
GBjz8d - 68430676年 67917050例(99.25%) 98.22 94.72 47.96
GBjz8d - 63719816年 63292076例(99.33%) 98.26 94.81 47.32
GBjz8d - 61292316年 60748664例(99.11%) 98.22 94.77 46.92
GBck8d - 48996092年 48647074例(99.29%) 98.28 94.88 47.62
GBck8d - 85457146年 84877082例(99.32%) 98.29 94.9 48.08
GBck8d - 63423860年 62959404例(99.27%) 98.16 94.6 46.78
KBjz17d - 81179024年 80436262例(99.09%) 98.2 94.69 47.1
KBjz17d - 64554492年 64163368例(99.39%) 98.33 94.93 47.82
KBjz17d - 50325862年 50006746例(99.37%) 98.32 94.91 47.69
KBck17d - 57315338年 56890984例(99.26%) 98.25 94.83 48.96
KBck17d - 58278390年 57858956例(99.28%) 98.32 95.01 49.78
KBck17d - 60404646年 59916916例(99.19%) 98.85 96.37 48.53
GBjz17d - 60396566年 59987776例(99.32%) 98.4 95.15 47.6
GBjz17d - 73025484年 72582168例(99.39%) 98.33 94.98 47.74
GBjz17d - 72193056年 71733542例(99.36%) 98.2 94.63 47.68
GBck17d - 54270666年 53902126例(99.32%) 98.44 95.29 46.68
GBck17d - 64310188年 63735094例(99.11%) 98.72 96.18 46.82
GBck17d - 55197462年 54697628例(99.09%) 98.69 96.14 47.8
KBjz23d - 59095200年 58691120例(99.32%) 98.31 94.93 47.14
KBjz23d - 79210406年 78762440例(99.43%) 98.33 94.96 47.72
KBjz23d - 61962352年 61612726例(99.44%) 98.41 95.16 47.66
KBck23d - 57595244年 57045606例(99.05%) 98.78 96.32 49.15
KBck23d - 63076062年 62601422例(99.25%) 98.77 96.3 47.09
KBck23d - 63769422年 63342658例(99.33%) 98.83 96.38 47.32
GBjz23d - 64686018年 64110442例(99.11%) 98.24 94.82 47.08
GBjz23d - 69797772年 69378514例(99.4%) 98.32 94.94 48.46
GBjz23d - 47339138年 47004460例(99.29%) 98.22 94.75 49.18
GBck23d - 52537608年 52003500例(98.98%) 98.72 96.21 49.64
GBck23d - 60610656年 60072490例(99.11%) 98.65 95.94 47.82
GBck23d - 63395176年 62774902例(99.02%) 98.71 96.13 48.32
  1. 一个读取原始数据的次数
  2. b过滤后原始读取的高质量序列数(和百分比)
  3. c过滤后准确度≥99%的碱基百分比
  4. d过滤后准确度≥99.9%的碱基百分比
  5. e序列中G/C核苷酸的百分比