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数据库文章

标准

数据库文章应描述一个可能具有广泛效用的新型生物医学数据库。必须易于访问数据库,并且数据库中的数据应归因于源。

描述数据库但也包括在其自己的权益中享受公开的研究的文章,应作为研究制品提交或应分成研究文章和单独的数据库文章。

稿件中描述的数据库必须以保留其匿名性的方式进行审阅者测试。如果已发布,则必须通过任何希望将它们用于非商业目的的研究人员访问所描述的数据库,而无需限制,例如需要重大转移协议。我们可能需要将数据库的归档副本作为保障作为保障措施。

准备你的稿件

以下信息详细介绍了您在稿件中包含的部分标题以及每个部分应在每个部分中的信息。

请注意,您的稿件必须包含一个“声明”部分,包括所有副标题(请参阅下文获取更多信息)。

封面

标题页应该:

  • 提出一个包括,如果合适,学习设计的标题:
    • “A对B的治疗方法:随机对照试验”,“X是Y的危险因素:案例控制研究”,“因子X对主题Y的影响是什么:系统评论”
    • 或用于非临床或非研究研究:文章报告的描述
  • 列出所有作者的全名和机构地址
    • 如果应将协作组列为作者,请将组名列为作者。如果您想要通过其单独的PubMed记录可搜索组的各个成员的名称,请根据下面的说明在“致谢”部分中包含此信息
  • 表示相应的作者

抽象的

摘要不应超过350个单词,应该用背景,摘要的主体和结论的主体构成。请尽量减少使用缩写,并在摘要中没有引用引用。

关键词

表示文章主要内容的三到十个关键字。

背景

背景部分应解释数据库的背景和感知需要,提及先行者和竞争对手,并陈述其潜在价值。

建筑和内容

应在本节中描述数据库模式和实现,以及数据源的信息,数据生成和质量控制的信息。

实用与讨论

这些可能被丢弃为具有短,信息性标题的小节。应描述用户界面,并且应该包括数据库的预期用途以及所设想的好处,以及关于如何与其性能和功能的数据与类似现有数据库的功能进行比较和改进的数据。可以呈现对使用数据库的案例研究。应该提到计划未来的新功能的发展,如果有的话。

结论

这应该清楚地说明主要结论,并包括对该领域的相关性或重要性的解释。

缩略语表

如果在文本中使用缩写,它们应该首先在文本中定义,并且可以提供缩写列表。

宣言

所有稿件必须在标题“声明”下包含以下部分:

  • 伦理批准和同意参与
  • 同意出版物
  • 可用性数据和材料
  • 利益争夺
  • 资金
  • 作者的贡献
  • 致谢
  • 作者的信息(可选)

有关要包含在这些部分中的信息,请参阅下文。

如果任何部分与您的稿件无关,请包括标题并为该部分编写“不适用”。

伦理批准和同意参与

稿件报告涉及人体参与者,人类数据或人类组织的研究必须:

  • 包括关于道德批准和同意的陈述(即使在放弃批准的情况下)
  • 包括批准该研究的伦理委员会的名称,如果合适,委员会的参考编号

涉及动物的研究必须包括关于伦理批准和涉及客户所有动物的实验研究的陈述,提交人还必须包括关于客户或所有者知情同意的声明。

看我们编辑政策了解更多信息。

如果您的稿件未报告或涉及使用任何动物或人类数据或组织,请在本节中说明“不适用”。

同意出版物

如果您的稿件包含任何形式的任何个人数据(包括任何个人细节,图像或视频),则必须从该人或儿童,父母或法定监护人那里获得出版的同意。案例报告的所有介绍必须同意出版。

您可以使用您的机构同意书或我们的同意书如果你更喜欢。您不应该将表格发送给我们,但我们可以要求在任何阶段查看副本(包括发布后)。

看我们编辑政策有关同意发布的更多信息。

如果您的稿件不包含任何个人的数据,请在本节中说明“不适用”。

可用性数据和材料

所有稿件必须包括“数据和材料的可用性”声明。数据可用性陈述应包括有关支持文章中报告的结果的数据的信息,包括在研究期间分析或生成的公开存档数据集的超链接。通过数据,我们的意思是在文章中报告的调查结果上解释,复制和构建的最小数据集。我们认识到并不总是可以公开共享研究数据,例如当个人隐私可能会受到损害,并且在此类实例中,数据可用性仍应在手稿中以及任何用于访问的条件中陈述。

数据可用性语句可以采用以下形式之一(或多个数据集的如果需要多个组合):

  • 在当前研究期间生成和/或分析的数据集可在[name]存储库中获得[持久性Web链接到数据集]
  • 在当前研究期间使用和/或分析的数据集可从合理的请求上从相应的作者获得。
  • 本研究期间生成或分析的所有数据都包含在本发表的文章[及其补充信息文件]中。
  • 在当前研究期间生成和/或分析的数据集未公布到期[数据不是公开的原因]但可从合理的请求上的相应作者获得。
  • 数据共享不适用于本文,因为在当前的研究中没有生成或分析数据集。
  • 支持本研究结果的数据可从[第三方名称]获得,但限制适用于这些数据的可用性,这些数据是根据当前研究的许可使用的,因此不公开。但是,数据在合理的请求和[第三方名称]的许可中获得的数据。
  • 不适用。如果您的稿件不包含任何数据,请在本节中说明“不适用”。

更多的模板数据可用性语句的示例,包括公开可用和受限制的访问数据集的示例,可用这里

BioMed Central还要求作者引用任何公开的数据,其中纸张依赖于稿件的结论。数据引用应包括持久标识符(例如DOI),理想情况下应包括在参考列表中。数据集的引用,当它们出现在参考列表中时,应包括DataCite建议的最低信息并跟随日记风格。包括DOI的数据集标识符应表示为完整的URL。例如:


Hao Z,Aghakouchak A,Nakhjiri N,Farahmand A.全球综合干旱监测和预测系统(GIDMAPS)数据集。娇养。2014年。http://dx.doi.org/10.6084/m9.figshare.853801.

使用数据和材料的可用性中的相应文本:

在当前研究期间和/或分析期间生成的数据集在[name]存储库中可用,[持久网页链接到数据集]。[参考编号]

如果您希望共同提交数据说明,描述您要发布的数据BMC研究说明,您可以通过访问我们来这样做提交门户。数据注释支持打开数据并帮助作者遵守数据共享的资助政策。共同发布的数据说明将与研究文章相关联数据支持(例子)。

利益争夺

必须在本节宣布所有财务和非金融竞争利益。

看我们编辑政策为了充分解释竞争利益。如果您不确定您是否或您的任何一个共同作者都有竞争利益,请联系编辑部。

请使用作者首字母表在本节中提及每个作者的竞争利益。

如果您没有任何竞争利益,请说明“提交人声明他们在本节中没有竞争利益。

资金

应宣布报告的所有研究资金来源。资金机构在研究和撰写数据的设计中的作用以及写作稿件的设计和诠释。

作者的贡献

应在本节中规定作者对稿件的个人贡献。可以在我们的作者中找到作者的指导和标准编辑政策

请使用首字母来参考本节中的每个作者的贡献,例如:“FC分析并解释了关于血液疾病和移植的患者数据。RH进行了肾脏的组织学检查,是写作稿件的主要贡献者。 所有作者阅读并认可的终稿。”

致谢

请承认任何贡献的文章,这些人不符合作者的标准,包括任何提供专业写作服务或材料的人。

作者应获得从致谢部分所述的所有这些承认承认的许可。

看我们编辑政策完整解释致谢和作者标准。

如果您没有任何人承认,请在本节中写下“不适用”。

集团作者(用于涉及协作组的手稿):如果您希望通过其单独的PubMed记录可搜索协作小组的个人成员的名称,请确保协作组的标题包含在标题页上和在提交系统中,还包括合作作者名称作为“确认”部分的最后一段。请在格式的名字,中间名姓名(可选),姓氏中添加作者。如果您愿意,您可以为每个作者添加机构或国家信息,但这应该是所有作者的一致。

请注意,在发布的文章最初包含在Pubmed中,个人名称可能不存在于PubMed记录中,因为它需要PubMed额外的时间来编码此信息。

作者的信息

本节是可选的。

您可以选择使用本节包括有关可能帮助读者对文章解释的作者的任何相关信息,并理解作者的立场。这可能包括关于作者资格的详细信息,他们在机构或社会中持有当前职位,或任何其他相关背景信息。请使用他们的首字母参考作者。注意本部分不应用于描述任何竞争利益。

脚注

脚注可用于提供其他信息,其可以包括引用引用列表中包括的引用。它们不应该仅仅包括参考引文,他们不应该包括参考的书目细节。他们也应该不包含任何数字或表格。

文本的脚注是连续编号的;表格应该由上标小写字母(或显着性值和其他统计数据的星号)表示。标题的脚注或文章的作者没有给出参考符号。

始终使用脚注而不是尾注。


参考

温哥华参考样式的示例如下所示。

看我们编辑政策关于良好引用实践的作者指导

Web链接和URL:所有Web链接和URL(包括向作者自己的网站的链接)都应给出参考编号,并包含在参考列表中而不是在稿件文本中。它们应该完整提供,包括站点的标题和URL,以及访问网站的日期,采用以下格式:鼠标肿瘤生物学数据库。http://tumor.informatics.jax.org/mtbwi/index.do.。2013年5月20日访问。如果作者或作者组可以清楚地与Web链接相关联,例如WebLogs,则应包含在参考中。

示例参考样式:

杂志中的文章

史密斯JJ。科学世界。我是j sci。1999年; 36:234-5。

文章在日记中(无页码)

Rohrmann s,overvad K,Bueno-de-Mesquita Hb,Jakobsen Mu,Egeberg R,TjønnelandA等。肉类消费和死亡率 - 欧洲前瞻性调查对癌症和营养的影响。BMC医学。2013; 11:63。

作者:jeckny的文章

Slifka Mk,Whitton JL。临床影响失调细胞因子生产。挖j mol med。2000;DOI:10.1007 / S801090000086。

杂志补充的文章

Frumin AM,Nussbaum J,Esposito M.功能性Asplenia:骨髓扫描的脾活动示范。血液1979; 59 SP值1:26-32。

书籍章节,或书中的文章

Wyllie啊,Kerr Jfr,Currie Ar。细胞死亡:凋亡的重要性。在:Bourne GH,Danielli JF,Jeon KW,编辑。国际细胞学综述。伦敦:学术;1980. p。251-306。

一系列在线章节(没有卷指定但与DOI)

Saito Y,Hyuga H.速率方程途径扩增对映体过量和手性对称性分布。顶部Curch。2007. DOI:10.1007 / 128_2006_108。

完整的书,撰写

Blenkinsopp A,Paxton P.药房的症状:常见疾病管理指南。3 ed。牛津:Blackwell Science;1998年。

在线文件

DOE J.下属文件的标题。在:物质词典及其效果。皇家化学学会。1999. http://www.rsc.org/dose/title下属文件。1999年1月15日访问。

在线数据库

健康知识库。美国Pharmacopeia,Rockville。1998. http://www.healthwise.org。1998年9月21日获得。

补充材料/私人主页

DOE J.补充材料的标题。2000. http://www.privatehomepage.com。2000年2月22日访问。

大学现场

DOE,J:预印的标题。http://www.uni-heidelberg.de/mydata.html(1999)。获得1999年12月25日。

FTP网站

DOE,J:微不足道的HTTP,RFC2169。ftp://ftp.isi.edu/in-notes/rfc2169.txt(1999)。1999年11月12日访问。

组织网站

Issn International Centre:ISSN寄存器。http://www.issn.org(2006)。2007年2月20日访问。

具有持久标识符的数据集

郑L-y,guo x-s,他b,sun l-j,peng y,dong s-s等人。来自甜味和谷物高粱(高粱双子石)的基因组数据。吉祥物数据库。2011年。http://dx.doi.org/10.5524/100012

数字,表和其他文件

一般格式化指南有关如何格式化数字,表和其他文件的信息。

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